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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G038910
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 10531239-10535310 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2004 bp · TkA05G038910|TK1151|cDNA

AAAGGGATGATAAGATTGATAATCATGCATAAGTGAATGCATGTTATAATGATAGTTGAAGAGTAAAGATTGAACAACTTAATGTTTCAATGTACATATGTTAAAAAACGTTTATACTTTTTATATTTCTAAAGTTTATGTAGAACAACACTAAATCTTAAGATTTGGAACACCAACAACCACAATGAAATGAATAATATATGCCCATGACCGTTGATTTCGTGATCCTATTGAAGCATTTAACCCATGATCCGCCGGCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1047 bp · TkA05G038910|TK1151|CDS

ATGAGCGATGGACAGCGGTTTCAGCTGGGAACGATCGGGGCGTTAGGTCTGTCGGTGGTTTCTTCTGTTTCGATTGTAATTTGCAACAAAGCGCTCATCAGCACCCTCGGTTTTACTTTCGCTACAACATTGACAAGCTGGCATCTTTTAGTCACATTTTGTTCCCTACATGTGGCGTTATGGATGAAATTTTTTGAGCACAAACCTTTTGATCCAAAAGCTGTCATGGGCTTTGGCATATTGAACGGGACCTCAATAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

348 aa · TkA05G038910|TK1151|PROTEIN

MSDGQRFQLGTIGALGLSVVSSVSIVICNKALISTLGFTFATTLTSWHLLVTFCSLHVALWMKFFEHKPFDPKAVMGFGILNGTSIGLLNLSLGFNSVGFYQMTKLAIIPCTVLLETLFFSKQFSKKIRFSLTILLMGVGIATVTDLQLNILGSVLSLLAVITTCIAQIMTNTIQKKYKVSSTQLLYQSCPYQALTLFLIGPFLDALLTNKNVFAFKYTPLVLAFIVLSCLISVSVNFSTFLVIGKTSPVTYQVLGHLKT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G038910
TK1151 IDTkA05G038910
OH-1004 IDLXL04_019298
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G038910
位置Chr05:10531239-10535310 (-)
描述Similar to UXT3: UDP-xylose transporter 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g06890 核苷酸-糖转运蛋白，以严格的反交换模式转运 UDP-木糖和 UMP。
Identification and Characterization of a Golgi-Localized UDP-Xylose Transporter Family from Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1105/tpc.114.133827
At2g30460 核苷酸-糖转运蛋白，在严格的反向交换模式下转运UDP-木糖和UMP。 暂无已核实直接文献
At2g28315 核苷酸-糖转运蛋白，以严格的反交换模式转运 UDP-木糖和 UMP。
Identification and Characterization of a Golgi-Localized UDP-Xylose Transporter Family from Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1105/tpc.114.133827
At1g76670 核苷酸-糖转运蛋白，以严格的反交换模式转运 UDP-鼠李糖或 UDP-半乳糖和 UMP。
Molecular cloning of two Arabidopsis UDP-galactose transporters by complementation of a deficient Chinese hamster ovary cell line.2005 · DOI: 10.1093/glycob/cwh159
At1g21070 核苷酸-糖转运蛋白，可以严格对换方式运输 UDP-鼠李糖或 UDP-半乳糖以及 UMP。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019298 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0015790 UDP-xylose transmembrane transport 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:1900030 regulation of pectin biosynthetic process 生物过程
GO:1904659 D-glucose transmembrane transport 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G06890
ath:AT1G34020
ath:AT2G28315
ath:AT2G30460
ath:AT4G09810
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.670
排名 1 · TkA05G038910 · TK1151
内质网0.188
排名 2 · TkA05G038910 · TK1151
细胞质0.137
排名 3 · TkA05G038910 · TK1151
溶酶体／液泡0.078
排名 4 · TkA05G038910 · TK1151
细胞膜0.055
排名 5 · TkA05G038910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00892EamA10-141 aa
PF04142Nuc_sug_transp20-64 aa
PF03151TPT21-294 aa
PF13567DUF413145-58 aa
PF04142Nuc_sug_transp98-146 aa
PF13567DUF4131111-147 aa
PF13179DUF4006155-184 aa
PF00892EamA158-294 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G038910PF00892EamA101415e-0730.8
TkA05G038910PF04142Nuc_sug_transp20640.01814.9
TkA05G038910PF03151TPT212941.9e-1764.3
TkA05G038910PF13567DUF413145580.2911.6
TkA05G038910PF04142Nuc_sug_transp981460.01814.9
TkA05G038910PF13567DUF41311111470.2911.6
TkA05G038910PF13179DUF40061551840.1412.5
TkA05G038910PF00892EamA1582945e-0730.8
TkA05G038910PF13567DUF41312122120.2911.6
TkA05G038910PF04142Nuc_sug_transp2303050.01814.9
TkA05G038910PF13567DUF41312613140.2911.6
TkA05G038910PF13179DUF40062792910.1412.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RXL8拟南芥sp|Q8RXL8|UXT3_ARATH UDP-xylose transporter 381.800%Swiss-Prot高置信
Q8GUJ1拟南芥sp|Q8GUJ1|UXT2_ARATH UDP-xylose transporter 281.600%Swiss-Prot高置信
F4IHS9拟南芥sp|F4IHS9|UXT1_ARATH UDP-xylose transporter 168.500%Swiss-Prot高置信
Q9SRE4拟南芥sp|Q9SRE4|URGT1_ARATH UDP-rhamnose/UDP-galactose transporter 138.400%Swiss-Prot中等置信
Q9LPU2拟南芥sp|Q9LPU2|URGT2_ARATH UDP-rhamnose/UDP-galactose transporter 237.600%Swiss-Prot中等置信

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