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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G013050
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 3720568-3724278 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3501 bp · TkA05G013050|TK1151|cDNA

TTGATTCTAGAAACAGCATCTAGATACATGGACAACTTAAGGGGCCAATTTTGTAATATCAATCTTTATAATTATCTAAATGCTGAACGACGAATTTGAGAGTCAAACTAATATATTTGCTTTCAAACCTCTGCAACTATCCTTATCCTACATGCCACCACCACCATAACCAACCACCTTCCTCCACCGTGCCGTCAAACCAATATGCCAATACTACCCTTACCTTCTCTCCTCCTCCTCTTTTTCCTCCTACCCTTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

3006 bp · TkA05G013050|TK1151|CDS

ATGCCAATACTACCCTTACCTTCTCTCCTCCTCCTCTTTTTCCTCCTACCCTTTCACGTAATTTCACAATCCACCACCACCCAAAATGACCAAAACATTCTTCTCAACATCAAAAGCTTCTGGTCCAATCCGCCTTCCCTCAACCACTGGAACCAATCCTCCGACCCTTGCAGCTGGCCGGAGATTACATGTACCGGGACCACCATCACCGGCATCACCGTCGTTGATCAGGACATCAGCGGTACTGTTCCACCGTTCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1001 aa · TkA05G013050|TK1151|PROTEIN

MPILPLPSLLLLFFLLPFHVISQSTTTQNDQNILLNIKSFWSNPPSLNHWNQSSDPCSWPEITCTGTTITGITVVDQDISGTVPPFICDLKNLTVLDLNYNDITGNFPAALYNCTNLRYLDLSQNYFVGKIPDDISRLSPELRYLSLFGNNFSGDIPASISRLSKLSSLQLHQTLLNGSFPQEIGYLNDLEELNLSFNKFTPSRLPPSFTQLKRLRKFYMTEANLIGEIPGNFSGMPAMEILDLSFNRLNGSIPRDLFLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G013050
TK1151 IDTkA05G013050
OH-1004 IDLXL04_019040
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G013050
位置Chr05:3720568-3724278 (+)
描述Similar to HSL1: Receptor-like protein kinase HSL1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g28650 参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
At4g28490 具有双重特异性激酶活性作用于丝氨酸/苏氨酸和酪氨酸底物的受体，控制花器官脱落。 暂无已核实直接文献
At5g65710 参与控制花器官脱落的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献
At1g28440 类受体蛋白激酶 HSL1。 暂无已核实直接文献
At1g09970 在病原体相关分子模式 诱导的模式触发免疫 信号传导中发挥作用。
RLK7, a leucine-rich repeat receptor-like kinase, is required for proper germination speed and tolerance to oxidative stress in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1260-4
The secreted peptide PIP1 amplifies immunity through receptor-like kinase 7.2014 · DOI: 10.1371/journal.ppat.1004331

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019040 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0010102 lateral root morphogenesis 生物过程
GO:0010227 floral organ abscission 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0045490 pectin catabolic process 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050829 defense response to Gram-negative bacterium 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0060866 leaf abscission 生物过程
GO:0140547 acquisition of seed longevity 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G28440
ath:AT4G28490
ath:AT5G65710
gmx:732661
mtr:11439632
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.884
排名 1 · TkA05G013050 · TK1151
内质网0.077
排名 2 · TkA05G013050 · TK1151
细胞质0.060
排名 3 · TkA05G013050 · TK1151
细胞核0.037
排名 4 · TkA05G013050 · TK1151
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · TkA05G013050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09716ETRAMP9-32 aa
PF08263LRRNT_229-65 aa
PF23598LRR_1473-219 aa
PF25013LRR_Zer-185-101 aa
PF13855LRR_889-126 aa
PF29252LRR_NLRC489-127 aa
PF12799LRR_491-132 aa
PF13516LRR_691-105 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G013050PF09716ETRAMP9320.02615.2
TkA05G013050PF08263LRRNT_229652.3e-0731.7
TkA05G013050PF23598LRR_14732192.9e-2692.8
TkA05G013050PF25013LRR_Zer-1851018.1e-0626.7
TkA05G013050PF13855LRR_8891267.9e-37125.6
TkA05G013050PF29252LRR_NLRC4891270.01815.0
TkA05G013050PF12799LRR_4911326.7e-31106.3
TkA05G013050PF13516LRR_6911052.7e-0937.1
TkA05G013050PF00560LRR_1921143.7e-49154.8
TkA05G013050PF24758LRR_At5g56370921724.5e-0523.9
TkA05G013050PF29247LRR_MHP1-HER1-GIP3981261.09.2
TkA05G013050PF25013LRR_Zer-11111908.1e-0626.7
TkA05G013050PF13516LRR_61131252.7e-0937.1
TkA05G013050PF29594LRR_SKP21152030.0002521.1
TkA05G013050PF00560LRR_11161383.7e-49154.8
TkA05G013050PF13855LRR_81402007.9e-37125.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M0G7拟南芥sp|Q9M0G7|MIK1_ARATH MDIS1-interacting receptor like kinase 142.800%Swiss-Prot低置信
P47735拟南芥sp|P47735|RLK5_ARATH Receptor-like protein kinase 542.600%Swiss-Prot低置信
C0LGX3拟南芥sp|C0LGX3|HSL2_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase HSL240.200%Swiss-Prot低置信
Q9SGP2拟南芥sp|Q9SGP2|HSL1_ARATH Receptor-like protein kinase HSL140.100%Swiss-Prot低置信
F4I2N7拟南芥sp|F4I2N7|RLK7_ARATH Receptor-like protein kinase 740.800%Swiss-Prot低置信

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