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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G007310
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 2159886-2162988 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2350 bp · TkA05G007310|TK1151|cDNA

CCACCGTATTTTGTTCCAACCTGTTCTCCAATCTCACATGTATAATCTCCATCTTAATTCTTCAAACCCCTCAAATTTAATCCATTTTTTCCTCCCAATCACAGGAGAAATTCTCGCCGATATTACAAATCTAACGCCGTCTTTTTCTACATACTCTTTTCAAGATTTGTATAACGTGAGCACCGCCACCAGTAAGGAATATTGATTATGTCTTCTCCACCGCCGGGAGCTTCTCCGGCACCCACAACCCCAGCTACACC...

CDS

下载 CDS FASTA

2037 bp · TkA05G007310|TK1151|CDS

ATGTCTTCTCCACCGCCGGGAGCTTCTCCGGCACCCACAACCCCAGCTACACCACCGCCCACTAACACCACTTCACCACCACCCGCTGCTTCTGCCCCACCTCCATCTACCCCTGCTTCTCCTCCACCCCCGACAACTCCTGTCTCTCCGCCTCCAGCTCCAACGCCACCAACCCCCGTCGCCCCAGTCACCCCTGTCGCTTCTCCCCCGCCTCCGGTTACTCCACCTCCCACCACTTCCCCTGCACCACCCACAGCCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

678 aa · TkA05G007310|TK1151|PROTEIN

MSSPPPGASPAPTTPATPPPTNTTSPPPAASAPPPSTPASPPPPTTPVSPPPAPTPPTPVAPVTPVASPPPPVTPPPTTSPAPPTATSPPPSTPTPTTPSPSPPSPPSPPGSTPSNRPPPAPRNSPPTTPGQTTPSPPPPRSVSSSPPAAPSSDNSSGISTGAVVGIAIGGVLLLAIFSILFICCKKKKRRTHDPAGFYVPPPPPPKVDPFGNHPQQWQHNAPPPGDHVVMMPPLKPPPMGTRPSQSPARSPSPQPPQRP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G007310
TK1151 IDTkA05G007310
OH-1004 IDLXL04_018983
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G007310
位置Chr05:2159886-2162988 (-)
描述Similar to PERK1: Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g24550 富脯氨酸受体样蛋白激酶 PERK1。 暂无已核实直接文献
At2g18470 在脱落酸（ABA）介导的Ca²⁺通道激活过程中必需。
Plasma membrane-associated proline-rich extensin-like receptor kinase 4, a novel regulator of Ca signalling, is required for abscisic acid responses in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03956.x
Arabidopsis proline-rich extensin-like receptor kinase 4 modulates the early event toward abscisic acid response in root tip growth.2009 · DOI: 10.4161/psb.4.11.9739
At3g24400 富脯氨酸受体样蛋白激酶 PERK2。 暂无已核实直接文献
At4g34440 蛋白激酶 PERK5，富含脯氨酸的受体样蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g49270 富脯氨酸受体样蛋白激酶PERK7。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018983 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G52290
ath:AT2G18470
ath:AT3G24550
ath:AT4G34440
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.862
排名 1 · TkA05G007310 · TK1151
细胞质0.110
排名 2 · TkA05G007310 · TK1151
细胞核0.098
排名 3 · TkA05G007310 · TK1151
内质网0.058
排名 4 · TkA05G007310 · TK1151
高尔基体0.018
排名 5 · TkA05G007310 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03302VSP152-184 aa
PF04478Mid2154-190 aa
PF02439Adeno_E3_CR2163-192 aa
PF29364TED6164-191 aa
PF12104Tcell_CD4_C170-192 aa
PF00069Pkinase310-511 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr312-581 aa
PF03109ABC1315-340 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G007310PF03302VSP1521840.4410.1
TkA05G007310PF04478Mid21541900.2212.0
TkA05G007310PF02439Adeno_E3_CR21631920.01415.9
TkA05G007310PF29364TED61641910.1512.7
TkA05G007310PF12104Tcell_CD4_C1701920.6410.9
TkA05G007310PF00069Pkinase3105115.9e-42144.6
TkA05G007310PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3125816e-46157.6
TkA05G007310PF03109ABC13153400.0009219.1
TkA05G007310PF17667Pkinase_fungal4134770.07612.4
TkA05G007310PF03109ABC14184560.0009219.1
TkA05G007310PF12104Tcell_CD4_C5595810.6410.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LV48拟南芥sp|Q9LV48|PERK1_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK177.200%Swiss-Prot中等置信
Q9ZNQ8拟南芥sp|Q9ZNQ8|PERK4_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK475.600%Swiss-Prot中等置信
Q9LK03拟南芥sp|Q9LK03|PERK2_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK266.000%Swiss-Prot中等置信
Q8GX23拟南芥sp|Q8GX23|PERK5_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK569.100%Swiss-Prot中等置信
Q9XI96拟南芥sp|Q9XI96|PERK7_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK765.800%Swiss-Prot中等置信

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