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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G500420
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 126354245-126357590 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1692 bp · TkA04G500420|TK1151|cDNA

ATGCTATCAAGTCTAGCTGGCAAAATCTACCACCTGATTTGGAGCGGGTCGGATCCCTGTGGAAGTATTTGGGAAGGGATTAAATGTACAAACTCACGTGTAACCTCCTTAGTGGTGGCAGGCATGGGGGTGAGAACTAACAGCATTGGAGACATTCCATCACTTTCCCAGTTGGAATATTTAGATCTTTCTAACAACAAAGGGATCAAAGCCCCTCTTCCACCAACAATTCAGAATTTGAAGAACTTGACAACATTAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1692 bp · TkA04G500420|TK1151|CDS

ATGCTATCAAGTCTAGCTGGCAAAATCTACCACCTGATTTGGAGCGGGTCGGATCCCTGTGGAAGTATTTGGGAAGGGATTAAATGTACAAACTCACGTGTAACCTCCTTAGTGGTGGCAGGCATGGGGGTGAGAACTAACAGCATTGGAGACATTCCATCACTTTCCCAGTTGGAATATTTAGATCTTTCTAACAACAAAGGGATCAAAGCCCCTCTTCCACCAACAATTCAGAATTTGAAGAACTTGACAACATTAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

563 aa · TkA04G500420|TK1151|PROTEIN

MLSSLAGKIYHLIWSGSDPCGSIWEGIKCTNSRVTSLVVAGMGVRTNSIGDIPSLSQLEYLDLSNNKGIKAPLPPTIQNLKNLTTLILVGCNFFGPIPDSIGSLEKLVFLGLNHNSFTGTIPRSIGKLANLTWLDITDNQLFGRIPVSNGTDPGLDMLVNTKHFHFANNQLSGLIPYRLFSSSMTLIHVLFNNNQLSGKIPSSIGLVDTLEAIRLDSNSLDGDLHRNITNLKSVSEFYLANNNLSGPIPDLIGMNSLYYV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G500420
TK1151 IDTkA04G500420
OH-1004 IDLXL04_039047
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.092 / OH-1004 57.068
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G500420
位置Chr04:126354245-126357590 (-)
描述Similar to At5g49770: Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g49760 富含亮氨酸的重复受体蛋白激酶，充当细胞外过氧化氢的传感器。
Hydrogen peroxide sensor HPCA1 is an LRR receptor kinase in Arabidopsis.2020 · DOI: 10.1038/s41586-020-2032-3
At5g49770 可能的富含亮氨酸重复受体样蛋白激酶 At5g49770。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_039047 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009593 detection of chemical stimulus 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004675 transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G06840
ath:AT5G37450
ath:AT5G49760
ath:AT5G49770
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.643
排名 1 · TkA04G500420 · TK1151
细胞质0.125
排名 2 · TkA04G500420 · TK1151
内质网0.101
排名 3 · TkA04G500420 · TK1151
细胞外0.096
排名 4 · TkA04G500420 · TK1151
溶酶体／液泡0.081
排名 5 · TkA04G500420 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25013LRR_Zer-131-80 aa
PF23598LRR_1444-137 aa
PF12799LRR_447-67 aa
PF24758LRR_At5g5637053-116 aa
PF13855LRR_854-92 aa
PF25013LRR_Zer-154-142 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL2156-113 aa
PF00560LRR_157-80 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G500420PF25013LRR_Zer-131800.0001922.3
TkA04G500420PF23598LRR_14441378.6e-1451.8
TkA04G500420PF12799LRR_447672e-1144.4
TkA04G500420PF24758LRR_At5g56370531160.008516.5
TkA04G500420PF13855LRR_854921.7e-1144.4
TkA04G500420PF25013LRR_Zer-1541420.0001922.3
TkA04G500420PF25019LRR_R13L1-DRL21561130.00517.5
TkA04G500420PF00560LRR_157801.3e-1863.8
TkA04G500420PF12799LRR_457982e-1144.4
TkA04G500420PF00560LRR_1821041.3e-1863.8
TkA04G500420PF13855LRR_8821411.7e-1144.4
TkA04G500420PF00560LRR_11061281.3e-1863.8
TkA04G500420PF12799LRR_41061412e-1144.4
TkA04G500420PF00560LRR_11301471.3e-1863.8
TkA04G500420PF13855LRR_81591771.7e-1144.4
TkA04G500420PF00560LRR_11611781.3e-1863.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GZ99拟南芥sp|Q8GZ99|HPCA1_ARATH Leucine-rich repeat receptor protein kinase HPCA147.900%Swiss-Prot中等置信
Q9LT96拟南芥sp|Q9LT96|Y5977_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g4977040.600%Swiss-Prot中等置信

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