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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G498030
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 125801507-125803633 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1306 bp · TkA04G498030|TK1151|cDNA

GTGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTTTGTGTAGTTTCATAATTTCTTCATAATCAAATCAGTTAACTTCGTGTAATTCCATCTGCAAAAAGTCAATTTTGGATCCAATCCTTGGTCTTCGTCAAGTCATCTTTTCTCCCTTGTGTTGATCTACTCATGTCGTATCTGCTTTAGCAGCAATCGGCGAGAAAGAATGGTTTTTCTATGTGCCAAGAGACAAGAAGTACCGTAATGGGGATAGACCTAACCGTGTGACCACTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1152 bp · TkA04G498030|TK1151|CDS

ATGACAATAGAAGCAAGGACCATGAACCAAGAAGAAGAGATAAGAGGCAAGAAGCAGCAAGAAGACGAGGGTGATGATGATCATGAAAACGACATGGTGATGCCAGGGTTTCGTTTTCATCCAACGGAGGAAGAGCTTGTGGAGTTCTACCTTCGCCGTAAGGTAGAGGGCAAGAAATTCAATGTTGAGCTCATCACTTTTCTTGATCTATATCGATACGATCCGTGGGAACTCCCTGCTTTAGCAGCAATCGGCGAGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

383 aa · TkA04G498030|TK1151|PROTEIN

MTIEARTMNQEEEIRGKKQQEDEGDDDHENDMVMPGFRFHPTEEELVEFYLRRKVEGKKFNVELITFLDLYRYDPWELPALAAIGEKEWFFYVPRDKKYRNGDRPNRVTTSGYWKATGADRMIKTDTASRSIGLKKTLVFYSGKAPKGIRSSWIMNEFRLPQHETERLQKAEISLCKVYKRSGVVDDHPSLPRSLQTRSTSSRASNYHNNQSSSSNFTYFEGQSSHHSSDEKLSDTVTGGSTADNIVGTALGLSNPINSS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G498030
TK1151 IDTkA04G498030
OH-1004 IDLXL04_028733
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)60.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 92.689 / OH-1004 91.667
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G498030
位置Chr04:125801507-125803633 (-)
描述Similar to NAC035: NAC domain-containing protein 35
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g02450 作为开花抑制因子的转录因子。
Control of flowering time and cold response by a NAC-domain protein in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1371/journal.pone.0000642
At5g39820 推测 NAC 域含蛋白 94。 暂无已核实直接文献
At1g26870 促进根帽周向细胞分裂。 暂无已核实直接文献
At1g34180 通过受调控的膜内蛋白水解（RIP）活化的转录激活因子（根据相似性）。
Mutation of the Arabidopsis NAC016 transcription factor delays leaf senescence.2013 · DOI: 10.1093/pcp/pct113
At3g15170 STM 和 KNAT6 转录激活剂。
Shoot apical meristem and cotyledon formation during Arabidopsis embryogenesis: interaction among the CUP-SHAPED COTYLEDON and SHOOT MERISTEMLESS genes.1999 · DOI: 10.1242/dev.126.8.1563
Involvement of CUP-SHAPED COTYLEDON genes in gynoecium and ovule development in Arabidopsis thaliana.2000 · DOI: 10.1093/pcp/41.1.60
The CUP-SHAPED COTYLEDON1 gene of Arabidopsis regulates shoot apical meristem formation.2001 · DOI: 10.1242/dev.128.7.1127
Roles of PIN-FORMED1 and MONOPTEROS in pattern formation of the apical region of the Arabidopsis embryo.2002 · DOI: 10.1242/dev.129.17.3965
Developmental events and shoot apical meristem gene expression patterns during shoot development in Arabidopsis thaliana.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01479.x
The CUP-SHAPED COTYLEDON genes promote adventitious shoot formation on calli.2003 · DOI: 10.1093/pcp/pcg038
Dominant repression of target genes by chimeric repressors that include the EAR motif, a repression domain, in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01759.x
CUC1 gene activates the expression of SAM-related genes to induce adventitious shoot formation.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01911.x
MicroRNA regulation of NAC-domain targets is required for proper formation and separation of adjacent embryonic, vegetative, and floral organs.2004 · DOI: 10.1016/j.cub.2004.06.022
MicroRNA regulation of the CUC genes is required for boundary size control in Arabidopsis meristems.2004 · DOI: 10.1242/dev.01320
The early extra petals1 mutant uncovers a role for microRNA miR164c in regulating petal number in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1016/j.cub.2005.02.017
KNAT6: an Arabidopsis homeobox gene involved in meristem activity and organ separation.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.041988
Arabidopsis CUP-SHAPED COTYLEDON3 regulates postembryonic shoot meristem and organ boundary formation.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.045716
Redundancy and specialization among plant microRNAs: role of the MIR164 family in developmental robustness.2007 · DOI: 10.1242/dev.02817
Genes involved in organ separation in Arabidopsis: an analysis of the cup-shaped cotyledon mutant.1997 · DOI: 10.1105/tpc.9.6.841

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0133000 转录激活因子，结合序列特异性DNA基序。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028733 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0045770 positive regulation of asymmetric cell division 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048103 somatic stem cell division 生物过程
GO:0048829 root cap development 生物过程
GO:0099402 plant organ development 生物过程
GO:1901002 positive regulation of response to salt stress 生物过程
GO:1902584 positive regulation of response to water deprivation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G26870
ath:AT2G02450
ath:AT5G39820
dosa:Os03g0133000
gmx:732555
osa:4331520
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.918
排名 1 · TkA04G498030 · TK1151
细胞质0.130
排名 2 · TkA04G498030 · TK1151
细胞膜0.054
排名 3 · TkA04G498030 · TK1151
内质网0.040
排名 4 · TkA04G498030 · TK1151
质体0.017
排名 5 · TkA04G498030 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02365NAM35-160 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G498030PF02365NAM351601.6e-44152.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZVP8拟南芥sp|Q9ZVP8|NAC35_ARATH NAC domain-containing protein 3585.000%Swiss-Prot低置信
Q9FIW5拟南芥sp|Q9FIW5|NAC94_ARATH Putative NAC domain-containing protein 9449.500%Swiss-Prot低置信
Q9ZVH0拟南芥sp|Q9ZVH0|FEZ_ARATH Protein FEZ47.500%Swiss-Prot低置信
A4FVP6拟南芥sp|A4FVP6|NAC16_ARATH NAC domain-containing protein 1650.900%Swiss-Prot低置信
Q9FRV4拟南芥sp|Q9FRV4|NAC54_ARATH Protein CUP-SHAPED COTYLEDON 145.200%Swiss-Prot低置信
Q10S65水稻sp|Q10S65|NAC22_ORYSJ NAC domain-containing protein 2255.200%Swiss-Prot低置信

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