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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G471850
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 119179399-119182022 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1309 bp · TkA04G471850|TK1151|cDNA

AATTCCGAGCAAAAACAAACTCAGTCACCGAGTTCTAACAAGAGAAGGCGAAAAAACATGGCGAGATCGTCGATCCATTTCACGTTAGCAACTGTAGCTCTGTTCTTAGTCTCTTCAGCCGTCGCCGAATACCTGACATTGACACAAGATAACTTCGAGAAGGAGGTCGGTCAAGATCGCGACGCTCTCGTGGAGTTCTACGCTCCCTGGTGTGGGTACTGCAAAAAGATCGCACCTGAATATGAAAGACTTGGTAATGG...

CDS

下载 CDS FASTA

657 bp · TkA04G471850|TK1151|CDS

ATGGCGAGATCGTCGATCCATTTCACGTTAGCAACTGTAGCTCTGTTCTTAGTCTCTTCAGCCGTCGCCGAATACCTGACATTGACACAAGATAACTTCGAGAAGGAGGTCGGTCAAGATCGCGACGCTCTCGTGGAGTTCTACGCTCCCTGGTGTGGGTACTGCAAAAAGATCGCACCTGAATATGAAAGACTTGGTAATGGCTTCAAGAAGGCAAAATCCGTATTAATTGGAAAGGTGGATTGTGATGAAGATAAGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

218 aa · TkA04G471850|TK1151|PROTEIN

MARSSIHFTLATVALFLVSSAVAEYLTLTQDNFEKEVGQDRDALVEFYAPWCGYCKKIAPEYERLGNGFKKAKSVLIGKVDCDEDKDICTKYEVTGYPTFKWFPKGSLEPKKYDGERTADKFADFVNSQAGTYVKVSAVGSNVVSLTSENFNKIVMDNTKHVLVEFSAPWCGHCQNLAPIYESLGDAFKNEADVVIANVNTDNNKKIAERYEVQGIPN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G471850
TK1151 IDTkA04G471850
OH-1004 IDLXL04_038862
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.541 / OH-1004 60.615
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G471850
位置Chr04:119179399-119182022 (+)
描述Similar to Probable protein disulfide-isomerase A6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g47470 适当的花粉发育、胚珠受精和胚胎发育可能需要的蛋白质二硫键异构酶。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0156300 作为蛋白质折叠催化剂，与新生多肽相互作用，催化二硫键的形成、异构化以及还原或氧化。 暂无已核实直接文献
Os01g0339900 作为蛋白质折叠催化剂，与新生多肽相互作用，催化二硫键的形成、异构化以及还原或氧化。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038862 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009567 double fertilization forming a zygote and endosperm 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0034976 response to endoplasmic reticulum stress 生物过程
GO:0048868 pollen tube development 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005788 endoplasmic reticulum lumen 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G47470
dosa:Os01g0339900
dosa:Os05g0156300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.785
排名 1 · TkA04G471850 · TK1151
细胞质0.149
排名 2 · TkA04G471850 · TK1151
溶酶体／液泡0.125
排名 3 · TkA04G471850 · TK1151
高尔基体0.082
排名 4 · TkA04G471850 · TK1151
细胞外0.076
排名 5 · TkA04G471850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26959Thioredoxin-like_N22-64 aa
PF00085Thioredoxin26-127 aa
PF20207PedC-like27-112 aa
PF07912ERp29_N27-134 aa
PF00715IL229-58 aa
PF13098Thioredoxin_238-127 aa
PF13899Thioredoxin_739-58 aa
PF26981Thioredoxin-like_PDI39-58 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G471850PF26959Thioredoxin-like_N22640.003517.9
TkA04G471850PF00085Thioredoxin261275.3e-58194.1
TkA04G471850PF20207PedC-like271126.4e-0833.3
TkA04G471850PF07912ERp29_N271340.0003821.3
TkA04G471850PF00715IL229580.1812.5
TkA04G471850PF13098Thioredoxin_2381274.2e-1040.7
TkA04G471850PF13899Thioredoxin_739587.1e-0730.0
TkA04G471850PF26981Thioredoxin-like_PDI39584.6e-0627.3
TkA04G471850PF08534Redoxin39745.2e-0627.0
TkA04G471850PF00578AhpC-TSA40864.6e-0937.0
TkA04G471850PF13728TraF40660.001219.5
TkA04G471850PF14595Thioredoxin_944660.0006920.2
TkA04G471850PF13905Thioredoxin_845893.4e-0834.5
TkA04G471850PF00462Glutaredoxin49580.03615.0
TkA04G471850PF26298MurL_epimerase_C49820.09213.6
TkA04G471850PF05768Glrx-like50930.06814.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O22263拟南芥sp|O22263|PDI21_ARATH Protein disulfide-isomerase like 2-161.300%Swiss-Prot高置信
Q75M08水稻sp|Q75M08|PDI21_ORYSJ Protein disulfide isomerase-like 2-164.700%Swiss-Prot高置信
Q942L2水稻sp|Q942L2|PDI22_ORYSJ Protein disulfide isomerase-like 2-261.900%Swiss-Prot高置信

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