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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G470090
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 118714703-118715893 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1191 bp · TkA04G470090|TK1151|cDNA

ATGTTGGAAGAGATGATTGATGCAAGCTATTACATTCCACCGGAGCTCGTAACCGACATATTCTTGAGATTACCAGTCAAAACGCTAATTCGATGCACCTCTGTTTGTAAGTCATGGTACGCTCTTATCAGAAACCCTAATTTCGTCGATTTACATTTCAATTCCAATGGCAATTATCGTCCGGAGTGTCTCGATAATGGATATATACTATTAGGCGGCACTAATTTCTGCCATGTAGTTTGTGATAAAGAATTCAAATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1191 bp · TkA04G470090|TK1151|CDS

ATGTTGGAAGAGATGATTGATGCAAGCTATTACATTCCACCGGAGCTCGTAACCGACATATTCTTGAGATTACCAGTCAAAACGCTAATTCGATGCACCTCTGTTTGTAAGTCATGGTACGCTCTTATCAGAAACCCTAATTTCGTCGATTTACATTTCAATTCCAATGGCAATTATCGTCCGGAGTGTCTCGATAATGGATATATACTATTAGGCGGCACTAATTTCTGCCATGTAGTTTGTGATAAAGAATTCAAATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

396 aa · TkA04G470090|TK1151|PROTEIN

MLEEMIDASYYIPPELVTDIFLRLPVKTLIRCTSVCKSWYALIRNPNFVDLHFNSNGNYRPECLDNGYILLGGTNFCHVVCDKEFKSLYAVQTPFAVGRNRKSSLNFVGSCNGLLCLAPGLEYNLGNDVYIWNPSTRTHKKLPPSQFSDEFIDERWMVSRLGFGFHESTNDYKVIRLIYFPECRNFTSVDVAPLVEVYSLETDSWRIIRTEVPPIVTQSVVTFHNGVFYWMGFKSIRDDPMENYIMSFDLDNEKFKEIEQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G470090
TK1151 IDTkA04G470090
OH-1004 IDLXL04_038839
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 83.333 / OH-1004 87.766
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G470090
位置Chr04:118714703-118715893 (-)
描述Similar to CPR1: F-box protein CPR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g12560 SCF(ASK- Cullin-F-box) E3泛素连接酶复合物的组分，可能介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解（通过相似性）。
An F-box gene, CPR30, functions as a negative regulator of the defense response in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03995.x
At3g07870 F-box 蛋白 At3g07870。 暂无已核实直接文献
At3g06240 F-box/kelch 重复蛋白 At3g06240。 暂无已核实直接文献
At3g23880 F-box/kelch重复蛋白At3g23880。 暂无已核实直接文献
At2g43440 F-box 蛋白 At2g43440。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038839 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0008284 positive regulation of cell population proliferation 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0031348 negative regulation of defense response 生物过程
GO:0042177 negative regulation of protein catabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11620
ath:AT3G06240
ath:AT3G07870
ath:AT4G12560
ath:AT4G38870
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.616
排名 1 · TkA04G470090 · TK1151
细胞核0.371
排名 2 · TkA04G470090 · TK1151
内质网0.100
排名 3 · TkA04G470090 · TK1151
细胞膜0.085
排名 4 · TkA04G470090 · TK1151
线粒体0.050
排名 5 · TkA04G470090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00646F-box12-48 aa
PF12937F-box-like12-46 aa
PF03478Beta-prop_KIB1-488-282 aa
PF07734FBA_1100-314 aa
PF08268FBA_3101-311 aa
PF01344Kelch_1127-144 aa
PF01344Kelch_1195-208 aa
PF01344Kelch_1244-257 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G470090PF00646F-box12481e-0938.6
TkA04G470090PF12937F-box-like12462.6e-0937.4
TkA04G470090PF03478Beta-prop_KIB1-4882821.1e-0629.0
TkA04G470090PF07734FBA_11003142e-2073.8
TkA04G470090PF08268FBA_31013112.1e-2073.7
TkA04G470090PF01344Kelch_11271440.0003520.7
TkA04G470090PF01344Kelch_11952080.0003520.7
TkA04G470090PF01344Kelch_12442570.0003520.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SU30拟南芥sp|Q9SU30|CPR1_ARATH F-box protein CPR128.600%Swiss-Prot低置信
Q9SFC7拟南芥sp|Q9SFC7|FB135_ARATH F-box protein At3g0787026.800%Swiss-Prot低置信
Q8GXC7拟南芥sp|Q8GXC7|FBK50_ARATH F-box/kelch-repeat protein At3g0624027.700%Swiss-Prot低置信
Q9LIR8拟南芥sp|Q9LIR8|FBK67_ARATH F-box/kelch-repeat protein At3g2388026.300%Swiss-Prot低置信
A8MS20拟南芥sp|A8MS20|FB350_ARATH F-box protein At2g4344023.700%Swiss-Prot低置信

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