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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G452550
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 114067169-114070772 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1409 bp · TkA04G452550|TK1151|cDNA

ATCAATAACAAGTTTCAAAACACCAAACATAAGTTGATAATATGAAATCCTAAAATAGTCTCATATATCAAATCTATTTATGTTGTAGCCGGATATGTAAGATTCTCAAACTACTGCCAAAAATGGATGTAACATTGTCTGCAGCAGGCACCACGCTATCCAAAACCCTCGATTGCTCCGGCCAAACCTTAAGGAGTAATTTAACGCTCCTCCGCCCTGGACAGATTACAACCATCCCGAGTGCTGTCTTTCGGAGATCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1047 bp · TkA04G452550|TK1151|CDS

ATGGATGTAACATTGTCTGCAGCAGGCACCACGCTATCCAAAACCCTCGATTGCTCCGGCCAAACCTTAAGGAGTAATTTAACGCTCCTCCGCCCTGGACAGATTACAACCATCCCGAGTGCTGTCTTTCGGAGATCATCAGTCAACTTCGGATCGGAATCTCCGTTGTTTGGGTTGAGGAAGGCCGGAGCTGCGGTATCTCATGTTTGGGGCCGCCTGGAGTGCGTTTCTAGCCCCGTTGCTTCCTATGGTGGCGGTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

348 aa · TkA04G452550|TK1151|PROTEIN

MDVTLSAAGTTLSKTLDCSGQTLRSNLTLLRPGQITTIPSAVFRRSSVNFGSESPLFGLRKAGAAVSHVWGRLECVSSPVASYGGGGIGGGADGGKVRANPIAAAADDVSPLSSDVITLDVQAQVASATVDLKTEIAVVLPVSEAKATPNWQKVIGEDLAKHLTTCGFTSTLRVMTKVNNNNRNKLKLEATMEEIEENKGNHRWNAAIANLTELSNNINSLEKLLVQRVVYVDPNTYNRASLTSEQSRTIKILEQRVERL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G452550
TK1151 IDTkA04G452550
OH-1004 IDLXL04_017105
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)43.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 49.713 / OH-1004 22.386
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G452550
位置Chr04:114067169-114070772 (+)
描述Similar to PAA1: Copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g33520 介导铜跨质体外膜的转运。
Biochemical characterization of AtHMA6/PAA1, a chloroplast envelope Cu(I)-ATPase.2011 · DOI: 10.1074/jbc.m111.241034

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017105 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006825 copper ion transport 生物过程
GO:0009767 photosynthetic electron transport chain 生物过程
GO:0035434 copper ion transmembrane transport 生物过程
GO:0055070 copper ion homeostasis 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G33520
ath:AT5G21930
sha:SH0496
syc:syc1785_d
syf:Synpcc7942_2317
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.352
排名 1 · TkA04G452550 · TK1151
细胞质0.342
排名 2 · TkA04G452550 · TK1151
细胞膜0.136
排名 3 · TkA04G452550 · TK1151
质体0.120
排名 4 · TkA04G452550 · TK1151
线粒体0.087
排名 5 · TkA04G452550 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17511Mobilization_B102-153 aa
PF11839Alanine_zipper104-130 aa
PF30378CEP135_TSGA10_CC105-141 aa
PF28544Helical_needle105-127 aa
PF05258DciA141-169 aa
PF19745FUT8_N_cat164-335 aa
PF10046BLOC1_2174-224 aa
PF28544Helical_needle174-246 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G452550PF17511Mobilization_B1021534.78.3
TkA04G452550PF11839Alanine_zipper1041305.48.1
TkA04G452550PF30378CEP135_TSGA10_CC1051410.04612.8
TkA04G452550PF28544Helical_needle1051271.99.0
TkA04G452550PF05258DciA1411690.1313.2
TkA04G452550PF19745FUT8_N_cat1643353.76.9
TkA04G452550PF10046BLOC1_21742241.010.5
TkA04G452550PF28544Helical_needle1742461.99.0
TkA04G452550PF07889DUF16641851973.28.5
TkA04G452550PF07889DUF16642092663.28.5
TkA04G452550PF09548Spore_III_AB2403430.01116.2
TkA04G452550PF30378CEP135_TSGA10_CC2443320.04612.8
TkA04G452550PF10046BLOC1_22452641.010.5
TkA04G452550PF17511Mobilization_B2463234.78.3
TkA04G452550PF11839Alanine_zipper2512975.48.1
TkA04G452550PF28544Helical_needle2923261.99.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SZC9拟南芥sp|Q9SZC9|HMA6_ARATH Copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic51.600%Swiss-Prot中等置信

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