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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G432540
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 109062940-109069333 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3265 bp · TkA04G432540|TK1151|cDNA

GTTTCGACCACACCTACGGCATGAATATGACTTTAATTATGTCAAAACAACAACATATTGCAAGTTTGCAACTTTCTTAATTCAATGGTCGGTTTATAACGAAAATCTGTGGAGATGCTTAAAACCCTAGGTGAAATTTTGATGATGCGAAACCAATAATCGTTTTGAGGTGTAAAGAGAACAGTAACATTTGGAAGTTTGATTAATTAGTGGCTTGAATTGGAGACTCGATGATCAAACTGGAGAAATTGATCAGGTTG...

CDS

下载 CDS FASTA

2454 bp · TkA04G432540|TK1151|CDS

ATGGCAATCGATATCAAAACCCTAAAGGATAGGTATATTGATTCTTGCAAAGCTTGTGAAACCATTCCTAATAAAGCTGTTCTCTCAGCTCTCTTTAAGGCTGAAGTTAAGAAATCCAATAATGAAGAGTCCACCTTTTTAATCTACTTAGATGATTTCAAATCCATCGACTTTCATCCACTTTACAATCTATTTCTCCAAATTGATCTATCAGAAATAGACTCAGTTGACATACTCCAAAAATCATCATGTTCATTAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

817 aa · TkA04G432540|TK1151|PROTEIN

MAIDIKTLKDRYIDSCKACETIPNKAVLSALFKAEVKKSNNEESTFLIYLDDFKSIDFHPLYNLFLQIDLSEIDSVDILQKSSCSLDGDSVLLLLHAINQKLRVVDLQDRTFGKDFLMGLSLGGMSCQILNLKFSHFRKINMIGKFIQIRTLNLDFSASLTNFGKDCFSCMPNLKSLSLCETKVSNLWTTSASLAKLPSLIELRFQSCLCCDDTRVCPRSFGVKADENTSPSSSSSSSILDRGFEKITPFLTTEENTSLF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G432540
TK1151 IDTkA04G432540
OH-1004 IDLXL04_038463
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G432540
位置Chr04:109062940-109069333 (-)
描述Similar to KATNB1: Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g34280 可能作为CUL4-RING型E3泛素蛋白连接酶（CRL4）复合物的底物受体，并可能与RUP1协同负向调控细胞对紫外线B（UV-B）照射的应答。
DWD HYPERSENSITIVE TO UV-B 1 is negatively involved in UV-B mediated cellular responses in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1007/s11103-014-0247-0
DHU1 negatively regulates UV-B signaling via its direct interaction with COP1 and RUP1.2017 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2017.07.110

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038463 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007019 microtubule depolymerization 生物过程
GO:0010224 response to UV-B 生物过程
GO:0051013 microtubule severing 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0071493 cellular response to UV-B 生物过程
GO:0000922 spindle pole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005813 centrosome 细胞组分
GO:0005819 spindle 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G34280
gga:415631
mmu:69544
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.501
排名 1 · TkA04G432540 · TK1151
细胞质0.409
排名 2 · TkA04G432540 · TK1151
细胞膜0.073
排名 3 · TkA04G432540 · TK1151
线粒体0.067
排名 4 · TkA04G432540 · TK1151
溶酶体／液泡0.045
排名 5 · TkA04G432540 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20919DHU1_N4-405 aa
PF12799LRR_4128-156 aa
PF14580LRR_9137-202 aa
PF13855LRR_8148-200 aa
PF12799LRR_4149-186 aa
PF12799LRR_4172-207 aa
PF14580LRR_9351-402 aa
PF12799LRR_4377-386 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G432540PF20919DHU1_N44053.1e-72244.6
TkA04G432540PF12799LRR_41281562.59.2
TkA04G432540PF14580LRR_91372022.4e-0524.7
TkA04G432540PF13855LRR_81482000.0003221.1
TkA04G432540PF12799LRR_41491862.59.2
TkA04G432540PF12799LRR_41722072.59.2
TkA04G432540PF14580LRR_93514022.4e-0524.7
TkA04G432540PF12799LRR_43773862.59.2
TkA04G432540PF29037DSE1_N4765564.2e-0523.5
TkA04G432540PF23383Beta-prop_IFT140_1st4765506.5e-0522.5
TkA04G432540PF23098Beta-prop_NOL10_N4806505.9e-1039.5
TkA04G432540PF23419WD40_RFWD34815578.2e-0832.7
TkA04G432540PF25460Beta-prop_Aladin4815470.03114.1
TkA04G432540PF24814WD40_Prp194836862e-1557.3
TkA04G432540PF23414Beta-prop_EML_24835548.2e-0832.7
TkA04G432540PF25175Beta-prop_WDR54855571.3e-1868.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GYY7拟南芥sp|Q8GYY7|DHU1_ARATH Protein DWD HYPERSENSITIVE TO UV-B 150.100%Swiss-Prot高置信

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