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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G358460
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 90327702-90329009 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1308 bp · TkA04G358460|TK1151|cDNA

ATGTCCTCCGTCTCCGGCGTTAATACGCCTTCCACTGAAATCCCTAATCTCCATTCTCGTCCCCACCGGAAATCTGATGCCAACTGGTCCGCGATTAGAGCTGCGACGAATTTGTCCTCCGACGGTACGCTGCATCTCCGCCACCTCAAGCTGGTTCGACATGTCGGATCTGGAAACCTCGGCCGGGTGTTCCTTTGCCGACTTCGTGATTACGATCATGCGAGCTTTGCTTTGAAGGTCGTTGATAACAACTTGCTCAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1308 bp · TkA04G358460|TK1151|CDS

ATGTCCTCCGTCTCCGGCGTTAATACGCCTTCCACTGAAATCCCTAATCTCCATTCTCGTCCCCACCGGAAATCTGATGCCAACTGGTCCGCGATTAGAGCTGCGACGAATTTGTCCTCCGACGGTACGCTGCATCTCCGCCACCTCAAGCTGGTTCGACATGTCGGATCTGGAAACCTCGGCCGGGTGTTCCTTTGCCGACTTCGTGATTACGATCATGCGAGCTTTGCTTTGAAGGTCGTTGATAACAACTTGCTCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

435 aa · TkA04G358460|TK1151|PROTEIN

MSSVSGVNTPSTEIPNLHSRPHRKSDANWSAIRAATNLSSDGTLHLRHLKLVRHVGSGNLGRVFLCRLRDYDHASFALKVVDNNLLTSKKLSHVQTEGRILSSLDHPFLPTLYAHLEVSHYTCFLIDFCPNGDLHSLLRKQPNYRLPIDSVRFYAAEVLVALEYLHSLGIVYRDLKPENILIREDGHIMLSDFDLCFNADVVPKLDRRTRSRRKTKHSDCFGYYGGRRYTEQETLMEFVAEPTTAFSKSCVGTHEYLAPE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G358460
TK1151 IDTkA04G358460
OH-1004 IDLXL04_037891
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 74.359
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G358460
位置Chr04:90327702-90329009 (-)
描述Similar to WAG2: Serine/threonine-protein kinase WAG2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g53700 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶参与生长素信号传导的调节。
The WAG1 and WAG2 protein kinases negatively regulate root waving in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02641.x
NPY genes and AGC kinases define two key steps in auxin-mediated organogenesis in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0809761106
Plasma membrane-bound AGC3 kinases phosphorylate PIN auxin carriers at TPRXS(N/S) motifs to direct apical PIN recycling.2010 · DOI: 10.1242/dev.052456
At3g14370 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶参与生长素信号传导的调节。
The WAG1 and WAG2 protein kinases negatively regulate root waving in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02641.x
NPY genes and AGC kinases define two key steps in auxin-mediated organogenesis in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0809761106
Plasma membrane-bound AGC3 kinases phosphorylate PIN auxin carriers at TPRXS(N/S) motifs to direct apical PIN recycling.2010 · DOI: 10.1242/dev.052456
At4g26610 蛋白激酶，通过直接磷酸化调节PIN生长素外排载体的生长素运输活性。
D6PK AGCVIII kinases are required for auxin transport and phototropic hypocotyl bending in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111484

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0614600 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶参与生长素信号传导的调节。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037891 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009926 auxin polar transport 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048367 shoot system development 生物过程
GO:0048825 cotyledon development 生物过程
GO:2000012 regulation of auxin polar transport 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G53700
ath:AT3G14370
dosa:Os06g0291600
dosa:Os12g0614600
osa:4340792
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.566
排名 1 · TkA04G358460 · TK1151
细胞核0.399
排名 2 · TkA04G358460 · TK1151
细胞膜0.113
排名 3 · TkA04G358460 · TK1151
线粒体0.051
排名 4 · TkA04G358460 · TK1151
溶酶体／液泡0.039
排名 5 · TkA04G358460 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12260PIP49_C46-78 aa
PF13095FTA247-82 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr49-199 aa
PF00069Pkinase51-198 aa
PF13095FTA2156-181 aa
PF06293Kdo162-196 aa
PF14531Kinase-like163-194 aa
PF12260PIP49_C174-220 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G358460PF12260PIP49_C46780.1912.0
TkA04G358460PF13095FTA247820.05713.8
TkA04G358460PF07714PK_Tyr_Ser-Thr491992e-31110.0
TkA04G358460PF00069Pkinase511982.2e-56191.9
TkA04G358460PF13095FTA21561810.05713.8
TkA04G358460PF06293Kdo1621960.2311.6
TkA04G358460PF14531Kinase-like1631940.009416.0
TkA04G358460PF12260PIP49_C1742200.1912.0
TkA04G358460PF00069Pkinase2473522.2e-56191.9
TkA04G358460PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2493362e-31110.0
TkA04G358460PF14531Kinase-like2702970.009416.0
TkA04G358460PF14531Kinase-like3613740.009416.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C8M5拟南芥sp|Q9C8M5|WAG1_ARATH Serine/threonine-protein kinase WAG165.900%Swiss-Prot高置信
Q9LUL2拟南芥sp|Q9LUL2|WAG2_ARATH Serine/threonine-protein kinase WAG264.800%Swiss-Prot高置信
Q9SUA3拟南芥sp|Q9SUA3|D6KL1_ARATH Serine/threonine-protein kinase D6PKL146.400%Swiss-Prot中等置信
Q2QM77水稻sp|Q2QM77|PID_ORYSJ Protein kinase PINOID50.700%Swiss-Prot高置信

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