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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G148550
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 38495750-38497899 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2029 bp · TkA04G148550|TK1151|cDNA

CGGGCTTCTCATCTTAGATCTCCAGGAGACCCGAGTTACGTTCTATTTACCCTTTTCAACACCGTCCGACCGCCCTAGTCTCTCTACGTTTGCCTCCACTGCGCCGTCATCTATCACTTAACACTCGACCGCAGCTCTCTACGCCCGTCCAGGCGTCCACTCCACGCACATCTACATCTCACTGTCGCCCGCCACCACCCTCTGCCGTCGCCTAAACCCGCCTCCCCCTTTTTCCGCACCTTTCGATACCTTTTGCTTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1497 bp · TkA04G148550|TK1151|CDS

ATGTTCTCAATTGCTCAAATTGATCACAAACTTGTTCATGGGATCTTTTATTTTTGCGGCGTTTCTCGCTCCTTATGTAGCACTAGTAATGGATTCACTGATGGGTTTCAACGAATAGAAAAATACTTAATTGATTACCGAAAAACCTCAAATGGTGATTCAATATCGGATGAGAACCAAGAAGAAGAAGAGTCAATTGATTTCGTCGGCACCAGTGGCAGATACGAAGAAGAAGAAGAACATCATCACCAACAAAACGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

498 aa · TkA04G148550|TK1151|PROTEIN

MFSIAQIDHKLVHGIFYFCGVSRSLCSTSNGFTDGFQRIEKYLIDYRKTSNGDSISDENQEEEESIDFVGTSGRYEEEEEHHHQQNVFSRSSFIRNTKNAAAMALKVLQQDGPGFDAKSALDNLEIQVSGLLVREVLIGILKNINHANRERCVKLGYKFFIWSGQKHKYNHTVNTYHLIMQIFAESEEYKAMWRLLEEMTEKGYPVTSRTFNILICTCGEAGVAKKVVERFIKSKSFNFRPYSHSFNAILHALLSIKQYN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G148550
TK1151 IDTkA04G148550
OH-1004 IDLXL04_030286
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)25.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 40.763 / OH-1004 20.232
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G148550
位置Chr04:38495750-38497899 (+)
描述Similar to At1g77360: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g77360, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g55630 含五重复肽的蛋白At1g55630。 暂无已核实直接文献
At3g60050 含五肽重复序列的蛋白 At3g60050。 暂无已核实直接文献
At1g52640 含五三肽重复序列蛋白At1g52640，线粒体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030286 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11050
ath:AT1G52640
ath:AT1G71060
ath:AT1G77360
ath:AT2G48010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.759
排名 1 · TkA04G148550 · TK1151
质体0.168
排名 2 · TkA04G148550 · TK1151
细胞核0.065
排名 3 · TkA04G148550 · TK1151
细胞质0.039
排名 4 · TkA04G148550 · TK1151
细胞膜0.013
排名 5 · TkA04G148550 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28374Mrp1391-130 aa
PF29070MSC6_N156-263 aa
PF23276TPR_24170-229 aa
PF19189Mtf2172-214 aa
PF26719TPR_Atp25_C172-213 aa
PF28374Mrp13172-236 aa
PF13041PPR_2173-218 aa
PF13812PPR_3173-220 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G148550PF28374Mrp13911300.2711.0
TkA04G148550PF29070MSC6_N1562632e-1970.7
TkA04G148550PF23276TPR_241702291e-1661.7
TkA04G148550PF19189Mtf21722148.4e-0626.3
TkA04G148550PF26719TPR_Atp25_C1722130.007316.3
TkA04G148550PF28374Mrp131722360.2711.0
TkA04G148550PF13041PPR_21732187.1e-73241.3
TkA04G148550PF13812PPR_31732201.5e-43147.4
TkA04G148550PF24760TPR_IF140_C1741990.05214.7
TkA04G148550PF01535PPR1752031.2e-42141.9
TkA04G148550PF30136MSC6_C1802150.01415.5
TkA04G148550PF04055Radical_SAM1862100.000321.7
TkA04G148550PF12854PPR_11942009.1e-43144.4
TkA04G148550PF17177PPR_long1963041.9e-1557.6
TkA04G148550PF12854PPR_12022219.1e-43144.4
TkA04G148550PF01535PPR2102361.2e-42141.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q7X6A5拟南芥sp|Q7X6A5|PPR81_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g5563052.600%Swiss-Prot中等置信
Q9M1D8拟南芥sp|Q9M1D8|PP288_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g6005060.700%Swiss-Prot低置信
Q9SSR6拟南芥sp|Q9SSR6|PPR78_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g52640, mitochondrial25.000%Swiss-Prot低置信

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