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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G029420
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 7762550-7765413 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1445 bp · TkA04G029420|TK1151|cDNA

CGCATATATCATCAAAGATACATCTATTCAAACATGTTCTGTCATTCATCACCCACTTTGCCTCCATCTTCTTTCTTTTAAATCATCTTCATCCATCGTTTCATAATTTGGAGACGAAATAGATGCTCAAGATGATACCCATGATGAAATTACTAGTTAATCTTCCATTTTTGTTGATTTTAGCAACTAATCATCTTTCACTACATATGATCCACGGACAACCCCAAGATTCATGTGGTTCAAACTCAAATCTTGCTAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1140 bp · TkA04G029420|TK1151|CDS

ATGCTCAAGATGATACCCATGATGAAATTACTAGTTAATCTTCCATTTTTGTTGATTTTAGCAACTAATCATCTTTCACTACATATGATCCACGGACAACCCCAAGATTCATGTGGTTCAAACTCAAATCTTGCTAATATCAGTAGCCAGATCTTCTTTGAGACTTCTTCTCTCAATTGCTTTCCTGTTTGGTCTTCGGAAAACTTCATCCTTAGATATTCACAAGATGGCCCAAGTTTGTGGAATTTTGTCTTATCTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

379 aa · TkA04G029420|TK1151|PROTEIN

MLKMIPMMKLLVNLPFLLILATNHLSLHMIHGQPQDSCGSNSNLANISSQIFFETSSLNCFPVWSSENFILRYSQDGPSLWNFVLSAPISNSYIGMGFSPNGGMVGSSAVVGWVARDGSGNMKKYFLGGQSPSQVLVDQGDLEIIGNTSLVISDSSRIFMVFQLVIDQPRRQLVFSVGDSSNPPPNTPNFLLTRHRSHMAISLNYASGQSSRIKAPYSNLKRAHGTLNMIGWGILIPIGAMVARYLKHLNPLWFYIHTGI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G029420
TK1151 IDTkA04G029420
OH-1004 IDLXL04_036683
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G029420
位置Chr04:7762550-7765413 (+)
描述Similar to At3g07570: Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g07570
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g07570 可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。 暂无已核实直接文献
At3g61750 可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。 暂无已核实直接文献
At3g59070 可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。 暂无已核实直接文献
At5g35735 可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。 暂无已核实直接文献
At4g17280 可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036683 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0080022 primary root development 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0000293 ferric-chelate reductase activity 分子功能
GO:0009055 electron transfer activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G07570
ath:AT3G59070
ath:AT3G61750
ath:AT5G35735
ath:AT5G47530
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.637
排名 1 · TkA04G029420 · TK1151
溶酶体／液泡0.182
排名 2 · TkA04G029420 · TK1151
细胞质0.122
排名 3 · TkA04G029420 · TK1151
内质网0.089
排名 4 · TkA04G029420 · TK1151
高尔基体0.060
排名 5 · TkA04G029420 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01794Ferric_reduct17-36 aa
PF29747TP_078365-135 aa
PF03351DOMON83-135 aa
PF01794Ferric_reduct198-259 aa
PF03188Cytochrom_B561224-344 aa
PF19589DUF6095229-244 aa
PF29747TP_0783237-276 aa
PF19589DUF6095259-304 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G029420PF01794Ferric_reduct17360.6510.8
TkA04G029420PF29747TP_0783651350.07412.5
TkA04G029420PF03351DOMON831352.7e-0834.8
TkA04G029420PF01794Ferric_reduct1982590.6510.8
TkA04G029420PF03188Cytochrom_B5612243442.8e-0628.4
TkA04G029420PF19589DUF60952292440.7110.8
TkA04G029420PF29747TP_07832372760.07412.5
TkA04G029420PF19589DUF60952593040.7110.8
TkA04G029420PF01794Ferric_reduct2983380.6510.8
TkA04G029420PF19589DUF60953173450.7110.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WRW8拟南芥sp|Q0WRW8|B561K_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g0757051.300%Swiss-Prot高置信
Q9M363拟南芥sp|Q9M363|B561I_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g6175040.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LYS9拟南芥sp|Q9LYS9|B561H_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g5907030.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FKH6拟南芥sp|Q9FKH6|B561P_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At5g3573530.600%Swiss-Prot中等置信
Q8VYH6拟南芥sp|Q8VYH6|B651B_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At4g1728028.000%Swiss-Prot低置信

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