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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA03G588860
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 149595017-149597321 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1651 bp · TkA03G588860|TK1151|cDNA

TCACAACAACTTTCTCTAATTTTATAATATTTTCCCCCTATTTTAACTTTTGTACCATAACGTTCTAATTTGAAGAAAGTCGGCAACTTTTCTATCTCTTTACACCACAAGAATGGACACAGGAGTCTTACTTTTGGCATGTTCAATCTTTACATGGGTGTTTCTTCACCGATGGAGCCAACGATCCAACAAAGGCCCGAAAACTTGGCCTCTTGTTGGAGCCGCTATCGAACAACTAATGAATTATGACCGAATGCACG...

1539 bp · TkA03G588860|TK1151|CDS

ATGGACACAGGAGTCTTACTTTTGGCATGTTCAATCTTTACATGGGTGTTTCTTCACCGATGGAGCCAACGATCCAACAAAGGCCCGAAAACTTGGCCTCTTGTTGGAGCCGCTATCGAACAACTAATGAATTATGACCGAATGCACGATTGGCTGGTCAACTATCTATCAAAGTCAAGCACTGTTGTGGTCCCTATGCCCTTCACCACTTACACTTACATAGCCGACCCGGCTAATGTGGAACATGTTCTTAAAACCAA...

513 aa · TkA03G588860|TK1151|PROTEIN

MDTGVLLLACSIFTWVFLHRWSQRSNKGPKTWPLVGAAIEQLMNYDRMHDWLVNYLSKSSTVVVPMPFTTYTYIADPANVEHVLKTNFANYPKGEVYHSYMEVLLGNGIFNSDGENWRKQRKTASLEFASRNLRDFSTVVFREYSLKLSSILSHASFNKKQLDLQELLMRMTLDSICKVGFGVEIGTLAPNLPENQFAKAFDAANIIVTLRFIDPLWRIKKFLRVGSEAILDQSIKTIDDFTYSVIRKRKSEIEEAQEGP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G588860
TK1151 IDTkA03G588860
OH-1004 IDLXL04_011451
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.419
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G588860
位置Chr03:149595017-149597321 (+)
描述Similar to CYP704B1: Cytochrome P450 704B1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_011451 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0010584 pollen exine formation 生物过程
GO:0080110 sporopollenin biosynthetic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004497 monooxygenase activity 分子功能
GO:0005506 iron ion binding 分子功能
GO:0016705 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen 分子功能
GO:0016712 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 分子功能
GO:0018685 alkane 1-monooxygenase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G01600
ath:AT1G63710
ath:AT1G69500
ath:AT4G00360
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

内质网0.920
排名 1 · TkA03G588860 · TK1151
细胞质0.050
排名 2 · TkA03G588860 · TK1151
细胞膜0.040
排名 3 · TkA03G588860 · TK1151
细胞核0.034
排名 4 · TkA03G588860 · TK1151
高尔基体0.033
排名 5 · TkA03G588860 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00067p45028-500 aa
PF17027Bromo_TP_like224-280 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G588860PF00067p450285005.8e-68230.5
TkA03G588860PF17027Bromo_TP_like2242800.1912.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C788拟南芥sp|Q9C788|C70B1_ARATH Cytochrome P450 704B175.600%Swiss-Prot高置信
O23066拟南芥sp|O23066|C86A2_ARATH Cytochrome P450 86A243.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LMM1拟南芥sp|Q9LMM1|C86A4_ARATH Cytochrome P450 86A442.300%Swiss-Prot中等置信
Q9CAD6拟南芥sp|Q9CAD6|C86A7_ARATH Cytochrome P450 86A740.300%Swiss-Prot中等置信

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