TkA03G560510 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G560510

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 142144253-142150877 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1094 bp · TkA03G560510|TK1151|cDNA

ATGCTCATGGTGCACCAATGTTGCTATCTGAATTACTCGAAGCTCTCCCCATTAACAAGGAGAAAAACGTCATTTGTCTATCAACTTATGCTCATTCTTATCCACTCTGCGTTCTTCATCAAAGAACAAATATCCACAATTAAAGGCAATGGTGAAGAGGGAAAAGAAGGCTATCTGCTAACCCCTGCTTCTCGACTTCTTCTTAAAGACGAACCATTAAGCTTGAGTCCCGTTTTGCTATTCATGTTGGATCCATTATT...

CDS

下载 CDS FASTA

963 bp · TkA03G560510|TK1151|CDS

ATGCTCATGGTGCACCAATGTTGCTATCTGAATTACTCGAAGCTCTCCCCATTAACAAGGAGAAAAACGTCATTTGTCTATCAACTTATGCTCATTCTTATCCACTCTGCGTTCTTCATCAAAGAACAAATATCCACAATTAAAGGCAATGGTGAAGAGGGAAAAGAAGGCTATCTGCTAACCCCTGCTTCTCGACTTCTTCTTAAAGACGAACCATTAAGCTTGAGTCCCGTTTTGCTATTCATGTTGGATCCATTATT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

320 aa · TkA03G560510|TK1151|PROTEIN

MLMVHQCCYLNYSKLSPLTRRKTSFVYQLMLILIHSAFFIKEQISTIKGNGEEGKEGYLLTPASRLLLKDEPLSLSPVLLFMLDPLLMDPWKHMSEWFQNNDVTPFHTTHGNSIWDVASQEPKLNQFINESMASDTRLVASIITKHCASAFQGLNSFVDVGGGTGTISKAISATFPNVTCISFDLPHVVNGLEGSTNVRYVCGDMFEAIPKADAVLLKWVLHDCNDEECIKILKRCKEAIPNKEHGGKVMIIEMVLKEKE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G560510`
TK1151 ID	TkA03G560510
OH-1004 ID	LXL04_011007
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	66.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 94.062 / OH-1004 83.056 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA03G560510`
位置	Chr03:142144253-142150877 (+)
描述	Similar to ROMT: Trans-resveratrol di-O-methyltransferase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_011007` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0009699 phenylpropanoid biosynthetic process 生物过程 GO:0009717 isoflavonoid biosynthetic process 生物过程 GO:0009812 flavonoid metabolic process 生物过程 GO:0032259 methylation 生物过程 GO:0008171 O-methyltransferase activity 分子功能 GO:0008757 S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity 分子功能 GO:0030761 8-hydroxyquercitin 8-O-methyltransferase activity 分子功能 GO:0046983 protein dimerization activity 分子功能 GO:0102303 resveratrol 3,5-O-dimethyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用	ag:ALG05119 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.792

排名 1 · TkA03G560510 · TK1151

细胞核0.295

排名 2 · TkA03G560510 · TK1151

内质网0.054

排名 3 · TkA03G560510 · TK1151

过氧化物酶体0.050

排名 4 · TkA03G560510 · TK1151

线粒体0.046

排名 5 · TkA03G560510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08100Dimerisation15-70 aa

PF00891Methyltransf_291-300 aa

PF13489Methyltransf_23152-225 aa

PF05891Methyltransf_PK154-246 aa

PF13847Methyltransf_31157-255 aa

PF13649Methyltransf_25158-239 aa

PF08241Methyltransf_11158-235 aa

PF08242Methyltransf_12158-239 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G560510	`PF08100`	Dimerisation	15	70	0.24	12.1
TkA03G560510	`PF00891`	Methyltransf_2	91	300	1.3e-56	192.0
TkA03G560510	`PF13489`	Methyltransf_23	152	225	0.067	13.6
TkA03G560510	`PF05891`	Methyltransf_PK	154	246	0.014	15.6
TkA03G560510	`PF13847`	Methyltransf_31	157	255	0.36	11.3
TkA03G560510	`PF13649`	Methyltransf_25	158	239	0.00025	22.4
TkA03G560510	`PF08241`	Methyltransf_11	158	235	0.00045	21.5
TkA03G560510	`PF08242`	Methyltransf_12	158	239	0.017	16.5
TkA03G560510	`PF08242`	Methyltransf_12	267	280	0.017	16.5
TkA03G560510	`PF13649`	Methyltransf_25	271	291	0.00025	22.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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