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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G531840
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 133752563-133755672 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1964 bp · TkA03G531840|TK1151|cDNA

TTATCATGTGACTTCTCCAGTCCCCTGATCCCCTCTCTTCCCTTCCTCTTCCCCCCAATCATAAGTCATAACCACTCTCTCTCCACCTGTATTTCATCCCTCACTAAAATAAGCTCCATCACCCTCTCCATCAACCCCCAAAACACCCCACACTCCAACACCACTAGGGTTTTCATTTATTACAACCAAAACAGAGTGTTTTTCTTGGAAATTTATGTGAAGAAATCATCGGAAATGGGCTGTTTTCAGTCCAAAACTGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1719 bp · TkA03G531840|TK1151|CDS

TTATCATGTGACTTCTCCAGTCCCCTGATCCCCTCTCTTCCCTTCCTCTTCCCCCCAATCATAAGTCATAACCACTCTCTCTCCACCTGTATTTCATCCCTCACTAAAATAAGCTCCATCACCCTCTCCATCAACCCCCAAAACACCCCACACTCCAACACCACTAGGGTTTTCATTTATTACAACCAAAACAGAGTGTTTTTCTTGGAAATTTATGTGAAGAAATCATCGGAAATGGGCTGTTTTCAGTCCAAAACTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

572 aa · TkA03G531840|TK1151|PROTEIN

LSCDFSSPLIPSLPFLFPPIISHNHSLSTCISSLTKISSITLSINPQNTPHSNTTRVFIYYNQNRVFFLEIYVKKSSEMGCFQSKTANVQSPDQVPESKPDPGDGEQGLGQQDQEQAVPSFKEFELTELRAATNGFSSELIVSESGEKAPNVVYRGKLRSNKVVAIKRFSKLSWPDPQQFVAEASGVGKVRHNRLVNLIGCCAEGDERLLVAEYMPNDTLSKHLFHWDKQPLPWEMRVRVAYHIAQALEHCNSENHKIYH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G531840
TK1151 IDTkA03G531840
OH-1004 IDLXL04_010510
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 85.664 / OH-1004 83.192
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G531840
位置Chr03:133752563-133755672 (-)
描述Similar to BSK2: Serine/threonine-protein kinase BSK2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g46570 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为受体激酶 BRI1 下游油菜素甾醇 信号传导的正调节因子。
BSKs mediate signal transduction from the receptor kinase BRI1 in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1126/science.1156973
At4g35230 丝氨酸/苏氨酸激酶，作为受体激酶 BRI1 下游油菜素甾醇 信号传导的正调节因子。
BSKs mediate signal transduction from the receptor kinase BRI1 in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1126/science.1156973
BR-SIGNALING KINASE1 physically associates with FLAGELLIN SENSING2 and regulates plant innate immunity in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.112.107904
At5g59010 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为受体激酶 BRI1 下游油菜素甾醇 信号传导的正调节因子。
A mutation in Arabidopsis BSK5 encoding a brassinosteroid-signaling kinase protein affects responses to salinity and abscisic acid.2012 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2012.08.118
At3g54030 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为受体激酶 BRI1 下游油菜素甾醇 (BR) 信号传导的正调节因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os10g0542800 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为植物免疫的正调节剂。
OsBSK1-2, an Orthologous of AtBSK1, Is Involved in Rice Immunity.2017 · DOI: 10.3389/fpls.2017.00908
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010510 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:1900459 positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G54030
ath:AT4G35230
ath:AT5G46570
ath:AT5G59010
dosa:Os04g0684200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.504
排名 1 · TkA03G531840 · TK1151
细胞质0.273
排名 2 · TkA03G531840 · TK1151
细胞核0.240
排名 3 · TkA03G531840 · TK1151
内质网0.061
排名 4 · TkA03G531840 · TK1151
质体0.053
排名 5 · TkA03G531840 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13174TPR_6111-123 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr152-387 aa
PF00069Pkinase152-384 aa
PF25575TPR_BSK1_C423-540 aa
PF13174TPR_6471-491 aa
PF07719TPR_2471-491 aa
PF13174TPR_6502-520 aa
PF07719TPR_2503-526 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G531840PF13174TPR_61111230.04715.1
TkA03G531840PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1523877.5e-2795.0
TkA03G531840PF00069Pkinase1523841.4e-2590.9
TkA03G531840PF25575TPR_BSK1_C4235405.8e-53178.5
TkA03G531840PF13174TPR_64714910.04715.1
TkA03G531840PF07719TPR_24714910.1113.4
TkA03G531840PF13174TPR_65025200.04715.1
TkA03G531840PF07719TPR_25035260.1113.4
TkA03G531840PF07719TPR_25345530.1113.4
TkA03G531840PF13174TPR_65355570.04715.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LS26拟南芥sp|Q9LS26|BSK2_ARATH Serine/threonine-protein kinase BSK278.900%Swiss-Prot高置信
Q944A7拟南芥sp|Q944A7|BSK1_ARATH Serine/threonine-protein kinase BSK164.300%Swiss-Prot高置信
Q9FIL1拟南芥sp|Q9FIL1|BSK5_ARATH Serine/threonine-protein kinase BSK563.000%Swiss-Prot高置信
Q9M324拟南芥sp|Q9M324|BSK6_ARATH Serine/threonine-protein kinase BSK661.600%Swiss-Prot高置信
Q336V9水稻sp|Q336V9|BSK12_ORYSJ Serine/threonine-protein kinase BSK1-261.300%Swiss-Prot高置信

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