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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G530540
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 133398109-133400956 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1552 bp · TkA03G530540|TK1151|cDNA

CCTAAACAAATGATAGAAGACGACCAAACATTCCACTTTCCATATTTTTAATTGCACGAATTAGAAAAACCCACCCCAAACCATACAGACACACATCCCAACACACATGTATAACACACCAACATCTTCACATCAATCTTCATCTCAATTTCTTAATTTTCACCAGTATACTTCATTACTTCCAATCTCAGTTTCTCTGCAAATAATAACGCTTTCCTCTAGCTGCAACAGATATCTATCCATCTAACATGATGAAGATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1011 bp · TkA03G530540|TK1151|CDS

ATGATGAAGATTGGGAGAAGAGGATTACATTATTTACACACATTAAACAGTGTTCCTAAGAATTTGATAGAGAAGGGACAAAACCGTGTTATAGAGGCATCTCTTACACTCATTCGTGAAAGAGCAAAACTTAAGGGAGAGCTAGTCCGTGCATTAGGTGGTGCCAAAGCTTCATCATCTCTTCTTGGAGTTCCTCTTGGACACAATTCATCCTTTCTTCAAGGTCCTGCATTTGCCCCACCAAGGATACGAGAAGCCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

336 aa · TkA03G530540|TK1151|PROTEIN

MMKIGRRGLHYLHTLNSVPKNLIEKGQNRVIEASLTLIRERAKLKGELVRALGGAKASSSLLGVPLGHNSSFLQGPAFAPPRIREAIWCGSTNATTEEGKELKDPRILTDVGDVPVQELRDCGIDDDRLMNIISESVKLVMEESPLRPLVLGGDHSISYPVIRAVSEKLGGPVDVLHLDAHPDIYDCFEGNKYSHASSFARIMEGGYARRLLQVGIRSINIEGREQGKRFGVEQYEMRTFSKDRHFLENLKLGEGVKGVY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G530540
TK1151 IDTkA03G530540
OH-1004 IDLXL04_010488
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G530540
位置Chr03:133398109-133400956 (+)
描述Similar to ARGAH1: Arginase 1, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g08900 水解L-精氨酸生成尿素和L-鸟氨酸；前者参与氮回收到铵的循环，后者则回馈到尿素循环或作为多胺和脯氨酸合成的前体。
Dual functioning of plant arginases provides a third route for putrescine synthesis.2017 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2017.05.011
At4g08870 水解L-精氨酸生成尿素和L-鸟氨酸；前者参与氮回收到铵的循环，后者则回馈到尿素循环或作为多胺和脯氨酸合成的前体。
Dual functioning of plant arginases provides a third route for putrescine synthesis.2017 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2017.05.011
Phosphatidic acid binds to and stimulates the activity of ARGAH2 from Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1016/j.plaphy.2022.06.018

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8AU84 水解L-精氨酸生成尿素和L-鸟氨酸；前者参与氮回收到铵的循环，后者则回馈到尿素循环或作为多胺和脯氨酸合成的前体。 暂无已核实直接文献
Os04g0106300 水解L-精氨酸生成尿素和L-鸟氨酸；前者参与氮回收到铵的循环，后者则回馈到尿素循环或作为多胺和脯氨酸合成的前体。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010488 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000050 urea cycle 生物过程
GO:0006527 L-arginine catabolic process 生物过程
GO:0006560 proline metabolic process 生物过程
GO:0006570 tyrosine metabolic process 生物过程
GO:0006591 ornithine metabolic process 生物过程
GO:0009445 putrescine metabolic process 生物过程
GO:0009446 putrescine biosynthetic process 生物过程
GO:0033389 putrescine biosynthetic process from arginine, via agmatine 生物过程
GO:0034214 protein hexamerization 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G08870
ath:AT4G08900
dosa:Os04g0106300
mtr:11420737
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.366
排名 1 · TkA03G530540 · TK1151
线粒体0.275
排名 2 · TkA03G530540 · TK1151
细胞核0.162
排名 3 · TkA03G530540 · TK1151
质体0.153
排名 4 · TkA03G530540 · TK1151
过氧化物酶体0.140
排名 5 · TkA03G530540 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18854baeRF_family1022-54 aa
PF00491Arginase60-330 aa
PF18854baeRF_family10128-160 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G530540PF18854baeRF_family1022540.2112.6
TkA03G530540PF00491Arginase603304.8e-71240.2
TkA03G530540PF18854baeRF_family101281600.2112.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P46637拟南芥sp|P46637|ARGI1_ARATH Arginase 1, mitochondrial90.500%Swiss-Prot高置信
Q9ZPF5拟南芥sp|Q9ZPF5|ARGI2_ARATH Arginase 2, chloroplastic/mitochondrial81.700%Swiss-Prot高置信
B8AU84水稻sp|B8AU84|ARGI1_ORYSI Arginase 1, mitochondrial84.700%Swiss-Prot高置信
Q7X7N2水稻sp|Q7X7N2|ARGI1_ORYSJ Arginase 1, mitochondrial84.700%Swiss-Prot高置信

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