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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G528250
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 132761959-132763464 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1239 bp · TkA03G528250|TK1151|cDNA

ATGGCTAGTGTTGATGATCAACACACGAATTTCAAGCATTTTTGTCGAATATGTAAGAAGGGTTTCATGTGTGGAAGAGCATTAGGCGGCCATATGAGAGCTCATGGCATTGGGGACGATACTGGGAATCTTGATGATGACGATCCGCCCAGCGATTGGGAAGCTAGTGGGTGGTCGAAAAGAAAACGATCTTTAAGGGCTAAAGTTGGCAGCTTTAATTCAATGTGTCCATCTAGCGAAGACGAAGACCTAGCCCTAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1239 bp · TkA03G528250|TK1151|CDS

ATGGCTAGTGTTGATGATCAACACACGAATTTCAAGCATTTTTGTCGAATATGTAAGAAGGGTTTCATGTGTGGAAGAGCATTAGGCGGCCATATGAGAGCTCATGGCATTGGGGACGATACTGGGAATCTTGATGATGACGATCCGCCCAGCGATTGGGAAGCTAGTGGGTGGTCGAAAAGAAAACGATCTTTAAGGGCTAAAGTTGGCAGCTTTAATTCAATGTGTCCATCTAGCGAAGACGAAGACCTAGCCCTAGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

412 aa · TkA03G528250|TK1151|PROTEIN

MASVDDQHTNFKHFCRICKKGFMCGRALGGHMRAHGIGDDTGNLDDDDPPSDWEASGWSKRKRSLRAKVGSFNSMCPSSEDEDLALAKCLMELSNARVDPVETDAEDSCASREEQRRNPVFTTAAFLSPFTRPPPPLDKAKGVATTPKGMFECKACKKVFNSHQALGGHRASHKKVKGCFAARNDQLDDTIVDDDVITHDQLFPSPKPISSYQVNQGPIGAARRKSKVHKCSICNRIFASGQALGGHKRCHWLTSNMSDT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G528250
TK1151 IDTkA03G528250
OH-1004 IDLXL04_010455
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)78.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.602 / OH-1004 99.590
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G528250
位置Chr03:132761959-132763464 (+)
描述Similar to ZAT3: Zinc finger protein ZAT3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g17180 介导DUO1对男性生殖细胞分裂的调控。
An EAR-Dependent Regulatory Module Promotes Male Germ Cell Division and Sperm Fertility in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.124743
At4g35280 介导DUO1对男性生殖细胞分裂的调控。
An EAR-Dependent Regulatory Module Promotes Male Germ Cell Division and Sperm Fertility in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.124743
At3g60580 可能参与应激反应的转录因子。 暂无已核实直接文献
At2g28200 可能参与应激反应的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g04340 可能的转录因子，调节根部发育以及磷酸盐 获取和稳态。
Phosphate homeostasis and root development in Arabidopsis are synchronized by the zinc finger transcription factor ZAT6.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.101691

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010455 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0048235 pollen sperm cell differentiation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G17180
ath:AT2G28200
ath:AT2G45120
ath:AT3G60580
ath:AT4G35280
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.981
排名 1 · TkA03G528250 · TK1151
细胞质0.069
排名 2 · TkA03G528250 · TK1151
细胞膜0.025
排名 3 · TkA03G528250 · TK1151
内质网0.014
排名 4 · TkA03G528250 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA03G528250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25420zf-C2H2_ZN2927-22 aa
PF02892zf-BED10-21 aa
PF12171zf-C2H2_jaz12-22 aa
PF13912zf-C2H2_613-35 aa
PF00096zf-C2H213-35 aa
PF13894zf-C2H2_414-35 aa
PF12874zf-met14-24 aa
PF29178Fs1Ya_N15-26 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G528250PF25420zf-C2H2_ZN2927220.0004121.0
TkA03G528250PF02892zf-BED10210.01316.2
TkA03G528250PF12171zf-C2H2_jaz12220.001219.7
TkA03G528250PF13912zf-C2H2_613351.3e-2383.1
TkA03G528250PF00096zf-C2H213356.98.1
TkA03G528250PF13894zf-C2H2_414356.1e-0936.5
TkA03G528250PF12874zf-met14241.5e-0629.0
TkA03G528250PF29178Fs1Ya_N15260.610.7
TkA03G528250PF23103Zf-C2H2_ZNF451_5th23320.113.1
TkA03G528250PF23455DUF71291451660.1812.3
TkA03G528250PF25420zf-C2H2_ZN2921471640.0004121.0
TkA03G528250PF02892zf-BED1481630.01316.2
TkA03G528250PF13912zf-C2H2_61511751.3e-2383.1
TkA03G528250PF13894zf-C2H2_41511736.1e-0936.5
TkA03G528250PF12874zf-met1511741.5e-0629.0
TkA03G528250PF12171zf-C2H2_jaz1511740.001219.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SIJ0拟南芥sp|Q9SIJ0|ZAT2_ARATH Zinc finger protein ZAT232.900%Swiss-Prot中等置信
O65499拟南芥sp|O65499|ZAT3_ARATH Zinc finger protein ZAT354.900%Swiss-Prot低置信
Q9M202拟南芥sp|Q9M202|ZAT9_ARATH Zinc finger protein ZAT927.900%Swiss-Prot低置信
Q681X4拟南芥sp|Q681X4|ZAT5_ARATH Zinc finger protein ZAT534.200%Swiss-Prot低置信
O22533拟南芥sp|O22533|ZAT6_ARATH Zinc finger protein ZAT629.600%Swiss-Prot低置信

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