TkA03G521240 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G521240

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 130792762-130793142 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

381 bp · TkA03G521240|TK1151|cDNA

ATGACCATTTTGACCGGAACCATCGTCGAGTACATGCGTCCAAGGGTGTTTTTCGCAGCGGCGGTGATCGGCGTCCTCACCGGCGTCGACGACTTTCTCTACGCCTGCGGAGTCTCCCGCCTCCCTGTCTCCACCACCTCCCTCATCATCGCGTCACACCTAGGATTCACCGCGTTCTTCGCGTTTCTGCTGGTGAAACAGAAATTCACGCCGTATTCGATCACGGCGTTGTATGGACTGATGTTGCCGATGGTGGAGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

381 bp · TkA03G521240|TK1151|CDS

ATGACCATTTTGACCGGAACCATCGTCGAGTACATGCGTCCAAGGGTGTTTTTCGCAGCGGCGGTGATCGGCGTCCTCACCGGCGTCGACGACTTTCTCTACGCCTGCGGAGTCTCCCGCCTCCCTGTCTCCACCACCTCCCTCATCATCGCGTCACACCTAGGATTCACCGCGTTCTTCGCGTTTCTGCTGGTGAAACAGAAATTCACGCCGTATTCGATCACGGCGTTGTATGGACTGATGTTGCCGATGGTGGAGAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

126 aa · TkA03G521240|TK1151|PROTEIN

MTILTGTIVEYMRPRVFFAAAVIGVLTGVDDFLYACGVSRLPVSTTSLIIASHLGFTAFFAFLLVKQKFTPYSITALYGLMLPMVEMTYNKAKQTITYTLVTNSGQNGHMRTILKSSRVNGAQKKI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G521240`
TK1151 ID	TkA03G521240
OH-1004 ID	LXL04_010350
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 85.714 / OH-1004 80.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G521240

位置 Chr03:130792762-130793142 (-)

描述 Similar to PUP2: Purine permease 2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g28230`	质子偶联嘌呤转运蛋白介导腺嘌呤和反式玉米素摄取。	Transport of cytokinins mediated by purine transporters of the PUP family expressed in phloem, hydathodes, and pollen of Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01700.x Recycling of pyridoxine (vitamin B6) by PUP1 in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12195
`At2g33750`	介导腺嘌呤转运。	Transport of cytokinins mediated by purine transporters of the PUP family expressed in phloem, hydathodes, and pollen of Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01700.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010350 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006863 purine nucleobase transport 生物过程

GO:0010184 cytokinin transport 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0005345 purine nucleobase transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0015211 purine nucleoside transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G28220

ath:AT1G28230

ath:AT2G33750

ath:AT4G18195

ath:AT4G18220

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.292

排名 1 · TkA03G521240 · TK1151

内质网0.249

排名 2 · TkA03G521240 · TK1151

溶酶体／液泡0.232

排名 3 · TkA03G521240 · TK1151

高尔基体0.164

排名 4 · TkA03G521240 · TK1151

细胞质0.130

排名 5 · TkA03G521240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01384PHO42-60 aa

PF16913PUNUT11-76 aa

PF00892EamA13-77 aa

PF30115PID2_N34-45 aa

PF16913PUNUT75-103 aa

PF30115PID2_N90-120 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G521240	`PF01384`	PHO4	2	60	0.04	13.7
TkA03G521240	`PF16913`	PUNUT	11	76	2.2e-21	77.1
TkA03G521240	`PF00892`	EamA	13	77	2.5e-05	25.3
TkA03G521240	`PF30115`	PID2_N	34	45	0.22	12.2
TkA03G521240	`PF16913`	PUNUT	75	103	2.2e-21	77.1
TkA03G521240	`PF30115`	PID2_N	90	120	0.22	12.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FZ96`	拟南芥	sp\|Q9FZ96\|PUP1_ARATH Purine permease 1	42.300%	Swiss-Prot	中等置信
`Q94GB1`	拟南芥	sp\|Q94GB1\|PUP2_ARATH Purine permease 2	40.900%	Swiss-Prot	中等置信

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