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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G518260
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 130002456-130004669 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1664 bp · TkA03G518260|TK1151|cDNA

GAAACTGAAACCTTCGCACATGATTAGAGCACAATATGGAGCCACGAAGCCAAAATTAAAAATGCCACCACGTTTAAGAGCCCAGCCAATGAAATGAAATCTATCCTCTTATCCATATAGCCCTAAAAACCAGTAGACAAACACACTGATCAATCCACCAATGCTATTCCTACTCGTTTAAACCTTCAACATACTCGTAAACAACCATGGCTGGATTACTAGGAACTTCTTCTGCAGCAGCAGCACTACTGAGCTCTCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1275 bp · TkA03G518260|TK1151|CDS

ATGGCTGGATTACTAGGAACTTCTTCTGCAGCAGCAGCACTACTGAGCTCTCGATCAATTTCTTCGTCCTCTTCGTCAAAGGCCTCAATTCCTGCTTTATCCTTTAATCCAGTGCATAATCAAGGCCGAAGGTTTTACGGAGGTATAGGACTTCCATCAAAGAAAGGAAGGTCCCATTTCTCGATCTCAAATGTCGCCACCGAACTCAGCCCAGCCCAAGAACAGGCACAAAAACTCTCAAAAGAAAACCAAAGACCCGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

424 aa · TkA03G518260|TK1151|PROTEIN

MAGLLGTSSAAAALLSSRSISSSSSSKASIPALSFNPVHNQGRRFYGGIGLPSKKGRSHFSISNVATELSPAQEQAQKLSKENQRPVYPFAAIVGQDEMKLCLLLNVIDPKIGGVMIMGDRGTGKSTTVRSLVDLLPEITVVQSDPFNSDPSDPESMGMEVREKLIKGEQLPTLKVKINMVDLPLGATEDRVCGTIDIEKALTEGVKAFEPGLLAKANRGILYVDEVNLLDDHLVDVLLDSAASGWNTVEREGISISHPA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G518260
TK1151 IDTkA03G518260
OH-1004 IDLXL04_010303
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G518260
位置Chr03:130002456-130004669 (-)
描述Similar to CHLI: Magnesium-chelatase subunit ChlI, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g18480 参与叶绿素生物合成。
Chlorophyll biosynthesis. Expression of a second chl I gene of magnesium chelatase in Arabidopsis supports only limited chlorophyll synthesis.2002 · DOI: 10.1104/pp.010625
An Arabidopsis mutant that is resistant to the protoporphyrinogen oxidase inhibitor acifluorfen shows regulatory changes in tetrapyrrole biosynthesis.2005 · DOI: 10.1007/s00438-005-1129-6
The CHLI1 subunit of Arabidopsis thaliana magnesium chelatase is a target protein of the chloroplast thioredoxin.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m703324200
Functional analysis of Arabidopsis thaliana isoforms of the Mg-chelatase CHLI subunit.2008 · DOI: 10.1039/b802604c
Roles of the different components of magnesium chelatase in abscisic acid signal transduction.2012 · DOI: 10.1007/s11103-012-9965-3
Mg-chelatase I subunit 1 and Mg-protoporphyrin IX methyltransferase affect the stomatal aperture in Arabidopsis thaliana.2014 · DOI: 10.1007/s10265-014-0636-0
At5g45930 参与叶绿素生物合成。
Functional analysis of Arabidopsis thaliana isoforms of the Mg-chelatase CHLI subunit.2008 · DOI: 10.1039/b802604c
Arabidopsis CHLI2 can substitute for CHLI1.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.135368

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0563300 参与叶绿素生物合成。
Rice Chlorina-1 and Chlorina-9 encode ChlD and ChlI subunits of Mg-chelatase, a key enzyme for chlorophyll synthesis and chloroplast development.2006 · DOI: 10.1007/s11103-006-9024-z
C-terminal residues of oryza sativa GUN4 are required for the activation of the ChlH subunit of magnesium chelatase in chlorophyll synthesis.2012 · DOI: 10.1016/j.febslet.2011.12.026
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010303 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0015979 photosynthesis 生物过程
GO:0015995 chlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0010007 magnesium chelatase complex 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016851 magnesium chelatase activity 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G18480
ath:AT5G45930
dosa:Os03g0563300
gmx:100784256
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.883
排名 1 · TkA03G518260 · TK1151
线粒体0.137
排名 2 · TkA03G518260 · TK1151
细胞核0.032
排名 3 · TkA03G518260 · TK1151
细胞质0.021
排名 4 · TkA03G518260 · TK1151
细胞膜0.009
排名 5 · TkA03G518260 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00735Septin55-109 aa
PF03193RsgA_GTPase69-134 aa
PF01078Mg_chelatase91-141 aa
PF20030bpMoxR93-136 aa
PF12775AAA_796-143 aa
PF13191AAA_16104-147 aa
PF13555AAA_29109-135 aa
PF07728AAA_5114-136 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G518260PF00735Septin551090.02714.5
TkA03G518260PF03193RsgA_GTPase691340.1512.5
TkA03G518260PF01078Mg_chelatase911412.1e-1144.3
TkA03G518260PF20030bpMoxR931360.0006119.6
TkA03G518260PF12775AAA_7961430.0314.6
TkA03G518260PF13191AAA_161041470.0004721.4
TkA03G518260PF13555AAA_291091350.06913.6
TkA03G518260PF07728AAA_51141364.5e-0730.7
TkA03G518260PF00158Sigma54_activat1141320.0007719.9
TkA03G518260PF05673DUF8151141340.03214.1
TkA03G518260PF00493MCM1151392.4e-0627.6
TkA03G518260PF13401AAA_221152662.1e-0525.5
TkA03G518260PF00004AAA1152890.02515.7
TkA03G518260PF00735Septin1151840.02714.5
TkA03G518260PF13173AAA_141151450.1612.7
TkA03G518260PF13671AAA_331151460.2112.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P16127拟南芥sp|P16127|CHLI1_ARATH Magnesium-chelatase subunit ChlI-1, chloroplastic77.000%Swiss-Prot高置信
Q5XF33拟南芥sp|Q5XF33|CHLI2_ARATH Magnesium-chelatase subunit ChlI-2, chloroplastic80.600%Swiss-Prot高置信
Q53RM0水稻sp|Q53RM0|CHLI_ORYSJ Magnesium-chelatase subunit ChlI, chloroplastic83.500%Swiss-Prot高置信

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