TkA03G498280 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G498280

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 125027759-125029490 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1318 bp · TkA03G498280|TK1151|cDNA

TTTCAATTCAACTAATACCTGACAATTAACCACTCTCTCTGAATTAAGCACCCAAGATGGAACCCATCTTTCTATCGCTCCTGCTTTTCCTCGTGCCTTATGCTTTTGGAGCAGAATATTCATCCTTCAATTGCATCTCCAATAAAACCACCTACACTCAAAACACTACTTACCATCTTAACCTTAATGAACTCCTGTCTTCCTTTTCCACTGAAGAAGTAGTAATCACCGATCTTTTTTCTTACAAAATCGCCGGCAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

684 bp · TkA03G498280|TK1151|CDS

ATGTACACAGGATTTAACGGTTTTGAGTGTGATCAGTGCCTTCGAAGTGGTGTGAATCGGTTGGTGAATGAGTTATGTGGTGCGAAACTTGGGGGTCGGATATCGACTCCTAGTTGTAATCTTAGATATGAAATTTATGAGTTTTACAAGTTTCCATCTTCAGATGATGGTCTGAAAGTACCATCTTCATTAACAAAAGGAAAAACCAAGACTTCATCTGTAAAATTGGCTGCCATTCTTTCTCCGATCGTCGTTTTATT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

227 aa · TkA03G498280|TK1151|PROTEIN

MYTGFNGFECDQCLRSGVNRLVNELCGAKLGGRISTPSCNLRYEIYEFYKFPSSDDGLKVPSSLTKGKTKTSSVKLAAILSPIVVLLVLVGIYFSLKVWKGRRKHVRRKDSLHGTGDVEIVNEQSLQIDLETIEAATDSFSKDKKLGEGGFGGVYEGVLPSGGKIAVKRLSKGSGQGAQEFKNEVVLLAKLQHRNLVRLLGFCLEAEEKILIYEYVPNKSLDYFLFG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G498280`
TK1151 ID	TkA03G498280
OH-1004 ID	LXL04_010102
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	99.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.357 / OH-1004 48.148 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G498280

位置 Chr03:125027759-125029490 (-)

描述 Similar to CRK25: Cysteine-rich receptor-like protein kinase 25

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g23270`	富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶19。	暂无已核实直接文献
`At4g23280`	推测的富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶20。	暂无已核实直接文献
`At4g23180`	富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 10。	暂无已核实直接文献
`At4g11480`	推测的半胱氨酸丰富受体样蛋白激酶32。	暂无已核实直接文献
`At4g23130`	参与多种不同的防御反应。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010102 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程

GO:0012501 programmed cell death 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005773 vacuole 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G05200

ath:AT4G21410

ath:AT4G23230

ath:AT4G23280

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.835

排名 1 · TkA03G498280 · TK1151

内质网0.104

排名 2 · TkA03G498280 · TK1151

细胞质0.072

排名 3 · TkA03G498280 · TK1151

细胞核0.041

排名 4 · TkA03G498280 · TK1151

溶酶体／液泡0.039

排名 5 · TkA03G498280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01657Stress-antifung9-45 aa

PF00069Pkinase140-224 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr142-225 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G498280	`PF01657`	Stress-antifung	9	45	0.031	15.6
TkA03G498280	`PF00069`	Pkinase	140	224	6.4e-13	49.4
TkA03G498280	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	142	225	8.7e-16	58.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8GWJ7`	拟南芥	sp\|Q8GWJ7\|CRK19_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 19	51.400%	Swiss-Prot	高置信
`O65479`	拟南芥	sp\|O65479\|CRK20_ARATH Putative cysteine-rich receptor-like protein kinase 20	48.500%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8GYA4`	拟南芥	sp\|Q8GYA4\|CRK10_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 10	46.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LDS6`	拟南芥	sp\|Q9LDS6\|CRK32_ARATH Putative cysteine-rich receptor-like protein kinase 32	46.000%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9C5S8`	拟南芥	sp\|Q9C5S8\|CRK5_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 5	48.900%	Swiss-Prot	中等置信

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