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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G457570
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 114205401-114208822 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2148 bp · TkA03G457570|TK1151|cDNA

CGGAGGAAGACTGCAACGACTTTCCCGGATAAACCGAGTGGCAGAAATACAGAGACTTTCAACACCGATTCCTTTCCATTCCAAATAATTGCATTTCACTCGGATTTCTTCTTTAATCATTACGCTTTCTTGATTCCATTCCATTCCACCCATCTTCTCTCCTACTCCCTTCTTTGCTCGTGATCGGGAGCTTCAATTTAGCTCTCGATCGAGCTCACCTCCTTTTCCCCTTTTGTTCCACCTCTTTCAATGGCATCATC...

CDS

下载 CDS FASTA

969 bp · TkA03G457570|TK1151|CDS

ATGGAGATGGCAGCTCAATTGAAACGGGGGATATCCCGTCAATTCTCCACGGGTTCCATGAAACTCAGCGGTAAATTCAGTTTCAAGCGTCAGAACTCTTTCGATCCACGAACGAATACGCGTTTCAGCTTTGGGCGACAATCGTCGCTTGATCCAATTCGACGTACAAGTACGAAGGATGACTTTACCCTCCCCGGAAACCTTGATTCCACCATGCAATTGCTGTTTCTAGCCTGCAAAAACGACGTTCAGGGCGTCAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

322 aa · TkA03G457570|TK1151|PROTEIN

MEMAAQLKRGISRQFSTGSMKLSGKFSFKRQNSFDPRTNTRFSFGRQSSLDPIRRTSTKDDFTLPGNLDSTMQLLFLACKNDVQGVRELLDDGVDVNSIDLDGRTALHIAACEGHVDVVQLLLSRKANIDARDRWGSTAAADSKYYGHMETYNILKARGAKVPKTRKTPMTVANPREVPEYELNPLELQIRKSDGISKGHYQVAKWNGTKVSVKILDKDSYSDPESINAFKHELTLLEKVRHPNVVQFVGAVTQNIPMMI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G457570
TK1151 IDTkA03G457570
OH-1004 IDLXL04_033403
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.826 / OH-1004 67.909
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G457570
位置Chr03:114205401-114208822 (-)
描述Similar to ILK1: Integrin-linked protein kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g43850 作为植物防御途径、应激反应和钾稳态之间的连接。 暂无已核实直接文献
At4g18950 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，通过丝氨酸和苏氨酸残基磷酸化蛋白（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
At1g14000 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能作为BRL2的适配蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g73660 作为耐盐负调节剂。
The genetic locus At1g73660 encodes a putative MAPKKK and negatively regulates salt tolerance in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1007/s11103-008-9306-8
SIS8, a putative mitogen-activated protein kinase kinase kinase, regulates sugar-resistant seedling development in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12404
At5g03730 在乙烯反应途径中充当负调节剂。
CTR1 phosphorylates the central regulator EIN2 to control ethylene hormone signaling from the ER membrane to the nucleus in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1073/pnas.1214848109
Unsaturation of very-long-chain ceramides protects plant from hypoxia-induced damages by modulating ethylene signaling in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1005143
CTR1, a negative regulator of the ethylene response pathway in Arabidopsis, encodes a member of the raf family of protein kinases.1993 · DOI: 10.1016/0092-8674(93)90119-b

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033403 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0007229 integrin-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0010182 sugar mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14000
ath:AT1G73660
ath:AT2G43850
ath:AT4G18950
ath:AT4G35780
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.499
排名 1 · TkA03G457570 · TK1151
细胞膜0.405
排名 2 · TkA03G457570 · TK1151
细胞核0.261
排名 3 · TkA03G457570 · TK1151
高尔基体0.053
排名 4 · TkA03G457570 · TK1151
线粒体0.044
排名 5 · TkA03G457570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12796Ank_272-133 aa
PF24521Ank_KRIT172-124 aa
PF13606Ank_374-97 aa
PF00023Ank75-100 aa
PF13637Ank_480-123 aa
PF13857Ank_589-139 aa
PF00023Ank102-134 aa
PF13606Ank_3102-131 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G457570PF12796Ank_2721338.9e-1452.5
TkA03G457570PF24521Ank_KRIT1721240.002318.4
TkA03G457570PF13606Ank_374977.1e-0729.7
TkA03G457570PF00023Ank751003.1e-1659.3
TkA03G457570PF13637Ank_4801231.3e-1248.3
TkA03G457570PF13857Ank_5891391.9e-0835.2
TkA03G457570PF00023Ank1021343.1e-1659.3
TkA03G457570PF13606Ank_31021317.1e-0729.7
TkA03G457570PF24521Ank_KRIT11071630.002318.4
TkA03G457570PF13637Ank_41131391.3e-1248.3
TkA03G457570PF12796Ank_21281738.9e-1452.5
TkA03G457570PF00023Ank1401613.1e-1659.3
TkA03G457570PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1963136.8e-2382.0
TkA03G457570PF13637Ank_41962061.3e-1248.3
TkA03G457570PF00023Ank1982063.1e-1659.3
TkA03G457570PF00069Pkinase2033158.7e-1968.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4IS56拟南芥sp|F4IS56|ILK1_ARATH Integrin-linked protein kinase 179.400%Swiss-Prot高置信
Q93Z30拟南芥sp|Q93Z30|BHP_ARATH Serine/threonine-protein kinase 1243.700%Swiss-Prot中等置信
Q9XI87拟南芥sp|Q9XI87|VIK_ARATH Serine/threonine-protein kinase VIK46.000%Swiss-Prot低置信
Q9C9U5拟南芥sp|Q9C9U5|SIS8_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase SIS840.700%Swiss-Prot低置信
Q05609拟南芥sp|Q05609|CTR1_ARATH Serine/threonine-protein kinase CTR141.200%Swiss-Prot低置信

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