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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G399400
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 99277028-99278066 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

987 bp · TkA03G399400|TK1151|cDNA

ATGCTCCCAAAACCCCTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCCATCTGGGTTTTGTTCGATTGTTGATTACAGACGCCGACGCCGCTTGTTCCGGTTCTGATCGAGATTCTCTGCTGTTATTCGCCGCTAACTTTCCGACCCTTAACTGGACTGCCGACGTCGATTGCTGTTCATGGGAAGGAATCGATTGTGATGATGCTGGAGATCGGGTTGTGGAGTTGTCGTTACCTGATAGAGGACTTCGTGGTGGTATCCCTTCTTCTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

987 bp · TkA03G399400|TK1151|CDS

ATGCTCCCAAAACCCCTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCCATCTGGGTTTTGTTCGATTGTTGATTACAGACGCCGACGCCGCTTGTTCCGGTTCTGATCGAGATTCTCTGCTGTTATTCGCCGCTAACTTTCCGACCCTTAACTGGACTGCCGACGTCGATTGCTGTTCATGGGAAGGAATCGATTGTGATGATGCTGGAGATCGGGTTGTGGAGTTGTCGTTACCTGATAGAGGACTTCGTGGTGGTATCCCTTCTTCTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

328 aa · TkA03G399400|TK1151|PROTEIN

MLPKPLFFLFFFHLGFVRLLITDADAACSGSDRDSLLLFAANFPTLNWTADVDCCSWEGIDCDDAGDRVVELSLPDRGLRGGIPSSLQSVTTLSLLNLSSNFLSGPLPDGLFASMNNLHTIDLSYNRLTGRLPDTLPDTLQSLNCSSNHFNGTIQDTFFRSTPNLIAFNISNNSFAGVIPRSICDSSPGLVILDFSLNDFIGIIPTGFGTIPIDIDGARSLQVLSFPGNNLTGEMDESITNLTNLRSLTLFGNSFSGDIP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G399400
TK1151 IDTkA03G399400
OH-1004 IDLXL04_009120
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 50.915 / OH-1004 15.966
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G399400
位置Chr03:99277028-99278066 (-)
描述Similar to PSY1R: Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g17240 参与CLV3及CLV3样肽的感知，这些肽作为调节分生组织维护的细胞外信号。
Functional analyses of the CLAVATA2-like proteins and their domains that contribute to CLAVATA2 specificity.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.148197
At1g17250 参与CLV3及CLV3样肽的感知，这些肽作为调控分生组织维持的细胞外信号（通过相似性推测）。
RESISTANCE TO FUSARIUM OXYSPORUM 1, a dominant Arabidopsis disease-resistance gene, is not race specific.2005 · DOI: 10.1534/genetics.105.042218
Arabidopsis thaliana resistance to fusarium oxysporum 2 implicates tyrosine-sulfated peptide signaling in susceptibility and resistance to root infection.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003525
At2g01820 参与生长素信号转导及细胞膨胀与增殖调控。 暂无已核实直接文献
At4g13880 在根毛发育中起作用。
Uncovering genes and ploidy involved in the high diversity in root hair density, length and response to local scarce phosphate in Arabidopsis thaliana.2015 · DOI: 10.1371/journal.pone.0120604
At1g71390 参与CLV3及CLV3样肽的感知，这些肽作为调节分生组织维护的细胞外信号。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009120 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010073 meristem maintenance 生物过程
GO:0031347 regulation of defense response 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0045851 pH reduction 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17240
ath:AT1G72300
ath:AT2G02220
ath:AT5G53890
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.753
排名 1 · TkA03G399400 · TK1151
内质网0.108
排名 2 · TkA03G399400 · TK1151
细胞质0.071
排名 3 · TkA03G399400 · TK1151
细胞核0.054
排名 4 · TkA03G399400 · TK1151
细胞外0.052
排名 5 · TkA03G399400 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_231-63 aa
PF29594LRR_SKP268-171 aa
PF00560LRR_170-89 aa
PF24141LRR_ComC79-158 aa
PF12799LRR_483-102 aa
PF13855LRR_884-128 aa
PF27087LRR_TMOD-LMOD85-121 aa
PF13855LRR_892-150 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G399400PF08263LRRNT_231632.1e-0525.4
TkA03G399400PF29594LRR_SKP2681710.211.6
TkA03G399400PF00560LRR_170892e-1966.2
TkA03G399400PF24141LRR_ComC791583.9e-0524.2
TkA03G399400PF12799LRR_4831026.2e-0936.5
TkA03G399400PF13855LRR_8841282e-1453.8
TkA03G399400PF27087LRR_TMOD-LMOD851210.1412.5
TkA03G399400PF13855LRR_8921502e-1453.8
TkA03G399400PF12799LRR_4921286.2e-0936.5
TkA03G399400PF00560LRR_1931112e-1966.2
TkA03G399400PF08263LRRNT_2941072.1e-0525.4
TkA03G399400PF00560LRR_11171362e-1966.2
TkA03G399400PF12799LRR_41171546.2e-0936.5
TkA03G399400PF23598LRR_141381984.9e-1039.4
TkA03G399400PF27087LRR_TMOD-LMOD1381580.1412.5
TkA03G399400PF13855LRR_81391852e-1453.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SHI3拟南芥sp|Q9SHI3|RLP2_ARATH Receptor-like protein 248.600%Swiss-Prot低置信
Q9SHI4拟南芥sp|Q9SHI4|RLP3_ARATH Receptor-like protein 345.600%Swiss-Prot低置信
Q9SIT1拟南芥sp|Q9SIT1|TMK3_ARATH Receptor-like kinase TMK341.400%Swiss-Prot低置信
F4JTU7拟南芥sp|F4JTU7|RLP48_ARATH Receptor-like protein 4837.400%Swiss-Prot低置信
Q9C9H6拟南芥sp|Q9C9H6|RLP11_ARATH Receptor-like protein 1136.400%Swiss-Prot低置信

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