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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G371980
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 91766513-91773285 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3375 bp · TkA03G371980|TK1151|cDNA

GTTATTAAAAGTTTGAGTGAGATACTAACAAGATGTCGCCGTTTACCTCCGTTAATAAGCCGCTAATGGAACCTATCTAAATAATCATCTCCAAAGGCCACGCCGGCCAGAACTCCGGCTTCGCTTCCCCTCAAAATTCACAGAGTAACTTCGTCTTCAGTTCGGAAGAGCGCTCAATTCTTTGCCTATTTCTTTCTGCTACATTTCTGAGAGCTCAATGTTGACAAGTATTCACTGAGGATGACGACATCATGAGATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2601 bp · TkA03G371980|TK1151|CDS

ATGGCATCTCAATGTATATTCGCTTCGTCGTTGTTCCCCTCAACTTCCTTATCACGTCGACTACAATCTCGAAGAATTAGACGCTTACCTAACGCTAATTCATCAATTACATGTCACCTAAATAACTCAGAAGCCGAAGAAGAATCCAAAAACAAGATAAACGCATTGAATTTGCTCCAAATCTCTGTAACCCTAACCGTAATATCGGCTTCACTACCCCAGCCCGTATTAGCAGCAGCCAAAGTTACACAAAAGAAGCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

866 aa · TkA03G371980|TK1151|PROTEIN

MASQCIFASSLFPSTSLSRRLQSRRIRRLPNANSSITCHLNNSEAEEESKNKINALNLLQISVTLTVISASLPQPVLAAAKVTQKKRPPKKTHTLTPEELKAWSQGLPVVANRIPYTDILNLKRDGKLKHIIKPPGRGLKERPVVVLAVLEDSKVVRLVLPSIDIDDKFWESWDAMEIDSICVQAYTPPVKMPEVPRPYLGFLAQFPSWMFSQAKPKPVSKKVLELRKAREELKRSRSNEMLNSKREMAKMEKAMRAQKK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G371980
TK1151 IDTkA03G371980
OH-1004 IDLXL04_008438
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)95.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.769
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G371980
位置Chr03:91766513-91773285 (-)
描述Similar to FTSHI2: Probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 2, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g16290 在胚胎发生期间对质体发育必需。
FtsHi4 is essential for embryogenesis due to its influence on chloroplast development in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1371/journal.pone.0099741

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008438 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0030163 protein catabolic process 生物过程
GO:0045037 protein import into chloroplast stroma 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0062091 Ycf2/FtsHi complex 细胞组分
GO:0004176 ATP-dependent peptidase activity 分子功能
GO:0004222 metalloendopeptidase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G16290
cyb:CYB_0631
pak:HMPREF0675_3307
sth:STH3198
syn:slr1604
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.828
排名 1 · TkA03G371980 · TK1151
线粒体0.133
排名 2 · TkA03G371980 · TK1151
细胞核0.049
排名 3 · TkA03G371980 · TK1151
细胞质0.024
排名 4 · TkA03G371980 · TK1151
细胞膜0.018
排名 5 · TkA03G371980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13207AAA_17201-238 aa
PF18699MRPL52201-277 aa
PF28285RcgA211-296 aa
PF00694Aconitase_C222-289 aa
PF13521AAA_28232-274 aa
PF06512Na_trans_assoc235-369 aa
PF13238AAA_18240-341 aa
PF13207AAA_17240-285 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G371980PF13207AAA_172012380.4111.7
TkA03G371980PF18699MRPL522012775.88.0
TkA03G371980PF28285RcgA2112962.57.4
TkA03G371980PF00694Aconitase_C2222892.29.3
TkA03G371980PF13521AAA_282322741.210.0
TkA03G371980PF06512Na_trans_assoc2353690.3611.8
TkA03G371980PF13238AAA_182403410.01816.2
TkA03G371980PF13207AAA_172402850.4111.7
TkA03G371980PF11947DUF34642433194.7e-0523.9
TkA03G371980PF07728AAA_52532840.008816.8
TkA03G371980PF07724AAA_22592710.03714.8
TkA03G371980PF13191AAA_164445020.002219.2
TkA03G371980PF13401AAA_224464750.0002122.3
TkA03G371980PF05496RuvB_N4464800.0002621.5
TkA03G371980PF06068TIP494464820.001218.8
TkA03G371980PF00004AAA4475791.4e-42145.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
A8MPR5拟南芥sp|A8MPR5|FTSI2_ARATH Probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 2, chloroplastic73.300%Swiss-Prot高置信

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