TkA03G366870 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G366870

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 90501380-90504742 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2500 bp · TkA03G366870|TK1151|cDNA

TTTTGGTCCGTAAAGGGCGAATCTGATGGGAGATATAGCAGGACTCCCGTTGAAATCGATTGAGATTTCAGTCGTCCAAACCTCAAATAGAAAGAAACACAAGCGAATCTATCATAATCCCAAATGATGGGGTTTGCAATGGGAAGTTCATCTCCTTTACACTCCTCAACTTATCACTCTATTTTCCCATCTTTTTCTTCATCTTCGCAGCCCCTTTTCTTCCACTCTTGCCAAAGAAAACCACATGATTTCAGTAAGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

867 bp · TkA03G366870|TK1151|CDS

ATGATGGGGTTTGCAATGGGAAGTTCATCTCCTTTACACTCCTCAACTTATCACTCTATTTTCCCATCTTTTTCTTCATCTTCGCAGCCCCTTTTCTTCCACTCTTGCCAAAGAAAACCACATGATTTCAGTAAGAAAAGAAAAGTTCAGGCCTGTATGCAACACCATGAACCCAACGAAGACAACTTCTGCCAGAGAAGAGTGATTCTCTTCATGGGTGCTTCCGTTCTTCCGTTCTTGAATTTAAAATCAAGAGCTGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

288 aa · TkA03G366870|TK1151|PROTEIN

MMGFAMGSSSPLHSSTYHSIFPSFSSSSQPLFFHSCQRKPHDFSKKRKVQACMQHHEPNEDNFCQRRVILFMGASVLPFLNLKSRAAENSAPDELEDSARAQERSQMAEVSTNGDSTPNPFLTLSSGLGIVASGVLGAFYALAQKEKSANMLTIESMTTKLVEKEAAIVSMQKSFESKLQTEKEEKNEQLKKSNQEKQSLMSQLSSANSTVKGLGQELQKENKVIQDLQNQIDGLNADLKKAFDDKEDLKLQVKDKLFSI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G366870`
TK1151 ID	TkA03G366870
OH-1004 ID	LXL04_008490
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	89.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 98.611 / OH-1004 38.639 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA03G366870`
位置	Chr03:90501380-90504742 (-)
描述	Similar to MFP1-1: MAR-binding filament-like protein 1-1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_008490` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0007155 cell adhesion 生物过程 GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0009888 tissue development 生物过程 GO:0010581 regulation of starch biosynthetic process 生物过程 GO:0019252 starch biosynthetic process 生物过程 GO:0030334 regulation of cell migration 生物过程 GO:0045785 positive regulation of cell adhesion 生物过程 GO:0045995 regulation of embryonic development 生物过程 GO:0110011 regulation of basement membrane organization 生物过程 GO:2001046 positive regulation of integrin-mediated signaling pathway 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005604 basement membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	ath:AT3G16000 hsa:3908 mmu:16773 nta:107792739 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.973

排名 1 · TkA03G366870 · TK1151

线粒体0.029

排名 2 · TkA03G366870 · TK1151

细胞核0.026

排名 3 · TkA03G366870 · TK1151

细胞质0.015

排名 4 · TkA03G366870 · TK1151

细胞膜0.011

排名 5 · TkA03G366870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF21521MYO6_lever48-66 aa

PF17082Spc2975-110 aa

PF29336ATG33122-235 aa

PF08614ATG16122-244 aa

PF19842YqeC138-220 aa

PF28869LMNTD2_N144-223 aa

PF11559ADIP147-232 aa

PF08702Fib_alpha147-180 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G366870	`PF21521`	MYO6_lever	48	66	0.24	12.5
TkA03G366870	`PF17082`	Spc29	75	110	1.1	9.7
TkA03G366870	`PF29336`	ATG33	122	235	1.3	9.7
TkA03G366870	`PF08614`	ATG16	122	244	2.1	9.2
TkA03G366870	`PF19842`	YqeC	138	220	0.26	12.2
TkA03G366870	`PF28869`	LMNTD2_N	144	223	0.51	11.6
TkA03G366870	`PF11559`	ADIP	147	232	0.0029	18.4
TkA03G366870	`PF08702`	Fib_alpha	147	180	2.4	9.1
TkA03G366870	`PF27636`	CCPG1_N	147	237	2.8	9.2
TkA03G366870	`PF25443`	ANG-1	150	237	4.4	8.2
TkA03G366870	`PF21521`	MYO6_lever	152	241	0.24	12.5
TkA03G366870	`PF24627`	PUMA_CC	154	178	0.002	18.8
TkA03G366870	`PF30378`	CEP135_TSGA10_CC	154	284	0.02	14.0
TkA03G366870	`PF30677`	CCDC18_1st	155	247	0.0047	16.9
TkA03G366870	`PF02601`	Exonuc_VII_L	155	246	0.17	12.1
TkA03G366870	`PF14362`	DUF4407	157	273	0.13	12.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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