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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G354520
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 87435843-87439668 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2025 bp · TkA03G354520|TK1151|cDNA

GATTACCATAATTTACAAATTTTTTTTTATAAATAAATATAATAGAACAATACATTTGACTTTAAGAGAAAAGAAAACTTCCTTTTCCTTGGCTTACCCCGCGTCTTTCCTTCGGTCTCATTTTCCATATGCCGTGGAATGCCCGCCTCTCCAAATCTTGATTTTCCGGTGATCATAACTATACTTCCCAACCACCACCACCACCACCACGGAACAAGAAATTAAAACCTACCTCCACCATGGGCAACTGCACCACCTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

918 bp · TkA03G354520|TK1151|CDS

ATGGACCAGAGGTTGATATATGGAGTGCCGGAGTTATTCTGTATATTGTTATGTGGGGTTCCTCCCTTCTGGGCAGAAACGGAACAAGGTGTCGCGTTGTCAATTCTGCGAGGTGTTATTGATTTCAAGAGGGAGCCGTGGCCTCAAATTTCTGAAAATGCTAAAAGTCTTGTAAAACAAATGTTAGAGCCCGATCCCAAGAAACGGTTAACTGCCCAACAAGTTCTAGAACATCCATGGGTATTGAATGAGAAGAGAGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

305 aa · TkA03G354520|TK1151|PROTEIN

MDQRLIYGVPELFCILLCGVPPFWAETEQGVALSILRGVIDFKREPWPQISENAKSLVKQMLEPDPKKRLTAQQVLEHPWVLNEKRASNVPLGDIVRTRLKQFSIMNRFKKKALRVIAEHLSIEEVEVIRDMFKLMDSDGDGKVTFDELRAGLKKVGSQLAEPEIKLLMDVADVDGNGVLEYGEFVAVTIHLQKMENDEHFRKAFMFFDKDGSGFIELDELEQVLADDSGQADMDVLNEIMKEVDTDKDGQISYDEFVAM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G354520
TK1151 IDTkA03G354520
OH-1004 IDLXL04_008599
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)96.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.361 / OH-1004 28.329
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G354520
位置Chr03:87435843-87439668 (-)
描述Similar to CPK30: Calcium-dependent protein kinase 30
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g18890 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
Two genes that encode Ca(2+)-dependent protein kinases are induced by drought and high-salt stresses in Arabidopsis thaliana.1994 · DOI: 10.1007/bf00286684
At1g74740 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0688300 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用（通过相似性）。
A rice calcium-dependent protein kinase OsCPK9 positively regulates drought stress tolerance and spikelet fertility.2014 · DOI: 10.1186/1471-2229-14-133
Os01g0832300 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os05g0467000 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008599 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:1902584 positive regulation of response to water deprivation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18890
ath:AT1G74740
ath:AT3G51850
dosa:Os01g0832300
dosa:Os03g0688300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.421
排名 1 · TkA03G354520 · TK1151
细胞膜0.413
排名 2 · TkA03G354520 · TK1151
细胞核0.228
排名 3 · TkA03G354520 · TK1151
高尔基体0.100
排名 4 · TkA03G354520 · TK1151
内质网0.085
排名 5 · TkA03G354520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase12-81 aa
PF24984HEAT_EF3_GNC1105-169 aa
PF23564EF-hand_FSTL1109-155 aa
PF10591SPARC_Ca_bdg116-186 aa
PF25578EF-hand_STIM1123-149 aa
PF30624EF_SSP120124-148 aa
PF21008AIF-1124-189 aa
PF25825SAPC2_N125-188 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G354520PF00069Pkinase12811.2e-1248.5
TkA03G354520PF24984HEAT_EF3_GNC11051690.02615.4
TkA03G354520PF23564EF-hand_FSTL11091552.5e-0731.8
TkA03G354520PF10591SPARC_Ca_bdg1161860.00219.2
TkA03G354520PF25578EF-hand_STIM11231490.01116.6
TkA03G354520PF30624EF_SSP1201241482.4e-0628.8
TkA03G354520PF21008AIF-11241892.8e-0628.4
TkA03G354520PF25825SAPC2_N1251887.4e-1039.3
TkA03G354520PF13833EF-hand_81261496.9e-1555.2
TkA03G354520PF13499EF-hand_71271882.1e-29102.4
TkA03G354520PF00036EF-hand_11291557.1e-32107.3
TkA03G354520PF13405EF-hand_61291576.5e-2585.1
TkA03G354520PF13202EF-hand_51291511.2e-2175.8
TkA03G354520PF24548EF_EFCAB10_C1291590.0008919.6
TkA03G354520PF12763EH1301883e-0731.0
TkA03G354520PF22592FCaBP_EF-hand1301560.008317.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M9V8拟南芥sp|Q9M9V8|CDPKA_ARATH Calcium-dependent protein kinase 1076.700%Swiss-Prot高置信
Q9SSF8拟南芥sp|Q9SSF8|CDPKU_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3076.300%Swiss-Prot高置信
Q6AVI8水稻sp|Q6AVI8|CDPK9_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 970.600%Swiss-Prot高置信
Q8LPZ7水稻sp|Q8LPZ7|CDPK3_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 367.100%Swiss-Prot高置信
Q6I5I8水稻sp|Q6I5I8|CDPKG_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1665.700%Swiss-Prot高置信

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