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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA03G352970
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 86949303-86952102 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1780 bp · TkA03G352970|TK1151|cDNA

TCATAGCTTACATAGCACAACACCACTCACTAAACCCCACCATTCGCTTCTCTTCCCTCTGTCTTGACTGTCTTTGTGTAAAAGCGTATTCGCTACACCTGCTTTAAATTTGAATCCTTTTTATGTTCCAATTTATGGCACCCATTTGAAAAAAAGGGAATCATCGTTCTTACACCAACAAACCTAAATGGGTACGAATTTGGTATTGATTTGGGTTTTCTCAGCTGTTTTTGTAGCAACTATCCTTTTCAGCACATGTT...

888 bp · TkA03G352970|TK1151|CDS

ATGAAAGGAGCACTATTAATCGCTTTAATGACTGCTTTAGGCCTGGCAGTTGTGCTCTTTGTATTCCTTCTGGTTTTTATGCTCTCAAAGAAAGAACGCGCGGCAAAAAAATACGTAGTTGTCAAAAAACAAGTTCATCAAGAAACAAGCACACAACTTATAACATTCCATGGCGACCTTCCATACCCATCAAGCGAAATCATAGAAAAGCTCGAGTCTCTTGATGACGAACATGTCGTTGGCGCCGGTGGATTTGGGAC...

296 aa · TkA03G352970|TK1151|PROTEIN

MKGALLIALMTALGLAVVLFVFLLVFMLSKKERAAKKYVVVKKQVHQETSTQLITFHGDLPYPSSEIIEKLESLDDEHVVGAGGFGTVYRMVMNDCGTFAVKRIERSREGRDQAFERELEILGSVKHINLVNLRGYCRFPDSKLLIYDYMAMGSLENFLHECREGDETLNWNTRLKVAYGSARGLAYLHHDCSPRIVHRDIKSSNILLDENLEPCVSDFGLAKLLVDEDAHVTTVVAGTFGYLAPEYLQSGRATVKSDVY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G352970
TK1151 IDTkA03G352970
OH-1004 IDLXL04_008616
关系 / 置信度序列支持,注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.311 / OH-1004 48.179
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G352970
位置Chr03:86949303-86952102 (-)
描述Similar to FEI1: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FEI 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g31420 参与细胞壁功能和纤维素生物合成相关的信号转导;该信号可能涉及1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC,乙烯前体)。
At2g35620 参与细胞壁功能和纤维素生物合成相关的信号转导;该信号可能涉及1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC,乙烯前体)。
At1g78530 类受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g78530。 暂无已核实直接文献
At5g07280 具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的受体,决定雄性孢原细胞起始细胞的正确数量,并进一步决定绒毡层和中间层细胞的特性。 暂无已核实直接文献
At4g39400 受体具有双重特异性激酶活性,作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0203800 参与调节耐热性的受体激酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_008616 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0007639 homeostasis of number of meristem cells 生物过程
GO:0009664 plant-type cell wall organization 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0010088 phloem development 生物过程
GO:0010192 mucilage biosynthetic process 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0048354 mucilage biosynthetic process involved in seed coat development 生物过程
GO:0048653 anther development 生物过程
GO:1901653 cellular response to peptide 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31420
ath:AT2G23950
ath:AT2G35620
dosa:Os08g0174700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.744
排名 1 · TkA03G352970 · TK1151
细胞质0.178
排名 2 · TkA03G352970 · TK1151
细胞核0.134
排名 3 · TkA03G352970 · TK1151
内质网0.063
排名 4 · TkA03G352970 · TK1151
高尔基体0.033
排名 5 · TkA03G352970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10960Holin_BhlA7-37 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr32-51 aa
PF00069Pkinase48-48 aa
PF03109ABC172-123 aa
PF00069Pkinase77-276 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr77-276 aa
PF01636APH88-122 aa
PF12633Adenyl_cycl_N98-169 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G352970PF10960Holin_BhlA7370.1412.9
TkA03G352970PF07714PK_Tyr_Ser-Thr32511.3e-42146.6
TkA03G352970PF00069Pkinase48481.6e-44153.0
TkA03G352970PF03109ABC1721230.008116.1
TkA03G352970PF00069Pkinase772761.6e-44153.0
TkA03G352970PF07714PK_Tyr_Ser-Thr772761.3e-42146.6
TkA03G352970PF01636APH881220.01615.7
TkA03G352970PF12633Adenyl_cycl_N981690.3411.6
TkA03G352970PF14531Kinase-like1512500.2211.4
TkA03G352970PF01636APH1862230.01615.7
TkA03G352970PF03109ABC11892250.008116.1
TkA03G352970PF17667Pkinase_fungal1952620.009815.4
TkA03G352970PF03109ABC12552790.008116.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGF4拟南芥sp|C0LGF4|FEI1_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FEI 166.500%Swiss-Prot高置信
C0LGL9拟南芥sp|C0LGL9|FEI2_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FEI 265.700%Swiss-Prot高置信
Q9SYM9拟南芥sp|Q9SYM9|Y1853_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g7853055.300%Swiss-Prot高置信
Q9LYN8拟南芥sp|Q9LYN8|EMS1_ARATH Leucine-rich repeat receptor protein kinase EMS153.500%Swiss-Prot高置信
O22476拟南芥sp|O22476|BRI1_ARATH Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 150.200%Swiss-Prot高置信
Q69SP5水稻sp|Q69SP5|EREC1_ORYSJ LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ER140.600%Swiss-Prot中等置信

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