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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G344820
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 84855077-84856549 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1254 bp · TkA03G344820|TK1151|cDNA

ATGTCGAATTTGATCCAAGAAACTGATCAAGAATTGAAGAAACACTCATGTAAGCTGTGCGATAAGAGCTTCCCTTCTGGTAGATCGTTAGGAGGTCACATGCGGTCTCACGTGATCAACTCCCCCGATCATCATCATCAACAACAGAAACAGATGAAGAAATTGTCTTCCGTCGGCAATGGCGGAAAATCAACGAAGAACGATACTTGTTACGAGCTACGCAAAGATCCAAAAAAGACTCCGAAAGTCAAAGATTCAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1254 bp · TkA03G344820|TK1151|CDS

ATGTCGAATTTGATCCAAGAAACTGATCAAGAATTGAAGAAACACTCATGTAAGCTGTGCGATAAGAGCTTCCCTTCTGGTAGATCGTTAGGAGGTCACATGCGGTCTCACGTGATCAACTCCCCCGATCATCATCATCAACAACAGAAACAGATGAAGAAATTGTCTTCCGTCGGCAATGGCGGAAAATCAACGAAGAACGATACTTGTTACGAGCTACGCAAAGATCCAAAAAAGACTCCGAAAGTCAAAGATTCAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

417 aa · TkA03G344820|TK1151|PROTEIN

MSNLIQETDQELKKHSCKLCDKSFPSGRSLGGHMRSHVINSPDHHHQQQKQMKKLSSVGNGGKSTKNDTCYELRKDPKKTPKVKDSSEIENNNSCLVVLDKLCKECGKGFQSWKALFGHMKCHSEKVANNNNLNHDSWTGQSDNENSRPIKKSKSRNGKIKRYKVTSVTTTTITTTSSSISINANNNNNTSTSVVSEIEQDQESEIAMCLMMLSRDEGKWGNEFESSDQEFNDESELVFGSKRKFECITCNKSFDSYQAL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G344820
TK1151 IDTkA03G344820
OH-1004 IDLXL04_008680
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G344820
位置Chr03:84855077-84856549 (+)
描述Similar to ZAT9: Zinc finger protein ZAT9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g60580 可能参与应激反应的转录因子。 暂无已核实直接文献
At4g35280 介导DUO1对男性生殖细胞分裂的调控。
An EAR-Dependent Regulatory Module Promotes Male Germ Cell Division and Sperm Fertility in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.124743
At3g19580 转录阻遏蛋白参与非生物胁迫条件下植物生长的抑制。
Functional identification of an Arabidopsis snf4 ortholog by screening for heterologous multicopy suppressors of snf4 deficiency in yeast.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00809.x
Arabidopsis Cys2/His2-type zinc-finger proteins function as transcription repressors under drought, cold, and high-salinity stress conditions.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.046599
Mapping methyl jasmonate-mediated transcriptional reprogramming of metabolism and cell cycle progression in cultured Arabidopsis cells.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0711203105
Arabidopsis zinc-finger protein 2 is a negative regulator of ABA signaling during seed germination.2010 · DOI: 10.1016/j.jplph.2010.05.010
Arabidopsis Cys2/His2 zinc-finger proteins AZF1 and AZF2 negatively regulate abscisic acid-repressive and auxin-inducible genes under abiotic stress conditions.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182683
Gene network analysis and functional studies of senescence-associated genes reveal novel regulators of Arabidopsis leaf senescence.2012 · DOI: 10.1111/j.1744-7909.2012.01136.x
At2g28200 可能参与应激反应的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g04340 可能的转录因子，调节根部发育以及磷酸盐 获取和稳态。
Phosphate homeostasis and root development in Arabidopsis are synchronized by the zinc finger transcription factor ZAT6.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.101691

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008680 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0048235 pollen sperm cell differentiation 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0071731 response to nitric oxide 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G02030
ath:AT2G45120
ath:AT3G46080
ath:AT3G60580
ath:AT4G35280
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.984
排名 1 · TkA03G344820 · TK1151
细胞质0.062
排名 2 · TkA03G344820 · TK1151
细胞膜0.021
排名 3 · TkA03G344820 · TK1151
内质网0.011
排名 4 · TkA03G344820 · TK1151
质体0.008
排名 5 · TkA03G344820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12756zf-C2H2_23-51 aa
PF27966ZNF4287-37 aa
PF25420zf-C2H2_ZN2928-24 aa
PF23455DUF712913-22 aa
PF12171zf-C2H2_jaz14-37 aa
PF13912zf-C2H2_615-37 aa
PF13894zf-C2H2_415-37 aa
PF00096zf-C2H215-37 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G344820PF12756zf-C2H2_23511e-0629.6
TkA03G344820PF27966ZNF4287370.3611.7
TkA03G344820PF25420zf-C2H2_ZN2928240.1512.9
TkA03G344820PF23455DUF712913220.7110.4
TkA03G344820PF12171zf-C2H2_jaz14377.1e-0936.3
TkA03G344820PF13912zf-C2H2_615379e-40134.6
TkA03G344820PF13894zf-C2H2_415372.3e-1453.4
TkA03G344820PF00096zf-C2H215371.4e-0835.4
TkA03G344820PF12874zf-met16371.3e-0835.5
TkA03G344820PF25299ZZ_ADA216370.02215.6
TkA03G344820PF08790zf-LYAR16260.2312.1
TkA03G344820PF18112Zn-C2H2_1217270.001120.0
TkA03G344820PF22034B129_C2H2-zf17240.1213.4
TkA03G344820PF23103Zf-C2H2_ZNF451_5th17314.77.8
TkA03G344820PF15909zf-C2H2_818390.03915.0
TkA03G344820PF23101Zf-C2H2_ZNF451_1st20350.003917.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M202拟南芥sp|Q9M202|ZAT9_ARATH Zinc finger protein ZAT925.600%Swiss-Prot低置信
O65499拟南芥sp|O65499|ZAT3_ARATH Zinc finger protein ZAT330.400%Swiss-Prot中等置信
Q9SSW2拟南芥sp|Q9SSW2|AZF2_ARATH Zinc finger protein AZF230.000%Swiss-Prot低置信
Q681X4拟南芥sp|Q681X4|ZAT5_ARATH Zinc finger protein ZAT532.400%Swiss-Prot低置信
O22533拟南芥sp|O22533|ZAT6_ARATH Zinc finger protein ZAT635.800%Swiss-Prot低置信

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