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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G344780
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 84838849-84844046 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1353 bp · TkA03G344780|TK1151|cDNA

TTTGGACTAAATTGGCGTTGCGTTTTGGCGCGTCATGTGGGCCATCCTATCACGGTGCGCGCCATATCATCGGCGCAACTCCCAACCCGATCAAAAGTCTTCGCTATTTTCGTCATCATATTCATCGCCGTAGACGTCTTCTTCAACCCACTTCGAACGACTCCACTTTCTTCAACCTACAAAACTCCTAATTTTGTTGACTTCTCTTTCCGATTAATATTCCTCCGACCAAATTGTAAGACCTCTCCGTCGCGATTAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1059 bp · TkA03G344780|TK1151|CDS

TTTGGACTAAATTGGCGTTGCGTTTTGGCGCGTCATGTGGGCCATCCTATCACGGTGCGCGCCATATCATCGGCGCAACTCCCAACCCGATCAAAAGTCTTCGCTATTTTCGTCATCATATTCATCGCCGTAGACGTCTTCTTCAACCCACTTCGAACGACTCCACTTTCTTCAACCTACAAAACTCCTAATTTTGTTGACTTCTCTTTCCGATTAATATTCCTCCGACCAAATTGTAAGACCTCTCCGTCGCGATTAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

352 aa · TkA03G344780|TK1151|PROTEIN

FGLNWRCVLARHVGHPITVRAISSAQLPTRSKVFAIFVIIFIAVDVFFNPLRTTPLSSTYKTPNFVDFSFRLIFLRPNCKTSPSRLIRRWRMGCFASKSADSKASRLSRWRATGIVALRDGKLKSFPDEVLELDKSVRTLDLTHNKLVDVPEEISKLINMQRLILANNVIERLPMNLGKLKSLKFIILDGNKLTTLPDEVGQLVRLERLSISGNLLTGLPETIGSLRNLLLLNVSSNKIKSLPESIGSCFSLEELQANEN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G344780
TK1151 IDTkA03G344780
OH-1004 IDLXL04_008682
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.727 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G344780
位置Chr03:84838849-84844046 (+)
描述Similar to IRL7: Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g30105 含LRR重复和泛素样结构域蛋白 At2g30105。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0212200 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 暂无已核实直接文献
Os10g0456200 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008682 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G30105
dosa:Os03g0212200
dosa:Os10g0456200
xla:432302
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.489
排名 1 · TkA03G344780 · TK1151
细胞核0.282
排名 2 · TkA03G344780 · TK1151
细胞膜0.140
排名 3 · TkA03G344780 · TK1151
高尔基体0.113
排名 4 · TkA03G344780 · TK1151
线粒体0.110
排名 5 · TkA03G344780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00560LRR_145-56 aa
PF23598LRR_14118-184 aa
PF08653DASH_Dam1122-155 aa
PF12799LRR_4135-171 aa
PF13855LRR_8136-193 aa
PF00560LRR_1136-157 aa
PF23286LRR_13137-203 aa
PF24048LRR_NXF1-5139-195 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G344780PF00560LRR_145565.2e-1347.1
TkA03G344780PF23598LRR_141181844.5e-2382.3
TkA03G344780PF08653DASH_Dam11221550.05214.1
TkA03G344780PF12799LRR_41351711.1e-1557.9
TkA03G344780PF13855LRR_81361937.7e-1967.9
TkA03G344780PF00560LRR_11361575.2e-1347.1
TkA03G344780PF23286LRR_131372030.1112.9
TkA03G344780PF24048LRR_NXF1-51391950.1212.7
TkA03G344780PF23211LRR_LRWD11512163.3e-0524.4
TkA03G344780PF12799LRR_41591971.1e-1557.9
TkA03G344780PF00560LRR_11591805.2e-1347.1
TkA03G344780PF23598LRR_141762564.5e-2382.3
TkA03G344780PF23211LRR_LRWD11772393.3e-0524.4
TkA03G344780PF13306LRR_51801880.0314.9
TkA03G344780PF00560LRR_11822035.2e-1347.1
TkA03G344780PF08653DASH_Dam11922250.05214.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P0C895拟南芥sp|P0C895|Y2010_ARATH LRR repeats and ubiquitin-like domain-containing protein At2g3010542.600%Swiss-Prot低置信
B9F655水稻sp|B9F655|PIRL7_ORYSJ Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 777.800%Swiss-Prot高置信
Q7XDQ7水稻sp|Q7XDQ7|PIRL8_ORYSJ Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 841.400%Swiss-Prot低置信

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