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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G344420
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 84729493-84733237 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3114 bp · TkA03G344420|TK1151|cDNA

GCCCGCACTGCTTCAATTCCAGATGTCTCTCGTCGCCTTCAACATGTGTATAAAGCGTTTCGTCACTTCTCTCATCCATCAATTGGAAAAAATCTCCAAATACGTGAGTAAATTCGCACAAGCAAATCTTCATAGAAACGCACTCATACTCGCTAGTTCGAGTCGTTTGATTCTGATTGGTTTCGTACGCCGTTGAAGGAACATTTTAAGGTTTATACGAGTCATTATCCGAAATGAATCCCGACAAATTCACCCACAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2286 bp · TkA03G344420|TK1151|CDS

ATGAATCCCGACAAATTCACCCACAAGACAAACGAGGCGTTGGCTTCAGGCCATGAACTCGCAATGAATGCCGGACACGCCCAATTCACACCGCTACATATTGCAGCAGCTCTAATCTCCGACCCTAACGGCATATTCCGGCAAGCAGTAAGCAATGCCGGCGGTGAAGAAGCAGGCAATTCAGCCGAGAGGGTTTTCAATCAAGCATTGAAGAAACTTCCTTCCCAGTCCCCTGCTCCTGACGAAGTTCCAGCAAGTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

761 aa · TkA03G344420|TK1151|PROTEIN

MNPDKFTHKTNEALASGHELAMNAGHAQFTPLHIAAALISDPNGIFRQAVSNAGGEEAGNSAERVFNQALKKLPSQSPAPDEVPASTSLIKTIRRAQSSQKSRGDTHLAVDQLILGLLEDSQISELLKESGVGASRVKSEVEKLRGKEGKKVESASGDTNFQALKTYGRDLVEQAGKLDPVIGRDEEIRRVIRILSRRTKNNPVLIGEPGVGKTAVVEGLAQRILRGDVPSNLADVRVVALDMGALIAGAKYRGEFEERL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G344420
TK1151 IDTkA03G344420
OH-1004 IDLXL04_008691
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.606 / OH-1004 83.114
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G344420
位置Chr03:84729493-84733237 (-)
描述Similar to CLPB1: Chaperone protein ClpB1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g74310 在耐热性中发挥重要作用的分子伴侣。
Heat shock protein 101 plays a crucial role in thermotolerance in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.4.479
Mutants of Arabidopsis thaliana defective in the acquisition of tolerance to high temperature stress.2000 · DOI: 10.1073/pnas.97.8.4392
Hsp101 is necessary for heat tolerance but dispensable for development and germination in the absence of stress.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01066.x
Genetic analysis reveals domain interactions of Arabidopsis Hsp100/ClpB and cooperation with the small heat shock protein chaperone system.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.027540
The Arabidopsis ClpB/Hsp100 family of proteins: chaperones for stress and chloroplast development.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02940.x
Interplay between heat shock proteins HSP101 and HSA32 prolongs heat acclimation memory posttranscriptionally in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.112.212589
An Arabidopsis heat shock protein complements a thermotolerance defect in yeast.1994 · DOI: 10.1105/tpc.6.12.1899
At4g14670 推测的伴侣蛋白 ClpB2，叶绿体型。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0519700 参与热应激反应的分子伴侣。
Molecular characterization of rice hsp101: complementation of yeast hsp104 mutation by disaggregation of protein granules and differential expression in indica and japonica rice types.2003 · DOI: 10.1023/a:1022324920316
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008691 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009644 response to high light intensity 生物过程
GO:0034605 cellular response to heat 生物过程
GO:0042026 protein refolding 生物过程
GO:0043335 protein unfolding 生物过程
GO:0045727 positive regulation of translation 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G74310
dosa:Os05g0519700
dvu:DVU_1874
gvi:gll3577
syf:Synpcc7942_1089
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.596
排名 1 · TkA03G344420 · TK1151
细胞核0.370
排名 2 · TkA03G344420 · TK1151
细胞膜0.089
排名 3 · TkA03G344420 · TK1151
线粒体0.088
排名 4 · TkA03G344420 · TK1151
内质网0.057
排名 5 · TkA03G344420 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02861Clp_N5-129 aa
PF01935DUF8789-144 aa
PF02861Clp_N117-155 aa
PF03193RsgA_GTPase117-154 aa
PF13191AAA_16181-232 aa
PF00158Sigma54_activat182-282 aa
PF20030bpMoxR182-224 aa
PF25201nSTAND6182-228 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G344420PF02861Clp_N51298.1e-2897.9
TkA03G344420PF01935DUF87891440.04214.7
TkA03G344420PF02861Clp_N1171558.1e-2897.9
TkA03G344420PF03193RsgA_GTPase1171540.005117.4
TkA03G344420PF13191AAA_161812321.3e-1042.8
TkA03G344420PF00158Sigma54_activat1822821.1e-0938.9
TkA03G344420PF20030bpMoxR1822241.3e-0525.1
TkA03G344420PF25201nSTAND61822280.0003421.4
TkA03G344420PF01637ATPase_21842812.4e-0524.9
TkA03G344420PF23569NBD_SMAX11852871.6e-0938.6
TkA03G344420PF02367TsaE1872300.0001922.1
TkA03G344420PF12780AAA_81872820.09412.7
TkA03G344420PF20720nSTAND31892261.6e-0731.9
TkA03G344420PF01078Mg_chelatase1892210.000520.2
TkA03G344420PF04851ResIII1902250.003717.9
TkA03G344420PF05673DUF8151922800.0005419.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P42730拟南芥sp|P42730|CLPB1_ARATH Chaperone protein ClpB186.000%Swiss-Prot高置信
F4JVJ1拟南芥sp|F4JVJ1|CLPB2_ARATH Putative chaperone protein ClpB2, chloroplastic66.800%Swiss-Prot高置信
Q6F2Y7水稻sp|Q6F2Y7|CLPB1_ORYSJ Chaperone protein ClpB184.900%Swiss-Prot高置信

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