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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G198930
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 49895975-49901162 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2796 bp · TkA03G198930|TK1151|cDNA

AATACAACAAATTTGTTGTTTACTAATTTATCTGCTTAAACAACTCCGCCGTCTCTTTCTATCTCACAAGTCACAACAACAATATTGTAACGTAACGTCGGACAACATTAACAAAATTCTCAAGAATAGATCGAGTGGAAGACATGGTTTGGTTTGGATGTTGGATTGCACTACTAGTGTTCACGGTGGAGGTGGGGGGAGCAACCGTGAGTTATGACGGAAGATCACTTATTATTGATGGACAGCGCACCATATTGTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2649 bp · TkA03G198930|TK1151|CDS

GTTTGCCGTGCAATACAACAAATTTGTTGTTTACTAATTTATCTGCTTAAACAACTCCGCCGTCTCTTTCTATCTCACAAGTCACAACAACAATATTGTAACGTAACGTCGGACAACATTAACAAAATTCTCAAGAATGTATACATATGGTTATGTATATATATATGTAAAGTCCAACAAGAATGCTCTAACAATTTACTCCCTTCTCTGTCACTTGGTTTTAGAGATCGAGTGGAAGACATGGTTTGGTTTGGATGTTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

882 aa · TkA03G198930|TK1151|PROTEIN

VCRAIQQICCLLIYLLKQLRRLFLSHKSQQQYCNVTSDNINKILKNVYIWLCIYICKVQQECSNNLLPSLSLGFRDRVEDMVWFGCWIALLVFTVEVGGATVSYDGRSLIIDGQRTILFSGSIHYARSTPDMWPSLIAKAKKGGLDVIQTYVFWNLHEPQPGQYDFSGRNDIISFIKQVQQQGLYVSLRIGPFIEAEWTYGGLPFWLHDVPGIVFRTNNEPFKLHMQNFTTKIVNMMKAENLFASQGGPIILSQIENEYQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G198930
TK1151 IDTkA03G198930
OH-1004 IDLXL04_007628
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.433 / OH-1004 99.885
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G198930
位置Chr03:49895975-49901162 (-)
描述Similar to BGAL16: Beta-galactosidase 16
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g77410 β-半乳糖苷酶 16。 暂无已核实直接文献
At5g63800 β-半乳糖苷酶6。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0428100 β-半乳糖苷酶7。 暂无已核实直接文献
Os01g0580200 β-半乳糖苷酶 2。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007628 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009827 plant-type cell wall modification 生物过程
GO:0019388 galactose catabolic process 生物过程
GO:0048354 mucilage biosynthetic process involved in seed coat development 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0048046 apoplast 细胞组分
GO:0004565 beta-galactosidase activity 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G77410
ath:AT5G63800
dosa:Os01g0580200
dosa:Os08g0549200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.395
排名 1 · TkA03G198930 · TK1151
细胞外0.214
排名 2 · TkA03G198930 · TK1151
细胞质0.184
排名 3 · TkA03G198930 · TK1151
内质网0.169
排名 4 · TkA03G198930 · TK1151
细胞膜0.158
排名 5 · TkA03G198930 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25317SAM_SMF2-44 aa
PF01301Glyco_hydro_35108-415 aa
PF02449Glyco_hydro_42131-262 aa
PF02140SUEL_Lectin292-309 aa
PF17834GHD439-494 aa
PF13385Laminin_G_3538-595 aa
PF13364BetaGal_ABD2542-614 aa
PF21467BetaGal_gal-bd548-587 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G198930PF25317SAM_SMF2440.4311.6
TkA03G198930PF01301Glyco_hydro_351084152.5e-111373.0
TkA03G198930PF02449Glyco_hydro_421312621.6e-0525.2
TkA03G198930PF02140SUEL_Lectin2923091.1e-1971.3
TkA03G198930PF17834GHD4394948.5e-2483.8
TkA03G198930PF13385Laminin_G_35385950.009916.7
TkA03G198930PF13364BetaGal_ABD25426143.8e-0731.6
TkA03G198930PF21467BetaGal_gal-bd5485871.6e-2589.7
TkA03G198930PF13385Laminin_G_36727380.009916.7
TkA03G198930PF13364BetaGal_ABD26757503.8e-0731.6
TkA03G198930PF21467BetaGal_gal-bd6827481.6e-2589.7
TkA03G198930PF02140SUEL_Lectin8048811.1e-1971.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GX69拟南芥sp|Q8GX69|BGA16_ARATH Beta-galactosidase 1659.300%Swiss-Prot高置信
Q9FFN4拟南芥sp|Q9FFN4|BGAL6_ARATH Beta-galactosidase 658.700%Swiss-Prot高置信
Q75HQ3水稻sp|Q75HQ3|BGAL7_ORYSJ Beta-galactosidase 751.700%Swiss-Prot高置信
Q8W0A1水稻sp|Q8W0A1|BGAL2_ORYSJ Beta-galactosidase 249.000%Swiss-Prot中等置信

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