TkA03G184050 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G184050

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 46328206-46333599 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

4483 bp · TkA03G184050|TK1151|cDNA

TAATTAGTCATTTTCTTTATTATAAAAACAATTGACATATATGTCATAGCTTACAAAAAATGTTAACTTGTTTAAATGTTTTGTTACCCCATTTATAGCGTTTGTGTTGGATCTTGTATAGACATATGTATGTGGCTAACCTCTTTTTGTTATATAAATGGATAACACTTAAGATCTTGACAAATATCCTTCGATTTTCGTTAGAAATAATAAAACATTCCAGTGTCTAACGTGCAGGCCATTGCGGTCGCTAATTTCAC...

CDS

下载 CDS FASTA

3573 bp · TkA03G184050|TK1151|CDS

ATGACTTCCAATCGCCCACTTCCGGGCCCCTCCCTCCGAACTCCAGGATCTGTTGGGTCCGATCGTTCTTCGTCGATTTCCAGTAAGAACTCAGATAATGCCCAGATTGCAAATCTACACCTACATGAACGACTAGATACCTTGCAAAATTCGTCTTCTCAGCAAAGCATTAAGTCGAAAAGCTGGAGGGCAACCTCTGTAAATTTCGGATCAAAGGGTGTGCGACATGGATCTCGAAGTGGTGCCGATTCTGAAGGGTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1190 aa · TkA03G184050|TK1151|PROTEIN

MTSNRPLPGPSLRTPGSVGSDRSSSISSKNSDNAQIANLHLHERLDTLQNSSSQQSIKSKSWRATSVNFGSKGVRHGSRSGADSEGFSMSRREFNDDDARLVYVNDPLKTNDTFEFSGNSIRTGKYSVLTFLPRNLFEQFHRVAYMYFLIIAILNQLPQLAVFGRGASILPLASVLLVTAIKDAYEDWRRHKSDKIENNKTSSVLINDRFQPKKWKDIQVGEVIKILANETIPCDLVLLSTSDPTGVAYVQTINLDGESN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G184050`
TK1151 ID	TkA03G184050
OH-1004 ID	LXL04_007493
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	98.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G184050

位置 Chr03:46328206-46333599 (+)

描述 Similar to ALA1: Phospholipid-transporting ATPase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g04930`	参与磷脂的运输。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007493 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程

GO:0002238 response to molecule of fungal origin 生物过程

GO:0006893 Golgi to plasma membrane transport 生物过程

GO:0008104 intracellular protein localization 生物过程

GO:0008285 negative regulation of cell population proliferation 生物过程

GO:0009860 pollen tube growth 生物过程

GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程

GO:0010996 response to auditory stimulus 生物过程

GO:0015031 protein transport 生物过程

GO:0016192 vesicle-mediated transport 生物过程

GO:0030335 positive regulation of cell migration 生物过程

GO:0034220 monoatomic ion transmembrane transport 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G59820

ath:AT5G04930

hsa:10396

hsa:51761

mmu:11980

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.348

排名 1 · TkA03G184050 · TK1151

内质网0.271

排名 2 · TkA03G184050 · TK1151

高尔基体0.206

排名 3 · TkA03G184050 · TK1151

溶酶体／液泡0.196

排名 4 · TkA03G184050 · TK1151

细胞质0.195

排名 5 · TkA03G184050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16209PhoLip_ATPase_N102-168 aa

PF00122E1-E2_ATPase200-264 aa

PF16212PhoLip_ATPase_C414-430 aa

PF00702Hydrolase482-501 aa

PF13246Cation_ATPase592-757 aa

PF00702Hydrolase714-786 aa

PF08282Hydrolase_3761-787 aa

PF08282Hydrolase_3879-907 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G184050	`PF16209`	PhoLip_ATPase_N	102	168	3.4e-24	85.1
TkA03G184050	`PF00122`	E1-E2_ATPase	200	264	0.00041	20.8
TkA03G184050	`PF16212`	PhoLip_ATPase_C	414	430	6.7e-75	252.8
TkA03G184050	`PF00702`	Hydrolase	482	501	5.5e-09	37.4
TkA03G184050	`PF13246`	Cation_ATPase	592	757	4.8e-13	50.0
TkA03G184050	`PF00702`	Hydrolase	714	786	5.5e-09	37.4
TkA03G184050	`PF08282`	Hydrolase_3	761	787	0.00035	21.1
TkA03G184050	`PF08282`	Hydrolase_3	879	907	0.00035	21.1
TkA03G184050	`PF00702`	Hydrolase	883	903	5.5e-09	37.4
TkA03G184050	`PF16212`	PhoLip_ATPase_C	917	1156	6.7e-75	252.8
TkA03G184050	`PF16209`	PhoLip_ATPase_N	1134	1145	3.4e-24	85.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P98204`	拟南芥	sp\|P98204\|ALA1_ARATH Phospholipid-transporting ATPase 1	69.500%	Swiss-Prot	高置信

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