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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G159440
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 40430898-40434936 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1044 bp · TkA03G159440|TK1151|cDNA

CACGGATAAAGTTTTCCCCTTTTGGCGTTATTTTGCCAAATTGTCGAAACATAGAAGTAGATAAGTGATACACTCTCCCTATTCAACTCCCTCAAAAATCGAAGCGGCACGTCCGATTACAATAACGGTTAACCCACCACACCCTTGTATCACCATCTTCCCTTCCCGGCTCCTCCCCCCGGCGCCGGAGGAAAAACAATGTTCTTGTTAAACGCTCAACTCCACCAACAAACCACCCTTTCTTCTCTCCTTCCAACCAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1338 bp · TkA03G159440|TK1151|CDS

ATGTTCTTGTTAAACGCTCAACTCCACCAACAAACCACCCTTTCTTCTCTCCTTCCAACCACCTCTTCTACCTGCCTATCTAAAACCCACCACAAAACCCAACCATTGCTCTTCCGTAAACCCACCTTATCGTTCCTTCAATTCTCCCTCCACCACCACCCCCAACAACAATTATACACCAACGTCAACAGAGACGATGAAGTATACGAAGAAGAAGAGGAACAAGTAATCGGAGACTGCTTGGTTTTCGAAGAAGGCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

445 aa · TkA03G159440|TK1151|PROTEIN

MFLLNAQLHQQTTLSSLLPTTSSTCLSKTHHKTQPLLFRKPTLSFLQFSLHHHPQQQLYTNVNRDDEVYEEEEEQVIGDCLVFEEGIFEDPYIQNEIQLEAPKPSKKVTKIVVQPEDLVPAYWKDVQTEINITKKERRKMAQELEFGSRLQKRKEGLKPIPMGYESMKEYKAAKLRELNPVRLDNPEFLVEKKEDDGTEDEIDEGEGSRGTRVAPRNPKMAVYGRNMEDISRYLNSGMYDPEAAKDPDGPRKLFTKEEKV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G159440
TK1151 IDTkA03G159440
OH-1004 IDLXL04_007338
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G159440
位置Chr03:40430898-40434936 (+)
描述Similar to AKRP: Ankyrin repeat domain-containing protein, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g66055 参与胚胎发育期间原质体的初始分化，以及与细胞分化、形态发生和器官发生相关的质体分化。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007338 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0030307 positive regulation of cell growth 生物过程
GO:0031398 positive regulation of protein ubiquitination 生物过程
GO:0032436 positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0043409 negative regulation of MAPK cascade 生物过程
GO:0045737 positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity 生物过程
GO:0070682 proteasome regulatory particle assembly 生物过程
GO:0000502 proteasome complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G40160
ath:AT5G66055
hsa:5716
rno:116722
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.935
排名 1 · TkA03G159440 · TK1151
细胞核0.049
排名 2 · TkA03G159440 · TK1151
线粒体0.041
排名 3 · TkA03G159440 · TK1151
细胞质0.018
排名 4 · TkA03G159440 · TK1151
细胞膜0.015
排名 5 · TkA03G159440 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12796Ank_2271-339 aa
PF13857Ank_5275-316 aa
PF13606Ank_3276-304 aa
PF00023Ank277-306 aa
PF13637Ank_4280-329 aa
PF13857Ank_5299-349 aa
PF00023Ank309-340 aa
PF13606Ank_3309-334 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G159440PF12796Ank_22713391.3e-35122.5
TkA03G159440PF13857Ank_52753164.4e-2794.6
TkA03G159440PF13606Ank_32763047e-2069.5
TkA03G159440PF00023Ank2773061.1e-2692.1
TkA03G159440PF13637Ank_42803297.6e-2587.1
TkA03G159440PF13857Ank_52993494.4e-2794.6
TkA03G159440PF00023Ank3093401.1e-2692.1
TkA03G159440PF13606Ank_33093347e-2069.5
TkA03G159440PF12796Ank_23224051.3e-35122.5
TkA03G159440PF13637Ank_43233627.6e-2587.1
TkA03G159440PF13857Ank_53293824.4e-2794.6
TkA03G159440PF18418AnkUBD3353620.006517.3
TkA03G159440PF00023Ank3413731.1e-2692.1
TkA03G159440PF13606Ank_33413697e-2069.5
TkA03G159440PF13637Ank_43553957.6e-2587.1
TkA03G159440PF12796Ank_23664201.3e-35122.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q05753拟南芥sp|Q05753|AKRP_ARATH Ankyrin repeat domain-containing protein, chloroplastic49.400%Swiss-Prot中等置信

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