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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G157190
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 39872083-39873110 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

933 bp · TkA03G157190|TK1151|cDNA

AAAAGATGAAAACAACCATCTTTGCCGGATTATTTCTTGCCGGAATAATCCTCATCCCGGAACCGGTAGCATCCCAGAATAATAATGCATATAGACCTGGTATAGCGACCAATGATTTCTTTTATGGGATCATGGCCAAGTCTGCAAACGACTGCCCCGGAAGACGTTTCTACACACGTGTGGCGTTTCTTAGAGTCATAAGAGACTACCCACAGTTTGCCAGATCAGGTTCCCTGGATGATTCAAAACGAGAAATCGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

474 bp · TkA03G157190|TK1151|CDS

ATGATTCAAAACGAGAAATCGCAGCTTTCTTTGCCCATGTTACTCATGACTCATGAGACTGGTCACTTCTGTTACATAGAAGAAATAGATGGTCGTTCAAAGAACTACTGCGATTGGGGGAACAGAGAATACCCATGCGCCCCTAACAAAGGCTACTATGGGAGAGGTCCGCTTCAGATTTCATGGAACTACAACTACGGTTCGGCTGGAAGGAGCCTTGGGTTCGATGGGCTCGGGAACCCAGATGCCGTGGCTAATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

157 aa · TkA03G157190|TK1151|PROTEIN

MIQNEKSQLSLPMLLMTHETGHFCYIEEIDGRSKNYCDWGNREYPCAPNKGYYGRGPLQISWNYNYGSAGRSLGFDGLGNPDAVANDPMISFKTALWFWMGNVHSDFASGKGFGATIRAINGGECNGGNGDAVRSRVNYYTDYCRQFGVSTGGNVWC

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G157190
TK1151 IDTkA03G157190
OH-1004 IDLXL04_007329
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)90.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.452 / OH-1004 56.458
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G157190
位置Chr03:39872083-39873110 (+)
描述Similar to EP3: Endochitinase EP3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g54420 可能参与十字花叶斑病菌感染后的过敏反应。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0493400 水解壳多糖，可能在胚胎发生和种子成熟期间在生殖器官中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os04g0494100 可能在胚胎发育和种子成熟期间在生殖器官中发挥功能。 暂无已核实直接文献
Os02g0605900 可能在胚胎发育和种子成熟期间在生殖器官中发挥功能。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007329 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000272 polysaccharide catabolic process 生物过程
GO:0006032 chitin catabolic process 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程
GO:0016998 cell wall macromolecule catabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0004568 chitinase activity 分子功能
GO:0008061 chitin binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G54420
dosa:Os02g0605900
dosa:Os04g0493400
dosa:Os04g0494100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.500
排名 1 · TkA03G157190 · TK1151
细胞外0.328
排名 2 · TkA03G157190 · TK1151
细胞质0.179
排名 3 · TkA03G157190 · TK1151
内质网0.109
排名 4 · TkA03G157190 · TK1151
细胞膜0.084
排名 5 · TkA03G157190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00182Glyco_hydro_1920-102 aa
PF00182Glyco_hydro_19111-157 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G157190PF00182Glyco_hydro_19201028.2e-35121.4
TkA03G157190PF00182Glyco_hydro_191111578.2e-35121.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M2U5拟南芥sp|Q9M2U5|CHI5_ARATH Endochitinase EP365.000%Swiss-Prot高置信
O04138水稻sp|O04138|CHI4_ORYSJ Chitinase 463.900%Swiss-Prot高置信
Q7Y1Z0水稻sp|Q7Y1Z0|CHI5_ORYSJ Chitinase 564.500%Swiss-Prot高置信
Q6K8R2水稻sp|Q6K8R2|CHI6_ORYSJ Chitinase 659.900%Swiss-Prot高置信

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