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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G071330
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 18323211-18326205 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2514 bp · TkA03G071330|TK1151|cDNA

TAAATATGTTAGTTAAAGCAGTATGTTTTGTCATTTTCTATTTTTCTAGACCTTGATTCGCGTTATGCATTTTCCCCTGTTTGATGGAAAACTCAAGCCAGAAGAGAGAAAAGAAGCAAACAAAAAAGAGACAACTCACCTCTCTACTCTCCCTCTTTCCCTAGTCCACTCCTCAAACGATGTGCGCCCTACCTAAACCCTTCCACCACCGCCACCGCCACCACTATCTATTGTCTTTCATTATCCTCCTCACCGCCACC...

CDS

下载 CDS FASTA

2034 bp · TkA03G071330|TK1151|CDS

ATGTGCGCCCTACCTAAACCCTTCCACCACCGCCACCGCCACCACTATCTATTGTCTTTCATTATCCTCCTCACCGCCACCGCCTCCGCCGTGGACCCGAAACCGGTTGAAGCACTAGTGCCCTCCGACGCCGTCGCGCTACTCAAATTCAAGCTACAAGCTGACATTGGAAACAAGCTCCTCTATGATCTTAACGAGCGGTTCGATTATTGTCAATGGCAAGGAGCGAAATGTGTTCAAGGTCGAGTTGTTCGGTTTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

677 aa · TkA03G071330|TK1151|PROTEIN

MCALPKPFHHRHRHHYLLSFIILLTATASAVDPKPVEALVPSDAVALLKFKLQADIGNKLLYDLNERFDYCQWQGAKCVQGRVVRFVLQGCGLSGVFADNTLTRLDQLRVLSLRNNSLSGAIPDLSALTNLKTLFLDHNAFSGKFPLPLVALHRLRSLDLARNNLSGPLPIELNSLNRLTYLRLEWNRFNGSLPPLNITALEVFNVSGNNLTGSVPVTPALSRFDISSYLLNPGLCGKILNKICSSNAPFFDTPSGVSAP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G071330
TK1151 IDTkA03G071330
OH-1004 IDLXL04_006788
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G071330
位置Chr03:18323211-18326205 (+)
描述Similar to At5g67200: Probable inactive receptor kinase At5g67200
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g67200 可能为非活性受体激酶At5g67200。 暂无已核实直接文献
At1g60630 非活性富含亮氨酸重复的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g60630。 暂无已核实直接文献
At1g48480 可能的非活性受体激酶 At1g48480。 暂无已核实直接文献
At1g68400 可能的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At1g68400。 暂无已核实直接文献
At2g26730 可能失活的受体激酶 At2g26730。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006788 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G48480
ath:AT1G60630
ath:AT1G68400
ath:AT3G17840
ath:AT5G67200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.868
排名 1 · TkA03G071330 · TK1151
细胞质0.077
排名 2 · TkA03G071330 · TK1151
内质网0.076
排名 3 · TkA03G071330 · TK1151
细胞核0.067
排名 4 · TkA03G071330 · TK1151
溶酶体／液泡0.018
排名 5 · TkA03G071330 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00560LRR_186-97 aa
PF13855LRR_898-140 aa
PF23598LRR_14101-202 aa
PF00560LRR_1107-124 aa
PF12799LRR_4107-139 aa
PF13855LRR_8129-189 aa
PF00560LRR_1130-149 aa
PF12799LRR_4147-169 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G071330PF00560LRR_186971e-1246.3
TkA03G071330PF13855LRR_8981403.9e-0833.6
TkA03G071330PF23598LRR_141012025.9e-0522.7
TkA03G071330PF00560LRR_11071241e-1246.3
TkA03G071330PF12799LRR_41071396.1e-1142.9
TkA03G071330PF13855LRR_81291893.9e-0833.6
TkA03G071330PF00560LRR_11301491e-1246.3
TkA03G071330PF12799LRR_41471696.1e-1142.9
TkA03G071330PF00560LRR_11541761e-1246.3
TkA03G071330PF12799LRR_41541966.1e-1142.9
TkA03G071330PF00560LRR_11781951e-1246.3
TkA03G071330PF12799LRR_41782136.1e-1142.9
TkA03G071330PF13855LRR_81992133.9e-0833.6
TkA03G071330PF12799LRR_42002276.1e-1142.9
TkA03G071330PF00560LRR_12012171e-1246.3
TkA03G071330PF02674Colicin_V2823170.02115.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93Y06拟南芥sp|Q93Y06|Y5720_ARATH Probable inactive receptor kinase At5g6720059.400%Swiss-Prot高置信
Q84MA9拟南芥sp|Q84MA9|Y1063_ARATH Inactive leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6063047.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LP77拟南芥sp|Q9LP77|Y1848_ARATH Probable inactive receptor kinase At1g4848034.600%Swiss-Prot中等置信
Q9M9C5拟南芥sp|Q9M9C5|Y1680_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g6840035.800%Swiss-Prot中等置信
O48788拟南芥sp|O48788|Y2267_ARATH Probable inactive receptor kinase At2g2673038.600%Swiss-Prot中等置信

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