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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G062600
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 16149442-16152694 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1640 bp · TkA03G062600|TK1151|cDNA

GATAGTATAAACAAGAAGAAAGAGGAACGCCATCTCGTACCTGTTCACGCTTGTCGTGATACTACTAATAGCCGTCCTTTGATGGCCGTAAGGCCTCCTCTGCAATTCACCGCATCCTCAATCAACGCCATCAAATTACCTTTCAACCCACCCACCGCCACCATTTCCCGATTCACCGTCGTATTCATCCGCCGCTTCGCCTCCGCCGGTATTCGTCTGACCGGTGTTGTTCCCCCGCAGCAACACATCAACCAGAAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1323 bp · TkA03G062600|TK1151|CDS

ATGGCCGTAAGGCCTCCTCTGCAATTCACCGCATCCTCAATCAACGCCATCAAATTACCTTTCAACCCACCCACCGCCACCATTTCCCGATTCACCGTCGTATTCATCCGCCGCTTCGCCTCCGCCGGTATTCGTCTGACCGGTGTTGTTCCCCCGCAGCAACACATCAACCAGAAACACAATCGATACAGATATTCCTATCAAGAAACCCTAGTTCAACCGCCTATTTCGTCACTATCTCCGTCGTATCGCCTCCACCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

440 aa · TkA03G062600|TK1151|PROTEIN

MAVRPPLQFTASSINAIKLPFNPPTATISRFTVVFIRRFASAGIRLTGVVPPQQHINQKHNRYRYSYQETLVQPPISSLSPSYRLHPASSLQEKLAQKIGKASRHPGAPSKARVYADVNVVRPKEYWDYESLTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGLHSIDDEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLCGGPNIIKLLDIVRDQQSKTPSLIFEHVNNTDFKILYPTLSDFDIRYYIYELLKALEYCHSQGIMHRDV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G062600
TK1151 IDTkA03G062600
OH-1004 IDLXL04_013611
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)79.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 97.072
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G062600
位置Chr03:16149442-16152694 (-)
描述Similar to CKA4: Casein kinase II subunit alpha-4, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g23070 酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。
Plastid casein kinase 2 knockout reduces abscisic acid (ABA) sensitivity, thermotolerance, and expression of ABA- and heat-stress-responsive nuclear genes.2014 · DOI: 10.1093/jxb/eru190
A mutation of casein kinase 2 α4 subunit affects multiple developmental processes in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1007/s00299-016-1939-5
At3g50000 酪蛋白激酶通过优先利用酸性蛋白如酪蛋白作为底物来操作定义（通过相似性）。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q9AR27 酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。 暂无已核实直接文献
UniProt: B6F107 酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013611 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006281 DNA repair 生物过程
GO:0006325 chromatin organization 生物过程
GO:0006974 DNA damage response 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009648 photoperiodism 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010019 chloroplast-nucleus signaling pathway 生物过程
GO:0010187 negative regulation of seed germination 生物过程
GO:0010225 response to UV-C 生物过程
GO:0010229 inflorescence development 生物过程
GO:0010332 response to gamma radiation 生物过程
GO:0040008 regulation of growth 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G23070
ath:AT5G67380
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.518
排名 1 · TkA03G062600 · TK1151
细胞核0.462
排名 2 · TkA03G062600 · TK1151
线粒体0.088
排名 3 · TkA03G062600 · TK1151
细胞膜0.072
排名 4 · TkA03G062600 · TK1151
内质网0.045
排名 5 · TkA03G062600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase142-427 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr144-342 aa
PF03109ABC1156-191 aa
PF17667Pkinase_fungal156-192 aa
PF01636APH169-247 aa
PF17667Pkinase_fungal245-318 aa
PF03109ABC1247-292 aa
PF06293Kdo250-279 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G062600PF00069Pkinase1424277.3e-62209.8
TkA03G062600PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1443421.8e-1764.2
TkA03G062600PF03109ABC11561910.0006819.6
TkA03G062600PF17667Pkinase_fungal1561920.00118.6
TkA03G062600PF01636APH1692472e-0628.5
TkA03G062600PF17667Pkinase_fungal2453180.00118.6
TkA03G062600PF03109ABC12472920.0006819.6
TkA03G062600PF06293Kdo2502790.07113.3
TkA03G062600PF01636APH2522952e-0628.5
TkA03G062600PF01633Choline_kinase2552820.211.7
TkA03G062600PF01636APH3754172e-0628.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64816拟南芥sp|O64816|CSK2P_ARATH Casein kinase II subunit alpha-4, chloroplastic76.500%Swiss-Prot高置信
Q08466拟南芥sp|Q08466|CSK22_ARATH Casein kinase II subunit alpha-286.100%Swiss-Prot高置信
Q9AR27水稻sp|Q9AR27|HD6_ORYSI Casein kinase II subunit alpha-287.900%Swiss-Prot高置信
B6F107水稻sp|B6F107|HD6_ORYSJ Casein kinase II subunit alpha-287.900%Swiss-Prot高置信

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