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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G037080
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 9790735-9794442 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1951 bp · TkA03G037080|TK1151|cDNA

TCTGTTTATCTGCTAGCTGCCGTTTGTATCTTAGGACGCATAATCCTTTATCAAATTCATATCAATCGGTGGTTTGTTAGCTCGGCATTCAACACCCGCCATAGCCGAGCTCGGAGGTACGTTTGCTATTTCCAGTTCTCACAATTAAAACGTGCCCTAAGCTTTAAAAGATGGATGAAATTATTGAAAACAAAGACATCGATCTGGAAACTGAAGAAAACGATGATTTCAAAAGACAATTATGGAGAAAATTTCGCCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1608 bp · TkA03G037080|TK1151|CDS

ATGGATGAAATTATTGAAAACAAAGACATCGATCTGGAAACTGAAGAAAACGATGATTTCAAAAGACAATTATGGAGAAAATTTCGCCCAAAGCTTTGGTTTTCATCCATTTGGAAGAAATATTCTCTAGAATCGAAGCTAAATAACATCAAAACATTCTTGAAGATGAACATCATTCCCGCTTCTATCTCTCTAGCAATGGGAATCTGTTACCTCCTCTTGAAATCAAAGGGGCAAAAATGTAAAGTTGTTCCATATTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

535 aa · TkA03G037080|TK1151|PROTEIN

MDEIIENKDIDLETEENDDFKRQLWRKFRPKLWFSSIWKKYSLESKLNNIKTFLKMNIIPASISLAMGICYLLLKSKGQKCKVVPYSDLLKGLQDGSVTRVQFKENSRSIMYNTNPQASQSTKIVNKLKSHNDANFKEMVASFLAKLSRKHESLSLTLTESNSKVLDFEEMKREKYNHGWQFSTRYIDDDYRELLHLMKEKGTTYGLDPEPFYVSGGRRVFSTLLNQAPSWAMLYMVSLGLGGGGSIARKPSKNDAVTFD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G037080
TK1151 IDTkA03G037080
OH-1004 IDLXL04_006435
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.814
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G037080
位置Chr03:9790735-9794442 (-)
描述Similar to FTSHI3: Probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 3, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g02450 可能参与分子伴侣功能或在类囊体FtsH复合物中起结构作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006435 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0030163 protein catabolic process 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0004176 ATP-dependent peptidase activity 分子功能
GO:0004222 metalloendopeptidase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G02450
bph:Bphy_6007
cyb:CYB_0631
tro:trd_A0442
ttr:Tter_0172
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.382
排名 1 · TkA03G037080 · TK1151
质体0.268
排名 2 · TkA03G037080 · TK1151
细胞质0.152
排名 3 · TkA03G037080 · TK1151
细胞核0.096
排名 4 · TkA03G037080 · TK1151
内质网0.092
排名 5 · TkA03G037080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06480FtsH_ext58-205 aa
PF06068TIP4995-119 aa
PF13191AAA_1699-149 aa
PF08050Tet_res_leader100-107 aa
PF12775AAA_7111-146 aa
PF20720nSTAND3117-174 aa
PF13521AAA_28122-157 aa
PF24883NPHP3_N130-172 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G037080PF06480FtsH_ext582051.1e-0526.3
TkA03G037080PF06068TIP49951190.0003620.6
TkA03G037080PF13191AAA_16991493.9e-0731.5
TkA03G037080PF08050Tet_res_leader1001073.18.4
TkA03G037080PF12775AAA_71111460.0813.2
TkA03G037080PF20720nSTAND31171742.1e-0525.0
TkA03G037080PF13521AAA_281221570.0002721.9
TkA03G037080PF24883NPHP3_N1301720.05114.5
TkA03G037080PF14532Sigma54_activ_21371550.1912.8
TkA03G037080PF13173AAA_141411670.08413.6
TkA03G037080PF08050Tet_res_leader1501583.18.4
TkA03G037080PF08050Tet_res_leader1711773.18.4
TkA03G037080PF13173AAA_142532760.08413.6
TkA03G037080PF13191AAA_162562743.9e-0731.5
TkA03G037080PF25199nSTAND_NTPase52733170.1512.6
TkA03G037080PF02367TsaE2873190.1213.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M895拟南芥sp|Q9M895|FTSI3_ARATH Probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 3, chloroplastic54.000%Swiss-Prot高置信

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