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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G031910
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 8532102-8533877 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1170 bp · TkA03G031910|TK1151|cDNA

ATCCAAGGGACGAGGATCGTATTAAAGATGGGACAAATTCGAGTTTATATGTGATATATGATTTGTTCGTGTCGTTTATCCACTCTCGAAAGAACTAAGGATTCACAGAAGCTTAAAGAACAAGATAAGATATGGGGTTGGAAGTTAATGCCGTGTACCTCTCTTATGTGGTGCACGTTCTGGCCGTCGCCGGATCGGTGATGGTTCTGGTTTGGAACATCCACTTCAGAGGCGGATTAGCTTGGGAATCTACTAACAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

693 bp · TkA03G031910|TK1151|CDS

ATGGGGTTGGAAGTTAATGCCGTGTACCTCTCTTATGTGGTGCACGTTCTGGCCGTCGCCGGATCGGTGATGGTTCTGGTTTGGAACATCCACTTCAGAGGCGGATTAGCTTGGGAATCTACTAACAAGAATCTCATCTTCAACGTTCATCCTGTTCTGATGCTAATTGGTTTGATTATCATGGGCGGTGAAGCCATCGTAAGCTACAAAGCTCTTCCGTTCAAAAAGGCTGAAAAGAAGCTCATACATCTTATCCTTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

230 aa · TkA03G031910|TK1151|PROTEIN

MGLEVNAVYLSYVVHVLAVAGSVMVLVWNIHFRGGLAWESTNKNLIFNVHPVLMLIGLIIMGGEAIVSYKALPFKKAEKKLIHLILHAIALVLGIIGIYMAFKNHNESGIANLYSLHSWLGIGIIVLYGVQWVYGFLVFFYPGGTGDLRKESLPWHVLFGMFVYILAVANSALGFLEKLTFLESSGIAKYGSEAFLVNFTAIVAVLYGTFVLLTALSRAPAEDNHSYSAI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G031910
TK1151 IDTkA03G031910
OH-1004 IDLXL04_011890
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G031910
位置Chr03:8532102-8533877 (+)
描述Similar to CYB561A: Transmembrane ascorbate ferrireductase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g25570 含两种血红素的细胞色素。
Localization of an ascorbate-reducible cytochrome b561 in the plant tonoplast.2004 · DOI: 10.1104/pp.103.032359

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0642300 含两种血红素的细胞色素。 暂无已核实直接文献
Os04g0533500 含两种血红素的细胞色素。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011890 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0009055 electron transfer activity 分子功能
GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能
GO:0019904 protein domain specific binding 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
GO:0140571 transmembrane ascorbate ferrireductase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G25570
dosa:Os02g0642300
dosa:Os04g0533500
zma:100273009
zma:100384594
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.297
排名 1 · TkA03G031910 · TK1151
细胞质0.287
排名 2 · TkA03G031910 · TK1151
溶酶体／液泡0.282
排名 3 · TkA03G031910 · TK1151
细胞膜0.219
排名 4 · TkA03G031910 · TK1151
内质网0.152
排名 5 · TkA03G031910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07836DmpG_comm8-33 aa
PF03188Cytochrom_B56113-26 aa
PF03203MerC15-62 aa
PF19885DUF635818-26 aa
PF19885DUF635843-68 aa
PF03188Cytochrom_B56149-181 aa
PF29123R07B1_N52-130 aa
PF12576DUF375454-104 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G031910PF07836DmpG_comm8330.08513.1
TkA03G031910PF03188Cytochrom_B56113261.4e-46158.8
TkA03G031910PF03203MerC15620.02116.1
TkA03G031910PF19885DUF635818260.07114.0
TkA03G031910PF19885DUF635843680.07114.0
TkA03G031910PF03188Cytochrom_B561491811.4e-46158.8
TkA03G031910PF29123R07B1_N521300.04714.5
TkA03G031910PF12576DUF3754541044.38.0
TkA03G031910PF01292Ni_hydr_CYTB691386.77.2
TkA03G031910PF03203MerC771250.02116.1
TkA03G031910PF19885DUF6358791070.07114.0
TkA03G031910PF01292Ni_hydr_CYTB812116.77.2
TkA03G031910PF07836DmpG_comm901080.08513.1
TkA03G031910PF03203MerC1531770.02116.1
TkA03G031910PF12576DUF37541762144.38.0
TkA03G031910PF19885DUF63581912050.07114.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L856拟南芥sp|Q8L856|ACFR1_ARATH Transmembrane ascorbate ferrireductase 169.800%Swiss-Prot高置信
A3A9H6水稻sp|A3A9H6|ACET1_ORYSJ Probable ascorbate-specific transmembrane electron transporter 167.500%Swiss-Prot高置信
Q7XMK3水稻sp|Q7XMK3|ACET2_ORYSJ Probable ascorbate-specific transmembrane electron transporter 264.300%Swiss-Prot高置信

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