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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G607700
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 156765423-156770108 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3770 bp · TkA02G607700|TK1151|cDNA

AAATAGGCCTCTAACTTTGTCACTTAATCCTTTTTAACATGCATCAATCCTACAAATAGGCCTCTAATTTTGTCACTTAATCCTTTTTTAACATGCAGCAATCTAGAATTTTTTATTGTGCATGAGACTTGTACGTACAGTTACTTCAACACCATCACCTTAATCACACACATGCATGCACACTTGGACCAACCATGCACTCGACCAGTCTTCATGCAAAAGAGTCTCAGACCGGTAAACTGTCAACCAATAGGTAAGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2604 bp · TkA02G607700|TK1151|CDS

ATGGCTTATTTTTGCTCTACCACTTGGGGTTTGTTCTTCATTGTTTTGCTAGAGGCCGTTGTGTGTATATCAGGCCGGGTCGGTTTGGGATCAAGATTGTATGCTAACGGCAATCGGATATGGGAATCTGCTAATCGTACATTTGGATTTGGGTTTGCTCAAGCTTTAGACGACGATTCAGGTCCACAAGACGGTCAATACAAGTTGGGAATTTGGTTCACCAATCTTCCAGGAGACCGCACGCTTGCTTGGTCCGCATA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

867 aa · TkA02G607700|TK1151|PROTEIN

MAYFCSTTWGLFFIVLLEAVVCISGRVGLGSRLYANGNRIWESANRTFGFGFAQALDDDSGPQDGQYKLGIWFTNLPGDRTLAWSAYLNAPVTKNAILELDTTGNLVLSDGRTTAWTSNTTNAGVESAELLDNGNLVLYTNNQEIAWQSFSHPSDTLLPGQPLTISVELTSSRIPTRGGGYYTLKILQQPTSLSLALTYNLPADPYNLSMEAQSNYSYWATPEFSNVTGDVLAVLGQAGSFGVVYGGDSSGAVYVYKNDN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G607700
TK1151 IDTkA02G607700
OH-1004 IDLXL04_011856
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G607700
位置Chr02:156765423-156770108 (+)
描述Similar to At5g24080: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g24080
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g24080 G型凝集素S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At5g24080。 暂无已核实直接文献
At2g19130 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g19130。 暂无已核实直接文献
At4g32300 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SD2-5。 暂无已核实直接文献
At1g34300 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g34300。 暂无已核实直接文献
At4g00340 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011856 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34300
ath:AT2G19130
ath:AT4G00340
ath:AT4G32300
ath:AT5G24080
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.861
排名 1 · TkA02G607700 · TK1151
内质网0.081
排名 2 · TkA02G607700 · TK1151
细胞质0.070
排名 3 · TkA02G607700 · TK1151
细胞核0.043
排名 4 · TkA02G607700 · TK1151
溶酶体／液泡0.029
排名 5 · TkA02G607700 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01453B_lectin81-168 aa
PF01453B_lectin207-243 aa
PF01453B_lectin251-316 aa
PF00954S_locus_glycop259-342 aa
PF08276PAN_2400-431 aa
PF00069Pkinase534-801 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr534-803 aa
PF03109ABC1537-561 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G607700PF01453B_lectin811682.1e-1970.6
TkA02G607700PF01453B_lectin2072432.1e-1970.6
TkA02G607700PF01453B_lectin2513162.1e-1970.6
TkA02G607700PF00954S_locus_glycop2593421.8e-0938.8
TkA02G607700PF08276PAN_24004310.008516.9
TkA02G607700PF00069Pkinase5348015.4e-45154.5
TkA02G607700PF07714PK_Tyr_Ser-Thr5348032.1e-41142.7
TkA02G607700PF03109ABC15375610.002617.7
TkA02G607700PF01636APH5816810.05214.0
TkA02G607700PF14531Kinase-like6227100.2611.2
TkA02G607700PF03109ABC16406890.002617.7
TkA02G607700PF05445Pox_ser-thr_kin6476700.3810.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FLV4拟南芥sp|Q9FLV4|Y5248_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g2408063.900%Swiss-Prot高置信
O64477拟南芥sp|O64477|Y2913_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g1913034.900%Swiss-Prot中等置信
Q8RWZ5拟南芥sp|Q8RWZ5|SD25_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-534.600%Swiss-Prot中等置信
Q9XID3拟南芥sp|Q9XID3|Y1343_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g3430035.700%Swiss-Prot中等置信
Q39203拟南芥sp|Q39203|SD22_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-233.900%Swiss-Prot中等置信

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