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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G605350
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 156160225-156163307 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1263 bp · TkA02G605350|TK1151|cDNA

ATGGGAAAGCTATGGGTTGGTGGGTTCTTTCTCTTATTCGCTTTTGCAAACACCAACCTCTCTTCCGGTTGTTTTGATCACGAAGGGCGAGCTCTCCTCCGATTCAAACACAACTTAGAATCAGACCCTTCTGGTCTACTCTCATCTTGGCACGGAAACAAGTGTTGCGAGTGGCAAGGCGTGGGCTGTGATAATGCAACCGGACATGTAACTAGGCTTCATCTCGGAAGAGATTCTTGGAGTTCCACACCGCGGTTAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1263 bp · TkA02G605350|TK1151|CDS

ATGGGAAAGCTATGGGTTGGTGGGTTCTTTCTCTTATTCGCTTTTGCAAACACCAACCTCTCTTCCGGTTGTTTTGATCACGAAGGGCGAGCTCTCCTCCGATTCAAACACAACTTAGAATCAGACCCTTCTGGTCTACTCTCATCTTGGCACGGAAACAAGTGTTGCGAGTGGCAAGGCGTGGGCTGTGATAATGCAACCGGACATGTAACTAGGCTTCATCTCGGAAGAGATTCTTGGAGTTCCACACCGCGGTTAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

420 aa · TkA02G605350|TK1151|PROTEIN

MGKLWVGGFFLLFAFANTNLSSGCFDHEGRALLRFKHNLESDPSGLLSSWHGNKCCEWQGVGCDNATGHVTRLHLGRDSWSSTPRLEGNKLDSSLAELTHLSYMDLSGNDFRGSSIPKFIESMSQLKYLNLSSAGFSGVVPHGIGNLSSLRILDLSYMELVVDDFEWFSGLLSLEHLDLSQLSISNARNLNMVLMYRIPSLRELRSSGCNLSNSHFTRTHLEPNLTLSTIYTLDLSLNSFQGEFPLFIQNLTSLHVLDLA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G605350
TK1151 IDTkA02G605350
OH-1004 IDLXL04_011896
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)62.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 60.000 / OH-1004 10.767
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G605350
位置Chr02:156160225-156163307 (+)
描述Similar to EIX2: Receptor-like protein EIX2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g25020 识别真菌（如B. cinerea和A. niger）的内聚半乳糖醛酸酶（PGs，例如。
Fungal endopolygalacturonases are recognized as microbe-associated molecular patterns by the arabidopsis receptor-like protein RESPONSIVENESS TO BOTRYTIS POLYGALACTURONASES1.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.230698
At3g25010 可能参与ABA诱导的衰老反应。
Gene silencing to investigate the roles of receptor-like proteins in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.4161/psb.3.10.6543
At3g24900 类受体蛋白39。 暂无已核实直接文献
At3g24982 类受体蛋白 40。 暂无已核实直接文献
At2g32660 类受体蛋白22。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011896 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002220 innate immune response activating cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
sly:543900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.779
排名 1 · TkA02G605350 · TK1151
内质网0.126
排名 2 · TkA02G605350 · TK1151
细胞质0.070
排名 3 · TkA02G605350 · TK1151
细胞核0.062
排名 4 · TkA02G605350 · TK1151
细胞外0.036
排名 5 · TkA02G605350 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00805Pentapeptide16-22 aa
PF08263LRRNT_226-64 aa
PF00560LRR_186-94 aa
PF12799LRR_486-111 aa
PF25013LRR_Zer-191-114 aa
PF13855LRR_893-111 aa
PF23598LRR_1493-179 aa
PF29594LRR_SKP297-156 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G605350PF00805Pentapeptide16220.05113.9
TkA02G605350PF08263LRRNT_226645.4e-1143.3
TkA02G605350PF00560LRR_186941.4e-2687.5
TkA02G605350PF12799LRR_4861111.4e-1970.4
TkA02G605350PF25013LRR_Zer-1911140.0002422.0
TkA02G605350PF13855LRR_8931111.3e-29102.4
TkA02G605350PF23598LRR_14931795.8e-2691.8
TkA02G605350PF29594LRR_SKP2971566e-0523.2
TkA02G605350PF13516LRR_6991110.07613.8
TkA02G605350PF24048LRR_NXF1-5991340.3811.1
TkA02G605350PF00560LRR_11001201.4e-2687.5
TkA02G605350PF12799LRR_41001331.4e-1970.4
TkA02G605350PF00805Pentapeptide1001150.05113.9
TkA02G605350PF23211LRR_LRWD11041800.01715.6
TkA02G605350PF24141LRR_ComC1151493.7e-0627.6
TkA02G605350PF13855LRR_81181571.3e-29102.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LJS0拟南芥sp|Q9LJS0|RLP42_ARATH Receptor-like protein 4235.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LJS2拟南芥sp|Q9LJS2|RLP41_ARATH Receptor-like protein 4133.500%Swiss-Prot中等置信
F4J7T6拟南芥sp|F4J7T6|RLP39_ARATH Receptor-like protein 3933.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LRW9拟南芥sp|Q9LRW9|RLP40_ARATH Receptor-like protein 4034.300%Swiss-Prot中等置信
O48851拟南芥sp|O48851|RLP22_ARATH Receptor like protein 2237.100%Swiss-Prot低置信

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