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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G604010
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 155733304-155734919 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

718 bp · TkA02G604010|TK1151|cDNA

TGCATAAGAACCAACTGAATTAGGGTTTTATTCATCGAAGACAAAGAAGTTTGCTGCCGCCGCCATGGTGTTGAAGACGGAGCTCTGCAGATTCAGTGGCCAGAAGATTTATCCTGGCAGGGGTATTAGATTCATTCGATCAGACTCGCAGGTCTTTCTGTTTGCAAATTCAAAGTGCAAGAGGTATTTCCACAATAAGCTTAAGCCCTCAAAGCTCACATGGACTGCCATGTACCGTAAGCAACATAAGAAGGACATTG...

CDS

下载 CDS FASTA

489 bp · TkA02G604010|TK1151|CDS

ATGGTGTTGAAGACGGAGCTCTGCAGATTCAGTGGCCAGAAGATTTATCCTGGCAGGGGTATTAGATTCATTCGATCAGACTCGCAGGTCTTTCTGTTTGCAAATTCAAAGTGCAAGAGGTATTTCCACAATAAGCTTAAGCCCTCAAAGCTCACATGGACTGCCATGTACCGTAAGCAACATAAGAAGGACATTGCTCAAGAGGCAGTGAAGAAGAGGCGTCGTGCCACCAAGAAGCCGTATTCAAGGGCTATTGTGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

162 aa · TkA02G604010|TK1151|PROTEIN

MVLKTELCRFSGQKIYPGRGIRFIRSDSQVFLFANSKCKRYFHNKLKPSKLTWTAMYRKQHKKDIAQEAVKKRRRATKKPYSRAIVGATLEVIQKKRSEKPEVRDAAREAALREIKERIKKTKDEKKAKKAEVVSKQKTQGKSGNVAKGGKGPKLGGGGGKR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G604010
TK1151 IDTkA02G604010
OH-1004 IDLXL04_011927
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.383 / OH-1004 62.646
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G604010
位置Chr02:155733304-155734919 (-)
描述Similar to RPL24: 60S ribosomal protein L24
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g53020 可能在重新启动参与生长素介导的雌蕊模式形成的 ETTIN 和 MONOPTEROS 基因翻译中具有核糖体外功能。
The Arabidopsis STV1 protein, responsible for translation reinitiation, is required for auxin-mediated gynoecium patterning.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.036533
At2g36620 可能在翻译再启动中具有核糖体外功能。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011927 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002181 cytoplasmic translation 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009955 adaxial/abaxial pattern specification 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0048467 gynoecium development 生物过程
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0022625 cytosolic large ribosomal subunit 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G36620
ath:AT3G53020
cam:101492846
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.857
排名 1 · TkA02G604010 · TK1151
细胞核0.225
排名 2 · TkA02G604010 · TK1151
内质网0.191
排名 3 · TkA02G604010 · TK1151
线粒体0.030
排名 4 · TkA02G604010 · TK1151
细胞膜0.028
排名 5 · TkA02G604010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01246Ribosomal_L24e3-67 aa
PF01080Presenilin61-156 aa
PF20882Sos776-136 aa
PF27644CDR2_C92-105 aa
PF27644CDR2_C114-133 aa
PF01246Ribosomal_L24e120-132 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G604010PF01246Ribosomal_L24e3671.2e-2899.8
TkA02G604010PF01080Presenilin611564.66.6
TkA02G604010PF20882Sos7761360.3411.8
TkA02G604010PF27644CDR2_C921051.98.8
TkA02G604010PF27644CDR2_C1141331.98.8
TkA02G604010PF01246Ribosomal_L24e1201321.2e-2899.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P38666拟南芥sp|P38666|RL242_ARATH Large ribosomal subunit protein eL24y86.500%Swiss-Prot高置信
Q42347拟南芥sp|Q42347|RL241_ARATH Large ribosomal subunit protein eL24z84.800%Swiss-Prot高置信

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