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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G567600
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 146642523-146644456 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1611 bp · TkA02G567600|TK1151|cDNA

ATGCTGATAATTATGGCGGTTTTACTGGTCGGCGCCGCTAGGGCGGCGGCCATCCCCTGCCCAGATTGCGGGAAAATTCCAGTCCTGTATCCACTCAGTACAACACCAACGTGTGGCCATCAATCATACAAGATTCGGTGCGATAGGGGTTTGTTGAAATTCGATTCCATCAATAACACTTACCCGATCATCTCAATCTTCCCCAAAAATCAACGCATGGTAATCGGTCAATCGCATCTATTACCAAACACCTGCGTCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1611 bp · TkA02G567600|TK1151|CDS

ATGCTGATAATTATGGCGGTTTTACTGGTCGGCGCCGCTAGGGCGGCGGCCATCCCCTGCCCAGATTGCGGGAAAATTCCAGTCCTGTATCCACTCAGTACAACACCAACGTGTGGCCATCAATCATACAAGATTCGGTGCGATAGGGGTTTGTTGAAATTCGATTCCATCAATAACACTTACCCGATCATCTCAATCTTCCCCAAAAATCAACGCATGGTAATCGGTCAATCGCATCTATTACCAAACACCTGCGTCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

536 aa · TkA02G567600|TK1151|PROTEIN

MLIIMAVLLVGAARAAAIPCPDCGKIPVLYPLSTTPTCGHQSYKIRCDRGLLKFDSINNTYPIISIFPKNQRMVIGQSHLLPNTCVMADFVTMAYSSFVNLNISLPISKWPDPGVELIWAPPPEPPCTSQGHCDSTSTCRDDHDGTRRCFCNPKFRWDANTGQCAKDLKKARAKRKSLLAITICIGVIIFLTVVFAITMFIRRQRIKRARKRRSRERQEIVGSTSGTGRSSRIFSNKEIKKATNNFSSTGLLGVGGFGEV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G567600
TK1151 IDTkA02G567600
OH-1004 IDLXL04_012391
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)85.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G567600
位置Chr02:146642523-146644456 (-)
描述Similar to WAKL20: Wall-associated receptor kinase-like 20
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g02070 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At3g53840 推定的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能作为细胞外基质组分的信号受体。 暂无已核实直接文献
At5g66790 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At1g69730 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At1g79680 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012391 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004383 guanylate cyclase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G69730
ath:AT1G79680
ath:AT3G53840
ath:AT5G02070
ath:AT5G66790
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.874
排名 1 · TkA02G567600 · TK1151
细胞质0.087
排名 2 · TkA02G567600 · TK1151
内质网0.070
排名 3 · TkA02G567600 · TK1151
细胞核0.054
排名 4 · TkA02G567600 · TK1151
溶酶体／液泡0.022
排名 5 · TkA02G567600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13947GUB_WAK_bind20-75 aa
PF01683EB123-164 aa
PF12946EGF_MSP1_1127-161 aa
PF12947EGF_3129-158 aa
PF25387ADGRF3_N136-162 aa
PF17204Sid-5163-212 aa
PF27960NCMAP182-219 aa
PF13314DUF4083182-211 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G567600PF13947GUB_WAK_bind20751.3e-0629.4
TkA02G567600PF01683EB1231640.2112.4
TkA02G567600PF12946EGF_MSP1_11271610.03614.8
TkA02G567600PF12947EGF_31291584.58.3
TkA02G567600PF25387ADGRF3_N1361620.006617.6
TkA02G567600PF17204Sid-51632120.001819.1
TkA02G567600PF27960NCMAP1822190.02315.3
TkA02G567600PF13314DUF40831822110.03614.8
TkA02G567600PF14575EphA2_TM1822150.2712.7
TkA02G567600PF00069Pkinase2495154.7e-44151.5
TkA02G567600PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2515172.2e-47162.3
TkA02G567600PF03109ABC12523001.2e-0525.4
TkA02G567600PF12330Haspin_kinase3403980.06413.0
TkA02G567600PF03109ABC13443971.2e-0525.4
TkA02G567600PF25387ADGRF3_N4154230.006617.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LZM4拟南芥sp|Q9LZM4|WAKLQ_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 2051.100%Swiss-Prot高置信
Q9M342拟南芥sp|Q9M342|WAKLP_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 1552.500%Swiss-Prot高置信
Q8GYF5拟南芥sp|Q8GYF5|WAKLR_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 2140.500%Swiss-Prot中等置信
Q9C9L5拟南芥sp|Q9C9L5|WAKLH_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 948.500%Swiss-Prot中等置信
Q8VYA3拟南芥sp|Q8VYA3|WAKLJ_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 1047.700%Swiss-Prot中等置信

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