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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G550390
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 142008767-142013242 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2728 bp · TkA02G550390|TK1151|cDNA

ACCGAATGCTATCTTGCGGAATGGATAACGGTAATCCCACCAGATAAGAGAGACCCCCGAAGCTTCTCTCTCCTCCTTCCCAGTCATCACTCTTCCATGGCGCTTCTGCAATCTGCACCTTCTACTAGCGGTAGTTCTACACAATCACCATTAACAAACCGCCCTCTCATCCACACTCCCTTCATATTCCCCTCCACTTCCTTCAAATTACCCCCAATTTCTACTAACTACTCCCTTAAGTCTAAGCACAGCAACTCTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

2394 bp · TkA02G550390|TK1151|CDS

ATGGCGCTTCTGCAATCTGCACCTTCTACTAGCGGTAGTTCTACACAATCACCATTAACAAACCGCCCTCTCATCCACACTCCCTTCATATTCCCCTCCACTTCCTTCAAATTACCCCCAATTTCTACTAACTACTCCCTTAAGTCTAAGCACAGCAACTCTCGTTTCCGCATTCGTGCATCTGCAACTCTTGAATCCACCAATGGCGCCGCCACCATCACCGTTGGACCTGATAGTCTCTCTTCCACCGTCAACACCAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

797 aa · TkA02G550390|TK1151|PROTEIN

MALLQSAPSTSGSSTQSPLTNRPLIHTPFIFPSTSFKLPPISTNYSLKSKHSNSRFRIRASATLESTNGAATITVGPDSLSSTVNTSGIPYGRQYFPLAAVVGQDAIKTALLLGAIDREIGGIAISGKRGTAKTVMARGLHAILPPIDVVVGSTSNADPACREEIAMFLRNQWSNNKLCFTYNSQRWEDGLADRVEYDSAGNVKTQVVKSPFVQIPLGVTEDRLIGSVDVEESIKSGTTVFQPGLLAEAHRGVLYVDEIN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G550390
TK1151 IDTkA02G550390
OH-1004 IDLXL04_010303
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)36.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 41.280 / OH-1004 71.934
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G550390
位置Chr02:142008767-142013242 (+)
描述Similar to CHLI: Magnesium-chelatase subunit ChlI, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g08520 参与叶绿素生物合成。
Integrating the genetic and physical maps of Arabidopsis thaliana: identification of mapped alleles of cloned essential (EMB) genes.2009 · DOI: 10.1371/journal.pone.0007386
Roles of the different components of magnesium chelatase in abscisic acid signal transduction.2012 · DOI: 10.1007/s11103-012-9965-3

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8AMB8 参与叶绿素生物合成。 暂无已核实直接文献
Os03g0811100 参与叶绿素生物合成。
Rice Chlorina-1 and Chlorina-9 encode ChlD and ChlI subunits of Mg-chelatase, a key enzyme for chlorophyll synthesis and chloroplast development.2006 · DOI: 10.1007/s11103-006-9024-z
C-terminal residues of oryza sativa GUN4 are required for the activation of the ChlH subunit of magnesium chelatase in chlorophyll synthesis.2012 · DOI: 10.1016/j.febslet.2011.12.026
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010303 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0015979 photosynthesis 生物过程
GO:0015995 chlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0010007 magnesium chelatase complex 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016851 magnesium chelatase activity 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G18480
ath:AT5G45930
dosa:Os03g0563300
gmx:100784256
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.906
排名 1 · TkA02G550390 · TK1151
细胞核0.066
排名 2 · TkA02G550390 · TK1151
线粒体0.062
排名 3 · TkA02G550390 · TK1151
细胞质0.051
排名 4 · TkA02G550390 · TK1151
过氧化物酶体0.029
排名 5 · TkA02G550390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF15700DUF466731-72 aa
PF01078Mg_chelatase98-148 aa
PF00493MCM101-116 aa
PF07724AAA_2119-144 aa
PF00158Sigma54_activat123-142 aa
PF07728AAA_5125-144 aa
PF00158Sigma54_activat210-298 aa
PF07728AAA_5213-309 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G550390PF15700DUF466731723.78.5
TkA02G550390PF01078Mg_chelatase981489.5e-1245.5
TkA02G550390PF00493MCM1011160.0004220.2
TkA02G550390PF07724AAA_21191440.1812.6
TkA02G550390PF00158Sigma54_activat1231420.0001222.6
TkA02G550390PF07728AAA_51251443.9e-0524.4
TkA02G550390PF00158Sigma54_activat2102980.0001222.6
TkA02G550390PF07728AAA_52133093.9e-0524.4
TkA02G550390PF00493MCM2303190.0004220.2
TkA02G550390PF01078Mg_chelatase2353089.5e-1245.5
TkA02G550390PF07724AAA_22442900.1812.6
TkA02G550390PF07724AAA_23453790.1812.6
TkA02G550390PF15700DUF46673644983.78.5
TkA02G550390PF17863AAA_lid_23824473.9e-1349.7
TkA02G550390PF05308Mito_fiss_reg4044923.88.3
TkA02G550390PF10152CCDC534074880.01716.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SJE1拟南芥sp|Q9SJE1|CHLD_ARATH Magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic81.900%Swiss-Prot高置信
B8AMB8水稻sp|B8AMB8|CHLD_ORYSI Magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic81.900%Swiss-Prot高置信
Q6ATS0水稻sp|Q6ATS0|CHLD_ORYSJ Magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic81.900%Swiss-Prot高置信

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