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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G546890
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 141108573-141113407 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2685 bp · TkA02G546890|TK1151|cDNA

ACACAAAGAACACCCCACTCTTCACATCTCAGTTAAGAGCAGAGAGCAGAGACTAGAGAGGAGAAGAGACGAGTGACTTGGGAACTGCATCACTGCCTTTAAAGATAAAACACCCACCATCTTAGCTAGGGTTTCATCTTCTTTTTCTTCTTCAAGCTTCCGCTATTTCACCCCAATCGGGTCACTACACTTGCAGATTACCAACTTCCCCCCTCCGTACAACTCTAATCTCTCAGGTCACTGTGGGTCAACTTTCTTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1827 bp · TkA02G546890|TK1151|CDS

ATGCAAACACCAAAGCCCAGAGTCGGAACCTTGGAGGTGCCACAGAGGACACCTAAGACGGCTAGGCAGCTCAAAACTTCAGGGACAGAACCGGAAAATTCTTCCGTTCAAAGTCCGGTAACAAGAACGCCTAAACCTAGGAGTCCCAAAGTTTCTGGCCGGTCACCTCGTACTCCAACGTCCGAGAAAAAACGTCCTGGGAGAGTGGCGGAACTGGAAACCCAGCTTGCTAATCTTCAGGAAGAACTTAAGAAAGCCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

608 aa · TkA02G546890|TK1151|PROTEIN

MQTPKPRVGTLEVPQRTPKTARQLKTSGTEPENSSVQSPVTRTPKPRSPKVSGRSPRTPTSEKKRPGRVAELETQLANLQEELKKAKDQLSESEANKKRASEDADVAKKQLADMSEKLQDSQQQLDEISASEESRLQELRKISQDRDRAWESELEAVQKHHSMDSAALASAMNEIQKLKNQLEELSESEANQAKYAESAHNDVLALRLELSETLAVVEELKNELNDSKYSEAKALEIISQTKEQLETVKSTEETLRSEKA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G546890
TK1151 IDTkA02G546890
OH-1004 IDLXL04_014814
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)37.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.875 / OH-1004 81.188
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G546890
位置Chr02:141108573-141113407 (+)
描述Similar to ICR3: Interactor of constitutive active ROPs 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g37080 作为支架，介导 ROP 与不同蛋白质的相互作用。 暂无已核实直接文献
At5g60210 作为支架，介导 ROP 与不同蛋白质的相互作用。 暂无已核实直接文献
At3g53350 ROP效应子结合蛋白，特异性激活ROPs并将其连接到微管细胞骨架。
Rho of plant GTPase signaling regulates the behavior of Arabidopsis kinesin-13A to establish secondary cell wall patterns.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.117853
At1g78430 作为支架，介导 ROP 与不同蛋白质的相互作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014814 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009664 plant-type cell wall organization 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:2000012 regulation of auxin polar transport 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0090404 pollen tube tip 细胞组分
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17140
ath:AT1G78430
ath:AT2G37080
ath:AT3G53350
ath:AT5G60210
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.538
排名 1 · TkA02G546890 · TK1151
细胞膜0.263
排名 2 · TkA02G546890 · TK1151
细胞核0.221
排名 3 · TkA02G546890 · TK1151
质体0.078
排名 4 · TkA02G546890 · TK1151
高尔基体0.066
排名 5 · TkA02G546890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08614ATG1628-141 aa
PF07888CALCOCO167-223 aa
PF13851GAS67-161 aa
PF24161CCDC3969-315 aa
PF30358GOLM69-141 aa
PF30778SBP_bac_4HB71-144 aa
PF27682ICR5_C75-126 aa
PF10432bact-PGI_C101-139 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G546890PF08614ATG16281410.05214.4
TkA02G546890PF07888CALCOCO1672230.005116.5
TkA02G546890PF13851GAS671610.02914.5
TkA02G546890PF24161CCDC39693150.249.9
TkA02G546890PF30358GOLM691411.69.1
TkA02G546890PF30778SBP_bac_4HB711440.004318.0
TkA02G546890PF27682ICR5_C751261.7e-2177.7
TkA02G546890PF10432bact-PGI_C1011394.57.9
TkA02G546890PF08614ATG161352230.05214.4
TkA02G546890PF07888CALCOCO11443290.005116.5
TkA02G546890PF27682ICR5_C1652101.7e-2177.7
TkA02G546890PF30778SBP_bac_4HB1661890.004318.0
TkA02G546890PF30358GOLM1682421.69.1
TkA02G546890PF13851GAS1712280.02914.5
TkA02G546890PF30778SBP_bac_4HB1731900.004318.0
TkA02G546890PF10432bact-PGI_C1772704.57.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZQC5拟南芥sp|Q9ZQC5|ICR2_ARATH Interactor of constitutive active ROPs 2, chloroplastic39.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LSS5拟南芥sp|Q9LSS5|ICR3_ARATH Interactor of constitutive active ROPs 338.200%Swiss-Prot中等置信
Q8VYU8拟南芥sp|Q8VYU8|ICR5_ARATH Interactor of constitutive active ROPs 532.400%Swiss-Prot中等置信
Q9M9F9拟南芥sp|Q9M9F9|ICR4_ARATH Interactor of constitutive active ROPs 432.500%Swiss-Prot低置信

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