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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G540240
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 139362011-139363618 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1426 bp · TkA02G540240|TK1151|cDNA

TTAGAATATTCGCATCCATTCACGGAAAATACGGTGTTAGTTTCTGTTATAAAAAGCACATGCGCATCCGTCTCTCCGTAACAACTACCCAACTATCAAACCAACCTAACATGAACGAGGCTCTTAACAACGATTATCAAGTCTGCGAGGAGATCGGCCGGGGTCGCTTCGGCATCGTTTACCGCTGTTATTCCACCGTCTCCGGTGACTCATTCGCCTGTAAGTCCATCGACAAACGCCTCCTCGCTGATCCCACAGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

897 bp · TkA02G540240|TK1151|CDS

ATGCGCATCCGTCTCTCCGTAACAACTACCCAACTATCAAACCAACCTAACATGAACGAGGCTCTTAACAACGATTATCAAGTCTGCGAGGAGATCGGCCGGGGTCGCTTCGGCATCGTTTACCGCTGTTATTCCACCGTCTCCGGTGACTCATTCGCCTGTAAGTCCATCGACAAACGCCTCCTCGCTGATCCCACAGACCGTGAGTGCCTACAAAAAGAACCTAAAATCCTCCATATCCTCGGCGGAAATTCTAACAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

298 aa · TkA02G540240|TK1151|PROTEIN

MRIRLSVTTTQLSNQPNMNEALNNDYQVCEEIGRGRFGIVYRCYSTVSGDSFACKSIDKRLLADPTDRECLQKEPKILHILGGNSNIVQIHRLYEEENYLHMIIDLCDTPDLFDRISKQAEVFSESEAASIFSQLILAISYCHRLGIAHRDIKPDNVLFDSRENLKLADFGSAEWFGMNERRTMTGVVGTPYYVAPEVLSGREYNEKVDVWSAGVILYIMLAGVPPFYGETPAETFEAVLRGNLRFPTRLFRNVSPEAKD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G540240
TK1151 IDTkA02G540240
OH-1004 IDLXL04_012750
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.973 / OH-1004 95.017
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G540240
位置Chr02:139362011-139363618 (-)
描述Similar to PPCK1: Phosphoenolpyruvate carboxylase kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g08650 一种钙离子非依赖性激酶，参与光依赖性磷酸烯醇丙酮酸羧化酶的磷酸化。 暂无已核实直接文献
At3g04530 一种钙离子非依赖性激酶，参与光依赖性磷酸烯醇丙酮酸羧化酶的磷酸化。 暂无已核实直接文献
At1g61950 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At4g04720 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At1g50700 Ca²⁺-依赖性蛋白激酶。
THI1, a Thiamine Thiazole Synthase, Interacts with Ca2+-Dependent Protein Kinase CPK33 and Modulates the S-Type Anion Channels and Stomatal Closure in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1104/pp.15.01649

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012750 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046898 response to cycloheximide 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08650
ath:AT1G61950
ath:AT1G76040
ath:AT3G04530
ath:AT4G04720
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.602
排名 1 · TkA02G540240 · TK1151
细胞核0.552
排名 2 · TkA02G540240 · TK1151
细胞膜0.062
排名 3 · TkA02G540240 · TK1151
线粒体0.042
排名 4 · TkA02G540240 · TK1151
内质网0.037
排名 5 · TkA02G540240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase26-285 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr28-280 aa
PF12330Haspin_kinase33-172 aa
PF14045YIEGIA66-122 aa
PF17667Pkinase_fungal72-101 aa
PF03109ABC1105-185 aa
PF06293Kdo106-167 aa
PF14531Kinase-like129-273 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G540240PF00069Pkinase262855.2e-73246.4
TkA02G540240PF07714PK_Tyr_Ser-Thr282805.5e-31108.5
TkA02G540240PF12330Haspin_kinase331720.01515.1
TkA02G540240PF14045YIEGIA661220.3710.3
TkA02G540240PF17667Pkinase_fungal721010.0313.8
TkA02G540240PF03109ABC11051850.02314.6
TkA02G540240PF06293Kdo1061670.01515.4
TkA02G540240PF14531Kinase-like1292736.5e-0626.3
TkA02G540240PF17667Pkinase_fungal1442120.0313.8
TkA02G540240PF01636APH1441730.06813.6
TkA02G540240PF05445Pox_ser-thr_kin1441670.3110.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SPK4拟南芥sp|Q9SPK4|PPCK1_ARATH Phosphoenolpyruvate carboxylase kinase 158.000%Swiss-Prot高置信
Q93VK0拟南芥sp|Q93VK0|PPCK2_ARATH Phosphoenolpyruvate carboxylase kinase 254.700%Swiss-Prot高置信
Q1PFH8拟南芥sp|Q1PFH8|CDPKJ_ARATH Calcium-dependent protein kinase 1944.700%Swiss-Prot中等置信
Q9ZSA2拟南芥sp|Q9ZSA2|CDPKL_ARATH Calcium-dependent protein kinase 2143.600%Swiss-Prot中等置信
Q9C6P3拟南芥sp|Q9C6P3|CDPKX_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3343.300%Swiss-Prot中等置信

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