TkA02G537470 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G537470

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 138619704-138622148 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1610 bp · TkA02G537470|TK1151|cDNA

TAGACCGTCAATATCTACCTCTTCAAATACTATCACCCTCCTAGACTCCTACCCTCAAATTCCAAGCACTCCTCTCGACCAACACAACCAAGCCAAGTCTTCCCTCCTCCCTTAGGATCTACTTCTTCGTAGTTTTGTAATTGAGTATTGAAGATCGAAGAACAGGATGTTTGGAAGAGCACCCAAGAAGAGCGATAATACGAAGTACTATGAGATCCTTGGGGTCCCGAAGAATGCTTCCCAGGATGATCTCAAGAAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1263 bp · TkA02G537470|TK1151|CDS

ATGTTTGGAAGAGCACCCAAGAAGAGCGATAATACGAAGTACTATGAGATCCTTGGGGTCCCGAAGAATGCTTCCCAGGATGATCTCAAGAAGGCTTATCGTAAAGCCGCCATTAAAAATCACCCTGATAAGGGAGGAGATCCTGAGAAGTTTAAAGAGCTTGCCCAAGCCTATGAGGTATTGAGTGACCCAGAGAAGCGTGAGATATATGACCAGTATGGTGAGGATGCCTTGAAAGAAGGAATGGGAGGTGGAGGTGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

420 aa · TkA02G537470|TK1151|PROTEIN

MFGRAPKKSDNTKYYEILGVPKNASQDDLKKAYRKAAIKNHPDKGGDPEKFKELAQAYEVLSDPEKREIYDQYGEDALKEGMGGGGGGHDPFDIFQSFFGGGNPFGGAGGSRGGRRQRRGEDVIHPLKVSLEDLYNGISKKLSLSRNVLCSKCKGKGSKSGASMKCAGCQGSGMKVSIRHLGPSMIQQMQHPCNECKGTGETINDKDRCPQCKGEKVVQEKKVLEVHVEKGMQNSQKITFPGEADEAPDTVTGDIVFVLQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G537470`
TK1151 ID	TkA02G537470
OH-1004 ID	LXL04_012801
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	97.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G537470

位置 Chr02:138619704-138622148 (+)

描述 Similar to DNAJ1: DnaJ protein homolog

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g22060`	在植物发育中可能持续发挥作用，可能涉及细胞隔间的结构组织。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012801 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006457 protein folding 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0034605 cellular response to heat 生物过程

GO:0042026 protein refolding 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0001671 ATPase activator activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G22060

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.693

排名 1 · TkA02G537470 · TK1151

细胞核0.407

排名 2 · TkA02G537470 · TK1151

细胞膜0.140

排名 3 · TkA02G537470 · TK1151

内质网0.103

排名 4 · TkA02G537470 · TK1151

线粒体0.074

排名 5 · TkA02G537470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00226DnaJ13-71 aa

PF30912TIM141_C16-53 aa

PF01556DnaJ_C125-345 aa

PF30912TIM141_C139-158 aa

PF18551TackOD1145-172 aa

PF27659CHP02642146-174 aa

PF01155HypA147-176 aa

PF25436BSD2_CRD147-175 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G537470	`PF00226`	DnaJ	13	71	4.2e-24	85.1
TkA02G537470	`PF30912`	TIM141_C	16	53	2.5e-05	24.9
TkA02G537470	`PF01556`	DnaJ_C	125	345	6.8e-36	124.3
TkA02G537470	`PF30912`	TIM141_C	139	158	2.5e-05	24.9
TkA02G537470	`PF18551`	TackOD1	145	172	0.23	11.7
TkA02G537470	`PF27659`	CHP02642	146	174	1.5	9.0
TkA02G537470	`PF01155`	HypA	147	176	0.066	14.0
TkA02G537470	`PF25436`	BSD2_CRD	147	175	0.24	12.3
TkA02G537470	`PF22289`	DmmA-like_C	148	170	5.7	7.7
TkA02G537470	`PF15777`	Anti-TRAP	149	174	0.0013	19.4
TkA02G537470	`PF07191`	Zn_ribbon_6	149	196	5.4	7.8
TkA02G537470	`PF28686`	HUA1_small	149	169	8.5	7.0
TkA02G537470	`PF00684`	DnaJ_CXXCXGXG	150	216	1.6e-15	57.9
TkA02G537470	`PF15777`	Anti-TRAP	187	218	0.0013	19.4
TkA02G537470	`PF01155`	HypA	187	217	0.066	14.0
TkA02G537470	`PF18551`	TackOD1	189	223	0.23	11.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P42825`	拟南芥	sp\|P42825\|DNAJ2_ARATH Chaperone protein dnaJ 2	77.800%	Swiss-Prot	高置信

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