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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G519400
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 133863095-133867263 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2547 bp · TkA02G519400|TK1151|cDNA

GAGAAGTAGAAGATAGTCTGAACTCCAAAAGCTCCACCACCACCAACATCATTCCTCCTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCTGCAACTCCTTGAACTGCGTGCTCGGAAATCAGACACTAGCTGACCGTTGCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGGAGAACAGGCGAGCATCATTAACGGCGATCACTGTAGCTCTCAACCATTACAACAGTTTCAAGCTTTGTTGTTTCACTGTGAAGTATGTCTGTAGCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1794 bp · TkA02G519400|TK1151|CDS

ATGAAGCTCCACGTGGAAGTTTCTTTGGTTTTCTTCATTAGCTTGATCTTGATTCAACACACCATTTGCACAGATGAAGTTCCAGACATAAACAAGTGGACATGTACATGCTATGCAAACCAACTATACCATCATGTCATCCTTCCACCCCAATGCTCTTCTTCATGTAACTGCACCTCAGAAAGTACAAGTCAAAGTAGATGGAAATGCATATGTCCAAGCGATAAACTACCTGAAGTGGCTACAAGTAATGATACTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

597 aa · TkA02G519400|TK1151|PROTEIN

MKLHVEVSLVFFISLILIQHTICTDEVPDINKWTCTCYANQLYHHVILPPQCSSSCNCTSESTSQSRWKCICPSDKLPEVATSNDTNCFMSCNCNSGTLIKSESLKKQFSSKSVLIILLLCMVVTTLAIFASIMFYIYRKHTNPKQPPLSSSSDKDTSYNSTTNLISYKASSLQDSKIYIHSPKNPFTGFIYKASFLFRKQPRTVQGTITSFSYYELETATNKFSENNLIGVGVSSHVYYGQLKDGKLVAVKRLKSHGGP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G519400
TK1151 IDTkA02G519400
OH-1004 IDLXL04_013062
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G519400
位置Chr02:133863095-133867263 (+)
描述Similar to NCRK: Receptor-like serine/threonine-protein kinase NCRK
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g28250 类受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶NCRK。 暂无已核实直接文献
At1g70460 负向调控根毛伸长。 暂无已核实直接文献
At1g26150 可能参与根生长的负调控。 暂无已核实直接文献
At5g38560 可能参与根生长的负调控。
PERK-KIPK-KCBP signalling negatively regulates root growth in Arabidopsis thaliana.2015 · DOI: 10.1093/jxb/eru390
At1g68690 可能参与根生长的负调控。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013062 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010089 xylem development 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:1990641 response to iron ion starvation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0010008 endosome membrane 细胞组分
GO:0012505 endomembrane system 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G26150
ath:AT1G68690
ath:AT1G70460
ath:AT2G28250
ath:AT5G38560
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.777
排名 1 · TkA02G519400 · TK1151
细胞质0.125
排名 2 · TkA02G519400 · TK1151
细胞核0.117
排名 3 · TkA02G519400 · TK1151
内质网0.083
排名 4 · TkA02G519400 · TK1151
溶酶体／液泡0.033
排名 5 · TkA02G519400 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02430AMA-151-145 aa
PF06084Cytomega_TRL1055-140 aa
PF00069Pkinase225-502 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr228-504 aa
PF01636APH230-312 aa
PF03109ABC1236-255 aa
PF17667Pkinase_fungal255-303 aa
PF17667Pkinase_fungal333-380 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G519400PF02430AMA-1511450.002917.1
TkA02G519400PF06084Cytomega_TRL10551403.08.6
TkA02G519400PF00069Pkinase2255029.8e-41140.6
TkA02G519400PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2285043.3e-38132.2
TkA02G519400PF01636APH2303120.002918.1
TkA02G519400PF03109ABC12362550.008116.1
TkA02G519400PF17667Pkinase_fungal2553030.04313.3
TkA02G519400PF17667Pkinase_fungal3333800.04313.3
TkA02G519400PF01636APH3393660.002918.1
TkA02G519400PF03109ABC13403780.008116.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VYY5拟南芥sp|Q8VYY5|NCRK_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase NCRK53.500%Swiss-Prot高置信
Q9CAL8拟南芥sp|Q9CAL8|PEK13_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1346.500%Swiss-Prot低置信
Q9C660拟南芥sp|Q9C660|PEK10_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1044.700%Swiss-Prot中等置信
Q9FFW5拟南芥sp|Q9FFW5|PERK8_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK846.000%Swiss-Prot低置信
Q9SX31拟南芥sp|Q9SX31|PERK9_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK945.700%Swiss-Prot中等置信

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