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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G511430
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 131304290-131305546 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

738 bp · TkA02G511430|TK1151|cDNA

TTGCTTTTAGTTTCAACGCGTATAACCCTTCCTCTCTCGTCTCCTTATTTCCTCCGCATCTCCTTTCAAATCCCTAATTCACTTTTCCGATCTGATTTTTCTCTCGATCTCTTGACAATGGATGCTTTGGATTCAGTCTTCGAGCCATTGAGAGAGTTCTCAAAGGATAGCTACCGTCTAGTCAAGAGATGCCACAAGCCTGATCGTAAAGAATTCTCGAAGGTTGCAGTTCGTACAGCGATTGGTTTCGTGGTGATGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

327 bp · TkA02G511430|TK1151|CDS

TTGCTTTTAGTTTCAACGCGTATAACCCTTCCTCTCTCGTCTCCTTATTTCCTCCGCATCTCCTTTCAAATCCCTAATTCACTTTTCCGATCTGATTTTTCTCTCGATCTCTTGACAATGGATGCTTTGGATTCAGTCTTCGAGCCATTGAGAGAGTTCTCAAAGGATAGCTACCGTCTAGTCAAGAGATGCCACAAGCCTGATCGTAAAGAATTCTCGAAGGTTGCAGTTCGTACAGCGATTGGTTTCGTGGTGATGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

108 aa · TkA02G511430|TK1151|PROTEIN

LLLVSTRITLPLSSPYFLRISFQIPNSLFRSDFSLDLLTMDALDSVFEPLREFSKDSYRLVKRCHKPDRKEFSKVAVRTAIGFVVMGFVGFFVKLIFIPINNIIVGSV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G511430
TK1151 IDTkA02G511430
OH-1004 IDLXL04_013212
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)96.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 71.296 / OH-1004 56.618
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G511430
位置Chr02:131304290-131305546 (-)
描述Similar to SEC61G2: Protein transport protein Sec61 subunit gamma-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g24920 对内质网中的蛋白质转运是必需的。 暂无已核实直接文献
At5g50460 对内质网中的蛋白质转运是必需的。 暂无已核实直接文献
At3g48570 对内质网中的蛋白质转运是必需的。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0178400 对内质网中的蛋白质转运是必需的。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013212 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0030728 ovulation 生物过程
GO:0031204 post-translational protein targeting to membrane, translocation 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005784 Sec61 translocon complex 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0071261 Ssh1 translocon complex 细胞组分
GO:0008320 protein transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015450 protein-transporting ATPase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G48570
ath:AT4G24920
ath:AT5G50460
cel:CELE_F32D8.6
dosa:Os02g0178400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.656
排名 1 · TkA02G511430 · TK1151
高尔基体0.185
排名 2 · TkA02G511430 · TK1151
细胞核0.113
排名 3 · TkA02G511430 · TK1151
细胞质0.085
排名 4 · TkA02G511430 · TK1151
细胞膜0.056
排名 5 · TkA02G511430 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00584SecE52-104 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G511430PF00584SecE521046.4e-1452.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P0DI74拟南芥sp|P0DI74|S61G1_ARATH Protein transport protein Sec61 subunit gamma-188.200%Swiss-Prot中等置信
P0DI75拟南芥sp|P0DI75|S61G2_ARATH Protein transport protein Sec61 subunit gamma-288.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SMP2拟南芥sp|Q9SMP2|S61G3_ARATH Protein transport protein Sec61 subunit gamma-382.400%Swiss-Prot中等置信
P38385水稻sp|P38385|SC61G_ORYSJ Protein transport protein Sec61 subunit gamma89.700%Swiss-Prot中等置信

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