TkA02G508610 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G508610

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 130531778-130535529 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3420 bp · TkA02G508610|TK1151|cDNA

TATTTTTAAATTTTCTTTCTTTTCTTTTAGTTTTCTATTATTATTAAATATAAAAAGGCCCCACTTAACTACCAAAATATATATATCTCTCTCTCTCACATCAAAACTACCAGCTTTATCCTTTCTTGTTTCGTGTCTTGATGTGCTGAAAGCACAAGCAACAGAGACACAGAAATCAGAGTAGGTCGGTGAGACAAACGGAGGAGTAGGACAGCGATTTCCGGGTCGACGAGGGAAGAGGAGCAGCCACCTGGGTCGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1842 bp · TkA02G508610|TK1151|CDS

ATGGATTCGATTATCAACGGAGTTGGTTCTTTGCCAACAAACCACAACTCTACCACCATGTTCCGTTCAAAAACCCGACCTCCTCATCCGCGCTCAGGAAAACAATCAAACCGCGAAAGATCTCCATCTTCATCTCATTTCTTACAAGATATTTCCTCAATGTCCGTTGCCAGTTCTTACAAAACCTCCAAGGATTACATCGAAAAAGAAGCCATACCATCCACCCACTCAAAACCTAATTCCGCACCCGAAAAACGCAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

613 aa · TkA02G508610|TK1151|PROTEIN

MDSIINGVGSLPTNHNSTTMFRSKTRPPHPRSGKQSNRERSPSSSHFLQDISSMSVASSYKTSKDYIEKEAIPSTHSKPNSAPEKRKPDCQSARDYFRTQILEVEAKFGSKQPINPPFAMNTDRGPPHGPTASPQNSFYSVTQFSEAKESFTSTELSEFASSIGKGDESGQTSDYLESNKTSSIYRESTDSDDLSDDSTSSSFNSAIYKPHKQNDTRWEAIQIVRSRNETGMIEIRNFRHLKQLGCGDIGSVYLSELIGT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G508610`
TK1151 ID	TkA02G508610
OH-1004 ID	LXL04_013268
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G508610

位置 Chr02:130531778-130535529 (+)

描述 Similar to Protein kinase PVPK-1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g47750`	蛋白激酶，通过直接磷酸化调节 PIN 生长素外排促进剂的生长素转运活性。	D6PK AGCVIII kinases are required for auxin transport and phototropic hypocotyl bending in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111484
`At3g27580`	蛋白激酶，通过直接磷酸化调节PIN生长素外排载体的生长素运输活性。	D6PK AGCVIII kinases are required for auxin transport and phototropic hypocotyl bending in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111484

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os06g0291600`	可能在代谢调节和信号转导过程中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`UniProt: A2YBX5`	可能在代谢调节和信号转导过程中发挥作用。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013268 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0009555 pollen development 生物过程

GO:0009638 phototropism 生物过程

GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程

GO:0010540 basipetal auxin transport 生物过程

GO:0062075 pollen aperture formation 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005730 nucleolus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G27580

ath:AT5G47750

dosa:Os06g0291600

osa:4340792

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.644

排名 1 · TkA02G508610 · TK1151

细胞核0.305

排名 2 · TkA02G508610 · TK1151

细胞膜0.152

排名 3 · TkA02G508610 · TK1151

线粒体0.054

排名 4 · TkA02G508610 · TK1151

高尔基体0.046

排名 5 · TkA02G508610 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase239-393 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr241-388 aa

PF03109ABC1298-385 aa

PF01163RIO1309-382 aa

PF01163RIO1433-486 aa

PF00069Pkinase472-575 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr479-562 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G508610	`PF00069`	Pkinase	239	393	3e-58	198.0
TkA02G508610	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	241	388	4e-28	99.2
TkA02G508610	`PF03109`	ABC1	298	385	0.0017	18.3
TkA02G508610	`PF01163`	RIO1	309	382	0.0047	17.3
TkA02G508610	`PF01163`	RIO1	433	486	0.0047	17.3
TkA02G508610	`PF00069`	Pkinase	472	575	3e-58	198.0
TkA02G508610	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	479	562	4e-28	99.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q39183`	拟南芥	sp\|Q39183\|D6KL2_ARATH Serine/threonine-protein kinase D6PKL2	71.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q05999`	拟南芥	sp\|Q05999\|D6KL3_ARATH Serine/threonine-protein kinase D6PKL3	64.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q0DCT8`	水稻	sp\|Q0DCT8\|G11A_ORYSJ Protein kinase G11A	66.400%	Swiss-Prot	高置信
`A2YBX5`	水稻	sp\|A2YBX5\|G11A_ORYSI Protein kinase G11A	66.400%	Swiss-Prot	高置信

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