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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G499600
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 128026277-128027806 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1356 bp · TkA02G499600|TK1151|cDNA

GCAAATCAGCTATCGAGGTATGAATCATACGTTCATTTACTTAAGAAAACATATAGATATAAGATGATATGGCGACCTACAGGTTCCTTGGCATGTTCCATGTGGCGGACTCTGCTACGGAGACGGAAATTTGGTATTCATTGCTAACGATGGCATACTGCATTATTACCAGTATACCTCAAAGCATATTACCACGAACACGGATTAATGCAATACGCAAGATCCGTCCTCGTCATTCACAACATCGCTCATCAGGGACG...

CDS

下载 CDS FASTA

909 bp · TkA02G499600|TK1151|CDS

ATGGCGACCTACAGGTTCCTTGGCATGTTCCATGTGGCGGACTCTGCTACGGAGACGGAAATTTGGTATTCATTGCTAACGATGGCATACTGCATTATTACCAGTATACCTCAAAGCATATTACCACGAACACGGATTAATGCAATACGCAAGATCCGTCCTCGTCATTCACAACATCGCTCATCAGGGACGTGGCCCTGTAGACGACTTCTCCTACACCGATCTACCCCACAACTACTTAAACCTCTTCAAATGTACGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

302 aa · TkA02G499600|TK1151|PROTEIN

MATYRFLGMFHVADSATETEIWYSLLTMAYCIITSIPQSILPRTRINAIRKIRPRHSQHRSSGTWPCRRLLLHRSTPQLLKPLQMYDPIGGEHFNIFAAGLKNRVPDNHSKPRIHMGAKNSGRRPRPPPHHQLKRLETHRNRQRNRQTGMESRIRRPPNFRQLHQLLHTNPPNPQTPMQIRPPIRTRAARPGRRPGHRVHRSTRQPKGVDLIGEAIPWMVDHDIQIVMLGTGRPELESMLREMETRYRDHVRGWVGFSVK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G499600
TK1151 IDTkA02G499600
OH-1004 IDLXL04_013368
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)53.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 73.841 / OH-1004 30.299
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G499600
位置Chr02:128026277-128027806 (-)
描述Similar to Granule-bound starch synthase 2, chloroplastic/amyloplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g01180 参与叶片直链淀粉中糖链的合成。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0744700 可能有助于叶片叶绿体中瞬时淀粉的沉积。 暂无已核实直接文献
Os10g0437600 可能参与胚乳淀粉体中的淀粉合成，并有助于叶片叶绿体中暂时性淀粉的沉积。
Molecular cloning and expression analysis of three genes encoding starch synthase II in rice.2004 · DOI: 10.1007/s00425-003-1189-y
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013368 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010021 amylopectin biosynthetic process 生物过程
GO:0019252 starch biosynthetic process 生物过程
GO:0009501 amyloplast 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004373 alpha-1,4-glucan glucosyltransferase (UDP-glucose donor) activity 分子功能
GO:0009011 alpha-1,4-glucan glucosyltransferase (ADP-glucose donor) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G01180
dosa:Os10g0437600
sot:102583115
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.538
排名 1 · TkA02G499600 · TK1151
细胞质0.177
排名 2 · TkA02G499600 · TK1151
细胞核0.134
排名 3 · TkA02G499600 · TK1151
质体0.070
排名 4 · TkA02G499600 · TK1151
细胞外0.037
排名 5 · TkA02G499600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20706GT4-conflict163-297 aa
PF00534Glycos_transf_1204-298 aa
PF13692Glyco_trans_1_4205-298 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G499600PF20706GT4-conflict1632970.03813.7
TkA02G499600PF00534Glycos_transf_12042981.9e-0525.0
TkA02G499600PF13692Glyco_trans_1_42052981.6e-0835.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9MAC8拟南芥sp|Q9MAC8|SSY2_ARATH Starch synthase 2, chloroplastic/amyloplastic78.100%Swiss-Prot低置信
Q6Z2T8水稻sp|Q6Z2T8|SSY22_ORYSJ Soluble starch synthase 2-2, chloroplastic/amyloplastic76.000%Swiss-Prot低置信
Q7XE48水稻sp|Q7XE48|SSY21_ORYSJ Soluble starch synthase 2-1, chloroplastic/amyloplastic70.800%Swiss-Prot低置信

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