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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G494420
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 126552899-126564405 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4077 bp · TkA02G494420|TK1151|cDNA

AGAAGCTAACGATTCCTGGAACATCGACACAATTTCTTTTTCCCTCTTCTTATTCGTTGCAAACTAGGGTTCCTTCCCCATCATCGAATTCCTACCCGATGGTTTACGAATTAGGTCACGCACGCGACCAATTCGAGAACAACAACAACGTTGCTATTCAGATAGAAGGGGGTGTGGCGGGTAATTTGCACAAGAAGCGGCGTTCCGGCGTCAATAATGTTAATAAGTTTATCGGTAACGTTGCCAAAAACTATATGGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

3492 bp · TkA02G494420|TK1151|CDS

ATGGTTTACGAATTAGGTCACGCACGCGACCAATTCGAGAACAACAACAACGTTGCTATTCAGATAGAAGGGGGTGTGGCGGGTAATTTGCACAAGAAGCGGCGTTCCGGCGTCAATAATGTTAATAAGTTTATCGGTAACGTTGCCAAAAACTATATGGAGACAACTGTGGGAGAGAATTGGCCATCCGACCTTATCAATCACTTGAACAACCGATTCCCCACTTCCATCGATTCTATAAAGAACTTTATTCAATCAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1163 aa · TkA02G494420|TK1151|PROTEIN

MVYELGHARDQFENNNNVAIQIEGGVAGNLHKKRRSGVNNVNKFIGNVAKNYMETTVGENWPSDLINHLNNRFPTSIDSIKNFIQSNGNLHDIVSNSIPSPHSSLPDLLVSPVLDTSTSTYPENYMNLGYNHYNPASIYNPEFCRGSSFNGDCGGMKLISPLGVKQTEHLDLITSPEQVSSITACSYGDMISDTEAFDSRAFYQLRTQTQPMQTQQQQPQQPQHVILESSNQISSLQVISSYIMYKDMPADLRKEVPFQN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G494420
TK1151 IDTkA02G494420
OH-1004 IDLXL04_013473
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 61.869
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G494420
位置Chr02:126552899-126564405 (-)
描述Similar to HAC1: Histone acetyltransferase HAC1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g16710 乙酰转移酶。 暂无已核实直接文献
At1g79000 乙酰转移酶。 暂无已核实直接文献
At1g55970 乙酰转移酶。 暂无已核实直接文献
At3g12980 乙酰转移酶。 暂无已核实直接文献
At5g16020 对珠孔中花粉管引导必需。
GEX3, expressed in the male gametophyte and in the egg cell of Arabidopsis thaliana, is essential for micropylar pollen tube guidance and plays a role during early embryogenesis.2008 · DOI: 10.1093/mp/ssn015

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0137500 乙酰转移酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013473 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0006473 protein acetylation 生物过程
GO:0009294 DNA-mediated transformation 生物过程
GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0048573 photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0000123 histone acetyltransferase complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005667 transcription regulator complex 细胞组分
GO:0016592 mediator complex 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003713 transcription coactivator activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G16710
ath:AT1G79000
ath:AT3G12980
dosa:Os02g0137500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.725
排名 1 · TkA02G494420 · TK1151
细胞质0.300
排名 2 · TkA02G494420 · TK1151
细胞膜0.043
排名 3 · TkA02G494420 · TK1151
线粒体0.037
排名 4 · TkA02G494420 · TK1151
内质网0.023
排名 5 · TkA02G494420 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00538Linker_histone66-92 aa
PF00538Linker_histone234-244 aa
PF02135zf-TAZ261-295 aa
PF00628PHD452-474 aa
PF00628PHD495-504 aa
PF00628PHD527-567 aa
PF20826PHD_5531-564 aa
PF00569ZZ535-540 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G494420PF00538Linker_histone66920.3511.8
TkA02G494420PF00538Linker_histone2342440.3511.8
TkA02G494420PF02135zf-TAZ2612951e-1042.6
TkA02G494420PF00628PHD4524749.5e-0523.1
TkA02G494420PF00628PHD4955049.5e-0523.1
TkA02G494420PF00628PHD5275679.5e-0523.1
TkA02G494420PF20826PHD_55315640.03614.8
TkA02G494420PF00569ZZ5355400.009216.5
TkA02G494420PF00569ZZ5615690.009216.5
TkA02G494420PF29847KAT36328471e-73249.2
TkA02G494420PF00538Linker_histone7777990.3511.8
TkA02G494420PF00569ZZ8979380.009216.5
TkA02G494420PF00628PHD9119209.5e-0523.1
TkA02G494420PF02135zf-TAZ9169401e-1042.6
TkA02G494420PF02135zf-TAZ101610511e-1042.6
TkA02G494420PF00569ZZ101610510.009216.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FWQ5拟南芥sp|Q9FWQ5|HAC12_ARATH Histone acetyltransferase HAC1250.300%Swiss-Prot高置信
Q9C5X9拟南芥sp|Q9C5X9|HAC1_ARATH Histone acetyltransferase HAC148.500%Swiss-Prot中等置信
Q9LG11拟南芥sp|Q9LG11|HAC4_ARATH Histone acetyltransferase HAC446.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LE42拟南芥sp|Q9LE42|HAC5_ARATH Histone acetyltransferase HAC547.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LFS2拟南芥sp|Q9LFS2|GEX3_ARATH Protein GAMETE EXPRESSED 342.600%Swiss-Prot中等置信
Q6YXY2水稻sp|Q6YXY2|HACL1_ORYSJ Probable histone acetyltransferase HAC-like 147.600%Swiss-Prot中等置信

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